Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,162,333 | A→G | Y553H (TAT→CAT) | parC ← | DNA topoisomerase IV subunit A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,162,333 | 0 | A | G | 98.2% | 339.3 / ‑3.2 | 109 | Y553H (TAT→CAT) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (49/58); total (50/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCA > NC_000913/3162243‑3162422 | aCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGGCCACGAG‑CCGGCGGCAGGCTAATCGGGGTGATGGCATGGCtg > 1:1936748/1‑92 (MQ=255) aCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTa < 2:3817978/93‑1 (MQ=255) cGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTAc < 2:1383398/93‑1 (MQ=255) cGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTAc < 1:3098493/93‑1 (MQ=255) cGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTAc > 1:1868986/1‑93 (MQ=255) cGGTCGCCCCAGGCGGCAACGGTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTAc < 2:1897547/93‑1 (MQ=255) gTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGa > 2:3659418/1‑93 (MQ=255) gcGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGAc < 1:3704034/92‑1 (MQ=255) cGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGAcc > 2:15583/1‑93 (MQ=255) gCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCg > 2:3370200/1‑93 (MQ=255) cccAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGt < 1:3343453/93‑1 (MQ=255) cccAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCggg > 1:3282580/1‑92 (MQ=255) ccAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTg < 2:1820236/93‑1 (MQ=255) cAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTgg > 1:712228/1‑93 (MQ=255) cAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTgg > 1:4326525/1‑93 (MQ=255) cAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCCGCCCACGCG‑CCGGCGGCCGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTGCGACCGgggg > 2:2855709/1‑93 (MQ=255) aGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑GCGACGGCCGCGCAATCGGGTCAATTGCAAGGCGACGACCCGCGGa > 2:2476645/1‑93 (MQ=255) gcAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGAACGGTGGGATcaa > 1:4672211/1‑93 (MQ=255) gcAACGTTAATTTGCCGGGGAGCGGCTCGACCGGGCGAAGAGCCCGGGGGACGCCGAATC‑GGTAAAAAGCATGGCTACGACCGGTGGAATtaa > 2:4721838/1‑93 (MQ=255) cAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCGCGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATcaac < 2:2558480/93‑1 (MQ=255) gaCGTTAATTTGCCTGTTGGCCGCTCGCCGTGGCCAGGCG‑GCGACGAGAACGTGATCGTGTCAAGGGCATTGCTATGACCGGTGGAATcaaca < 2:4021973/92‑1 (MQ=255) aaCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGGTACGACCCGGGGGATcaaca > 2:4288188/1‑93 (MQ=255) aaCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATcaaca > 2:2307358/1‑93 (MQ=255) aCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCCGCGTAATCCGGTCAATGGCATGGCTACGACCCGTGGCATcaacaa > 2:2586507/1‑93 (MQ=255) aCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCCACGGCAGCGCAAATCGGTCAATGGCACGGCTACGACCGGTGGAAGcaacaa > 2:2412555/1‑93 (MQ=255) cGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTTACCACGCG‑CCGACGGCAGCGCAAACGGGTCAATGGCATTGCTTCGACCGGGGGAATCaacaaa > 1:3805415/1‑93 (MQ=255) cGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCCGGGGAATCaacaaa > 2:2214362/1‑93 (MQ=255) ttAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACCACCGGGGGAATCaaacaaca > 1:859231/1‑93 (MQ=255) tAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAacac < 2:1561829/93‑1 (MQ=255) aaTTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACt < 2:1357842/93‑1 (MQ=255) tttGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTAc < 2:2854203/93‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCg < 1:3707439/93‑1 (MQ=255) cGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggtt < 2:3271535/93‑1 (MQ=255) ggTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttg < 1:4210686/93‑1 (MQ=255) ggTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttg < 2:1819733/93‑1 (MQ=255) ggTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttg < 2:4234674/93‑1 (MQ=255) gAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttggtt < 1:181197/93‑1 (MQ=255) gAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCCTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttggtt < 2:1545764/93‑1 (MQ=255) aGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGgttggttg < 1:3610829/93‑1 (MQ=255) aGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGgttggttg < 1:2137944/93‑1 (MQ=255) gCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGAATCAAAAAACACTACCCGTTGGTTGc > 1:3482436/1‑93 (MQ=255) gCGGCTCACCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGc > 2:1071317/1‑93 (MQ=255) cGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGct < 2:2463704/93‑1 (MQ=255) gCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGctct < 2:4355385/93‑1 (MQ=255) gCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGctct < 1:2650167/93‑1 (MQ=255) gCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGctct < 2:1389769/93‑1 (MQ=255) tCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTa > 2:1990450/1‑93 (MQ=255) cGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTAc > 2:4407264/1‑93 (MQ=255) gCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTAcc < 2:453800/93‑1 (MQ=255) gCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTAcc > 2:2387392/1‑93 (MQ=255) cccTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCt > 1:2212616/1‑93 (MQ=255) cccTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCt > 2:1465905/1‑93 (MQ=255) ccTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCtt > 1:227049/1‑93 (MQ=255) tGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTc > 1:1132629/1‑93 (MQ=255) tGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTc < 2:264878/93‑1 (MQ=255) gACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTcc > 1:1526606/1‑92 (MQ=255) cACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccg > 2:4435116/1‑93 (MQ=255) aCGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccgc > 2:3449296/1‑93 (MQ=255) aCGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccgc > 1:3246842/1‑93 (MQ=255) aCGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccgc > 2:2853370/1‑93 (MQ=255) cgcg‑CCGACGGCAGCGAAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccgcc < 1:4216202/93‑1 (MQ=255) gcg‑cCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccgccg < 1:4021016/93‑1 (MQ=255) cg‑cCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACcgccgc < 1:760909/93‑1 (MQ=255) cg‑cCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACcgccgc < 1:4328068/93‑1 (MQ=255) g‑cCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCt > 1:2365547/1‑93 (MQ=255) g‑cCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCt < 1:1438910/93‑1 (MQ=255) ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt < 1:2899752/93‑1 (MQ=255) ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt < 1:1228626/93‑1 (MQ=255) ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt > 1:1316170/1‑93 (MQ=255) ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt > 1:1492924/1‑93 (MQ=255) gACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTg > 2:1071185/1‑93 (MQ=255) gACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTg > 1:45885/1‑93 (MQ=255) aCGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGa > 2:791434/1‑93 (MQ=255) aCGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGa < 1:624499/93‑1 (MQ=255) cGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGaa < 2:4585744/93‑1 (MQ=255) cGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGCTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCGTTGaa > 2:1247155/1‑93 (MQ=255) gCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGc > 1:2653194/1‑93 (MQ=255) gCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGc < 1:2815563/93‑1 (MQ=255) gCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGc < 2:464638/93‑1 (MQ=255) cAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTCTAGCt > 2:2456050/1‑93 (MQ=255) gCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTAt < 1:2199769/93‑1 (MQ=255) cGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATc > 2:2001797/1‑93 (MQ=255) cGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATc < 1:3702023/93‑1 (MQ=255) tAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCAc < 1:168/93‑1 (MQ=255) tAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCAc > 1:226935/1‑93 (MQ=255) aaTCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCAcc < 2:1094142/93‑1 (MQ=255) 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tCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTta < 1:3864566/93‑1 (MQ=255) tCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTta > 2:2202918/1‑93 (MQ=255) ggCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAAtt > 2:197094/1‑93 (MQ=255) cATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCa < 1:3260250/93‑1 (MQ=255) cATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCa < 2:3874447/93‑1 (MQ=255) cATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCa < 2:599155/93‑1 (MQ=255) | CAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCG‑CCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCA > NC_000913/3162243‑3162422 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |