| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 329,174 | A→G | Y163C (TAC→TGC) | betT → | high‑affinity choline transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 329,174 | 0 | A | G | 99.3% | 446.6 / ‑4.7 | 140 | Y163C (TAC→TGC) | betT | high‑affinity choline transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (74/65); total (74/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACT > NC_000913/329085‑329263 | ggCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCtt > 2:2836113/1‑93 (MQ=255)ggCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCtt < 2:4038713/93‑1 (MQ=255)ggCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCtt < 1:1448235/93‑1 (MQ=255)ggCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCtt < 2:1187661/93‑1 (MQ=255) gCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCttt < 1:2449725/93‑1 (MQ=255) cgcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAg > 1:2901119/1‑93 (MQ=255) cgcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAg < 2:2336076/93‑1 (MQ=255) gcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc > 1:1629751/1‑93 (MQ=255) gcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGAATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc > 1:1629750/1‑93 (MQ=255) gagggTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc < 2:1729169/89‑1 (MQ=255) cgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCt < 1:4324629/93‑1 (MQ=255) gcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCtt > 2:4140147/1‑92 (MQ=255) gcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTa < 1:1373422/93‑1 (MQ=255) cgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGGTTTAGCTAt > 2:4076756/1‑93 (MQ=255) gTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATc < 2:2567198/93‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGt < 1:4258409/93‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGt < 2:2512290/93‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGt < 1:1207223/93‑1 (MQ=255) aGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGtt > 1:3518665/1‑93 (MQ=255) ggCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTta < 2:675586/93‑1 (MQ=255) gATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATaa > 1:13239/1‑93 (MQ=255) aTGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAAt < 1:3283026/93‑1 (MQ=255) aTGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAAt < 2:4524537/93‑1 (MQ=255) tGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAAtt > 2:802397/1‑93 (MQ=255) gTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTg > 2:1440702/1‑93 (MQ=255) tGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCg > 2:1131400/1‑93 (MQ=255) ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGc > 1:193231/1‑93 (MQ=255) ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGc < 1:1816157/93‑1 (MQ=255) gACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTTTAATTTTCCGCt > 1:155175/1‑93 (MQ=255) gACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCt < 1:3006290/93‑1 (MQ=255) cGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTACCTATCGTTATAATTTGCCGCTCa > 2:2579048/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCAc > 2:3827195/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCAc > 1:2971600/1‑93 (MQ=255) tGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCa > 1:3546249/1‑93 (MQ=255) gTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCAt < 2:4581325/93‑1 (MQ=255) gTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGAGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCCCCAt > 2:3369881/1‑93 (MQ=255) tttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATc > 1:2511973/1‑93 (MQ=255) ttCCCTACGGCTTAACCGGCTGGTTGATGTATGCCCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATcc < 2:3683563/93‑1 (MQ=255) ttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATcc > 1:3197992/1‑93 (MQ=255) tCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCTGCTCACCATCCg < 1:3781556/93‑1 (MQ=255) ccTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCt < 2:1078125/92‑1 (MQ=255) aCTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCt > 1:4731299/1‑93 (MQ=255) aCTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCt < 2:3453725/93‑1 (MQ=255) cTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTc < 1:2010871/93‑1 (MQ=255) cTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTc < 1:3081317/93‑1 (MQ=255) cTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTc < 1:3317280/93‑1 (MQ=255) tACGGCTTAACGGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCg > 2:2749528/1‑93 (MQ=255) cGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGgc > 1:2095161/1‑93 (MQ=255) cTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCt > 2:248963/1‑93 (MQ=255) ttAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg > 1:778226/1‑93 (MQ=255) ttAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg > 2:2819388/1‑93 (MQ=255) ttAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg < 2:3730711/93‑1 (MQ=255) aaCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTa > 1:2717883/1‑93 (MQ=255) aCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAc > 1:3813882/1‑93 (MQ=255) ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAcc < 1:3814924/93‑1 (MQ=255) cGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAccc < 2:2956951/93‑1 (MQ=255) gCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGa < 2:2182417/93‑1 (MQ=255) tGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATc > 2:3552172/1‑93 (MQ=255) tGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATc > 1:426857/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCt < 2:539593/93‑1 (MQ=255) tCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTc > 2:4428729/1‑93 (MQ=255) tCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTc < 1:1878516/93‑1 (MQ=255) tCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTc < 1:1106549/93‑1 (MQ=255) tCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTc < 2:2183367/93‑1 (MQ=255) gATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCgg < 1:3771938/93‑1 (MQ=255) aTGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGt < 1:4386281/93‑1 (MQ=255) aTGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGt > 2:3920902/1‑93 (MQ=255) gTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTaa > 2:4279434/1‑93 (MQ=255) ttGCGCTGATGGGCATTGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAAc < 2:326184/92‑1 (MQ=255) aTGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAAc < 1:537889/93‑1 (MQ=255) aTGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAAc < 2:326185/93‑1 (MQ=255) gcTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAt > 1:3297648/1‑93 (MQ=255) gcTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAt < 2:3367942/93‑1 (MQ=255) cTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAtt > 1:3436368/1‑93 (MQ=255) gATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTaa < 1:2068372/93‑1 (MQ=255) aTGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAAc < 2:3015471/93‑1 (MQ=255) tGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACg > 1:1813501/1‑93 (MQ=255) gggCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACgg < 1:4025445/93‑1 (MQ=255) gggCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACgg < 1:3834090/93‑1 (MQ=255) gggCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACgg < 2:1987454/93‑1 (MQ=255) gggAATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACgg < 2:1261312/93‑1 (MQ=255) gCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGc < 2:1649097/93‑1 (MQ=255) cATGGCGCTCGGATGCTTCAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGcc > 1:800638/1‑93 (MQ=255) aTGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCg > 1:1035784/1‑93 (MQ=255) tGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGa < 1:628570/93‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGa > 2:3759406/1‑93 (MQ=255) ggCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGAt < 2:2046732/93‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGAt < 2:2046731/93‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGAt < 2:3617790/93‑1 (MQ=255) gcTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAgg > 2:4366213/1‑93 (MQ=255) gcTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAgg > 1:3560700/1‑93 (MQ=255) tgggATACTTTAGTTATCGTTATAATTTGCCTCTCACCATCCGCTCGGCTTTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTc < 2:3055592/91‑1 (MQ=255) tCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTc < 1:817747/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTc > 1:4238976/1‑93 (MQ=255) tCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTc > 2:2857328/1‑93 (MQ=255) cGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCa > 2:1855400/1‑93 (MQ=255) ggATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCAc > 2:2760229/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACt > 1:4646689/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACt > 2:2921136/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGGAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACt > 1:511956/1‑93 (MQ=255) | GGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACT > NC_000913/329085‑329263 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |