| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 347,902 | G→A | intergenic (‑235/‑4) | prpR ← / → prpB | regulator for prp operon/putative phosphonomutase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 347,902 | 0 | G | A | 97.6% | 563.2 / ‑2.2 | 164 | intergenic (‑235/‑4) | prpR/prpB | regulator for prp operon/putative phosphonomutase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (84/76); total (86/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAACGCTAA > NC_000913/347812‑347991 | aaaTTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGc < 2:1546143/93‑1 (MQ=255) aaTTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCt < 2:3529311/93‑1 (MQ=255) ttAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTAt > 1:2171503/1‑93 (MQ=255) ttAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTAt > 2:3831918/1‑93 (MQ=255) tAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAACTAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATg > 1:4489682/1‑93 (MQ=255) tAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATg < 2:501690/93‑1 (MQ=255) tAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATg > 2:4491817/1‑93 (MQ=255) aaaCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGt > 1:533447/1‑93 (MQ=255) aaCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGtc > 2:4534626/1‑93 (MQ=255) aCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGtct > 2:924541/1‑93 (MQ=255) aCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGtct < 2:3034576/93‑1 (MQ=255) aCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGtct < 2:4349869/93‑1 (MQ=255) aCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGtct > 2:580342/1‑93 (MQ=255) aCATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGtct > 2:736051/1‑93 (MQ=255) ttAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTac > 1:1295350/1‑93 (MQ=255) ttAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTac > 2:87222/1‑93 (MQ=255) aTTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACAct > 1:358987/1‑93 (MQ=255) tttATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACActct < 2:584260/93‑1 (MQ=255) ttattaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACtctc < 1:770873/93‑1 (MQ=255) tattaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTcc > 2:306978/1‑93 (MQ=255) tattaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTcc < 2:302452/93‑1 (MQ=255) tattaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGCTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTcc > 2:2279854/1‑93 (MQ=255) attaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCa > 2:4090183/1‑93 (MQ=255) attaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCa < 2:1512999/93‑1 (MQ=255) attaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCa > 1:1032408/1‑93 (MQ=255) ttaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAg < 1:1644331/93‑1 (MQ=255) ttaAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAg > 2:3702528/1‑93 (MQ=255) taAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAgg < 2:4502671/93‑1 (MQ=255) aaGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGt < 1:1764754/93‑1 (MQ=255) aaGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGt > 1:1930793/1‑93 (MQ=255) aGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTa > 2:1254963/1‑93 (MQ=255) ggCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTaa < 1:2353253/93‑1 (MQ=255) gCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTaaa > 2:3094280/1‑93 (MQ=255) gCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTaaa < 1:728880/93‑1 (MQ=255) cAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAg < 1:3031125/93‑1 (MQ=255) aaTTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGc > 2:3581855/1‑93 (MQ=255) ttGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGt > 2:285518/1‑93 (MQ=255) tgtgGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGtt < 1:2169928/93‑1 (MQ=255) tgGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACGCTCTCCAGGTAAAGCGTTTc < 1:3314739/93‑1 (MQ=255) tgGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTc < 1:3974499/93‑1 (MQ=255) ggCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTcg > 2:2047953/1‑93 (MQ=255) gCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTGTCCAGGTAAAGCGTTTcgc < 1:4598074/93‑1 (MQ=255) gCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTcgc < 2:3448161/93‑1 (MQ=255) gCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTcgc < 1:1940497/93‑1 (MQ=255) acacCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCgcgc < 2:2698977/93‑1 (MQ=255) cacCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCt < 2:2384269/93‑1 (MQ=255) acCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTg < 2:3935773/93‑1 (MQ=255) acCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTg > 1:3754893/1‑93 (MQ=255) ccTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGccc > 2:2830804/1‑91 (MQ=255) ccTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCAc > 2:1851699/1‑93 (MQ=255) cTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACt > 1:4676702/1‑93 (MQ=255) ttGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTg < 1:4419415/93‑1 (MQ=255) tGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGa < 2:4683605/93‑1 (MQ=255) tGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGa < 2:1293087/93‑1 (MQ=255) cTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACt < 1:1862116/93‑1 (MQ=255) cTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACt > 2:332036/1‑93 (MQ=255) ttGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTaa < 1:1465697/93‑1 (MQ=255) gTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAg < 1:4052985/93‑1 (MQ=255) gTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAg < 2:468116/93‑1 (MQ=255) gTCTCTATCAACGCAAATAACAAGTGGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAg < 1:4052984/93‑1 (MQ=255) tCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGa > 1:1179894/1‑93 (MQ=255) tCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGa > 1:2393089/1‑93 (MQ=255) cTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGaa < 1:578137/93‑1 (MQ=255) tttATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGaaa < 1:1785434/93‑1 (MQ=255) tttATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGaaa > 1:3026338/1‑93 (MQ=255) tATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAAt > 2:1824852/1‑93 (MQ=255) tCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACATTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATca > 2:3822690/1‑92 (MQ=255) tCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATcc > 2:3822693/1‑93 (MQ=255) tCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATcc < 2:3783375/93‑1 (MQ=255) cAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCa < 2:3355405/93‑1 (MQ=255) aaCGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCAt < 2:3169357/93‑1 (MQ=255) aCGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCAtt > 2:2645528/1‑93 (MQ=255) aCGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCAtt < 1:1513504/93‑1 (MQ=255) aCGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCAtt < 1:3908889/93‑1 (MQ=255) cGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTg > 1:3715587/1‑93 (MQ=255) cAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCa < 2:3983130/93‑1 (MQ=255) aaaTAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGccg > 2:717042/1‑91 (MQ=255) aaaTAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAg < 1:913022/93‑1 (MQ=255) aTAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAt < 1:1228712/93‑1 (MQ=255) aTAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAt > 1:100000/1‑93 (MQ=255) tAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCATAtt > 2:1167612/1‑93 (MQ=255) tAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAtt < 2:4301925/93‑1 (MQ=255) tAACAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAtt < 2:1988535/93‑1 (MQ=255) cAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAttgtt < 1:449000/93‑1 (MQ=255) cAAGTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGAttgtt < 2:1549539/93‑1 (MQ=255) gTTGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGc < 1:2428727/93‑1 (MQ=255) ttGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCa > 1:1997149/1‑93 (MQ=255) ttGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCa < 1:4004450/93‑1 (MQ=255) tGATAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCAc > 1:2716729/1‑93 (MQ=255) tAACAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCAt < 1:3117363/93‑1 (MQ=255) aaCAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATc < 2:3852678/93‑1 (MQ=255) aCAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCa > 2:3874825/1‑93 (MQ=255) cAAAGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCaa > 2:2242765/1‑93 (MQ=255) aaaGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAAc < 1:2820708/93‑1 (MQ=255) aaaGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAAc > 1:3322894/1‑93 (MQ=255) aaaGGATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAAc > 2:4307169/1‑93 (MQ=255) gATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAACGCTa < 1:368179/93‑1 (MQ=255) gATGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAACGCTa > 1:4699160/1‑93 (MQ=255) aTGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAACGCTaa < 2:3501836/93‑1 (MQ=255) aTGAGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAACGCTaa > 1:2557393/1‑93 (MQ=255) | AAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTTGGCACCATCAACGCTAA > NC_000913/347812‑347991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |