| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 367,140 | C→T | A207T (GCC→ACC) | mhpR ← | transcriptional regulator for mhp operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 367,140 | 0 | C | T | 95.2% | 380.4 / NA | 128 | A207T (GCC→ACC) | mhpR | transcriptional regulator for mhp operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); major base T (47/73); minor base G (6/0); total (53/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
TCCGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGCTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTC > NC_000913/367051‑367229 | cGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACa > 2:2623920/1‑93 (MQ=255) cGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTcaca > 1:906301/1‑93 (MQ=255) gTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAt > 2:343043/1‑93 (MQ=255) gTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAAAAt > 2:2187580/1‑93 (MQ=255) tagcccGCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAtt < 1:3014544/90‑1 (MQ=255) tAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAtt > 2:3064591/1‑93 (MQ=255) tAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAtt < 1:2111154/93‑1 (MQ=255) tAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACAtt > 1:599723/1‑93 (MQ=255) aCCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGCGGTTAACATTTc > 2:770009/1‑93 (MQ=255) cccTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCg > 2:4012494/1‑93 (MQ=255) ccTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGGGGGTAACATTTCgt > 2:3439984/1‑92 (MQ=255) ccTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGa > 1:1082145/1‑93 (MQ=255) ccTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGa < 2:881845/93‑1 (MQ=255) ccTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGa < 2:1242316/93‑1 (MQ=255) ctctTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACATTTCGAt > 1:1249296/1‑93 (MQ=255) tctTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGAtt < 1:4613386/93‑1 (MQ=255) tttGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTaa < 2:381921/93‑1 (MQ=255) tttGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGATAACATTTCGATTaa > 1:2588187/1‑93 (MQ=255) ttGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAAt < 1:1276038/93‑1 (MQ=255) tGCGCGCGCGCGCCTGAATGGCTTCCAGCTTCAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGCTAACATTTCGATTAAtt < 1:1587205/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTcc < 2:3912356/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTcc < 1:2849347/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTcc < 2:2555919/93‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGTGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCt < 2:306322/93‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCt < 1:3756740/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCtt < 2:118166/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCtt < 2:3094590/93‑1 (MQ=255) gcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGt < 2:1774745/93‑1 (MQ=255) cgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTc > 1:687820/1‑93 (MQ=255) cgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTc < 1:3896427/93‑1 (MQ=255) cgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTc > 2:2694805/1‑93 (MQ=255) gcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTTCTTGCGGTCt > 2:595579/1‑93 (MQ=255) gcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCt > 1:2407925/1‑93 (MQ=255) gcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCt < 1:3581862/93‑1 (MQ=255) gcCAGAATGGCTTCCAGCTCTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCt < 1:4617081/93‑1 (MQ=255) ccAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCtt < 1:3715042/93‑1 (MQ=255) ccAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCtt < 1:4031248/93‑1 (MQ=255) cAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTg < 2:2691567/93‑1 (MQ=255) aGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGt < 2:1115032/93‑1 (MQ=255) gAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGtt > 2:1799589/1‑93 (MQ=255) gAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACATTTCGATTAATTTCTTGCGGTCTTGtt > 1:966716/1‑93 (MQ=255) tGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCg < 2:88070/93‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGtttcag > 1:4447014/1‑89 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCgg < 2:2929183/93‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCgg > 1:4447013/1‑93 (MQ=255) cTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGc < 1:2147101/93‑1 (MQ=255) ttCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCa > 2:305580/1‑93 (MQ=255) tCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGATGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCaa > 1:2353049/1‑93 (MQ=255) cAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCaaaa < 1:4313842/93‑1 (MQ=255) aGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAg > 2:2340726/1‑93 (MQ=255) gCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGGGGGTAACATTTCGATTTATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAgg > 1:3499648/1‑93 (MQ=255) gCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAgg > 1:763125/1‑93 (MQ=255) gCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAgg < 1:4284247/93‑1 (MQ=255) cTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgc < 2:2221317/93‑1 (MQ=255) tttAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgcc > 2:2019147/1‑93 (MQ=255) ttAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgcca < 1:1004653/93‑1 (MQ=255) tAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccag < 1:3047559/93‑1 (MQ=255) tAACGGTTCCCGTGACAGTTGATAGTCATCCGCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccag < 1:3047558/93‑1 (MQ=255) aaCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagc < 2:247309/93‑1 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc < 2:1678048/93‑1 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc < 2:3998635/93‑1 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc > 2:4051772/1‑93 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc < 2:4181037/93‑1 (MQ=255) aggTTACCGTGCCAGTTGATAATCATCACCGGAACGGGAGGTTAACAATTCAAAAAAATCAATGCAGTCTTGTTCCGGGCAAAAAgaaagcca < 1:3596593/92‑1 (MQ=255) gTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAgg > 1:1791509/1‑93 (MQ=255) ttCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGt < 1:383703/93‑1 (MQ=255) tCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTc < 2:4389286/93‑1 (MQ=255) cccGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCa > 1:2533977/1‑93 (MQ=255) cccGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCa < 2:2231047/93‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAg < 1:4594982/93‑1 (MQ=255) gTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGc > 1:1087225/1‑93 (MQ=255) gTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGc > 1:3990024/1‑93 (MQ=255) tGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGcc > 1:288685/1‑93 (MQ=255) tGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGcc > 2:1127519/1‑93 (MQ=255) ccAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCg > 2:1139081/1‑93 (MQ=255) cAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGa < 2:4002332/93‑1 (MQ=255) cAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCCTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGTCAGCCAGGTCAGGCCCGa > 2:629834/1‑93 (MQ=255) aGTTGATACTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAg > 2:1602649/1‑93 (MQ=255) tGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCg < 1:363626/93‑1 (MQ=255) gATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCgg > 1:4742138/1‑93 (MQ=255) aTAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGt > 2:435179/1‑93 (MQ=255) tAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGtt > 1:3749824/1‑93 (MQ=255) aGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGttt > 1:1483190/1‑93 (MQ=255) gTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGtttt > 1:4615325/1‑93 (MQ=255) tcatcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGACAGCCAAGGCAGGACCGAGGCGGtttta > 2:1863693/1‑92 (MQ=255) catcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCa < 1:3459448/93‑1 (MQ=255) atcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGGCCTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGGTTTCAg > 2:4200443/1‑93 (MQ=255) tcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGa > 2:2114421/1‑93 (MQ=255) caCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGaa < 2:2534126/93‑1 (MQ=255) ccGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAgg > 1:1294456/1‑92 (MQ=255) cGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAGAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCg > 2:2478625/1‑93 (MQ=255) cGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCg > 2:2016049/1‑93 (MQ=255) gggCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGc > 2:3691288/1‑93 (MQ=255) cGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCaaa < 2:4173084/93‑1 (MQ=255) cGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCaaa < 1:3979977/93‑1 (MQ=255) ggAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACg > 2:2155902/1‑93 (MQ=255) gAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGt < 2:3412354/93‑1 (MQ=255) gAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGt < 1:540645/93‑1 (MQ=255) aGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTc < 1:2385658/93‑1 (MQ=255) aGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTc > 2:2718014/1‑93 (MQ=255) | TCCGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGCTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTC > NC_000913/367051‑367229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |