BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,243,762	T→C	V340A (GTT→GCT)	exuT →	ExuT

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	3,243,762	0	T	C	97.1%	424.6 / 1.2	140	V340A (GTT→GCT)	exuT	ExuT
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/3); new base C (68/68); total (69/71)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.20e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01

Only 100 of 149 total aligned reads displayed.

CTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTAT  >  NC_000913/3243670‑3243852

cTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGATGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATAGt                                                                                            >  2:4702574/1‑93 (MQ=255)

  ggATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGctt                                                                                          >  1:4051959/1‑93 (MQ=255)

  ggATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGctt                                                                                          >  1:4514822/1‑93 (MQ=255)

    aTGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTcc                                                                                        <  1:4187558/93‑1 (MQ=255)

    aTGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTcc                                                                                        >  2:2841492/1‑93 (MQ=255)

    aTGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTcc                                                                                        >  1:747330/1‑93 (MQ=255)

     tGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTccc                                                                                       <  1:1636868/93‑1 (MQ=255)

        cGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTa                                                                                    >  1:3353875/1‑93 (MQ=255)

         gATGCTGTTTGCTGCCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATACCTTGCCGTaa                                                                                   >  2:1071253/1‑93 (MQ=255)

         gATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTaa                                                                                   <  2:4203905/93‑1 (MQ=255)

         gATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTaa                                                                                   >  2:760618/1‑93 (MQ=255)

          aTGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAg                                                                                  >  2:673319/1‑93 (MQ=255)

           tGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGa                                                                                 <  2:2652528/93‑1 (MQ=255)

            acTGTTTGCTGACCTCGGGTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGGTTTTCCAGCGTGGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGAt                                                                                <  2:155643/92‑1 (MQ=255)

             cTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATg                                                                               <  2:2859783/93‑1 (MQ=255)

              tGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATgg                                                                              <  1:435984/93‑1 (MQ=255)

               gTTTGCTGCCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGt                                                                             <  2:1310370/93‑1 (MQ=255)

               gTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCGGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGt                                                                             <  2:1310369/93‑1 (MQ=255)

                tttGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTc                                                                            >  2:1872980/1‑93 (MQ=255)

                 ttGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCg                                                                           <  1:4557392/93‑1 (MQ=255)

                 ttGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCg                                                                           <  2:1097754/93‑1 (MQ=255)

                   gCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTa                                                                         <  1:165827/93‑1 (MQ=255)

                   gCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTa                                                                         >  2:1125041/1‑93 (MQ=255)

                    cTGACCTCTGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTaa                                                                        <  1:2965956/93‑1 (MQ=255)

                     tGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAAc                                                                       <  1:2407171/93‑1 (MQ=255)

                     tGACCTCGGTTGTACCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAAc                                                                       <  2:3666899/93‑1 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                     >  1:2909742/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                     >  1:1683649/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                     >  1:1595901/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                     >  1:1356805/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGGCGTACCGc                                                                     >  1:1595900/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGGGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                     <  1:1115548/93‑1 (MQ=255)

                        ccTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCt                                                                    >  1:766221/1‑93 (MQ=255)

                        ccTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCt                                                                    <  2:665759/93‑1 (MQ=255)

                         cTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTg                                                                   <  2:3483492/93‑1 (MQ=255)

                            ggTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGt                                                                <  2:3515598/93‑1 (MQ=255)

                             gTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg                                                               >  2:4229743/1‑93 (MQ=255)

                              ttGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGc                                                              <  1:1280855/93‑1 (MQ=255)

                               tGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa                                                             <  2:1203513/93‑1 (MQ=255)

                               tGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa                                                             <  2:494968/93‑1 (MQ=255)

                                gTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAg                                                            <  2:3252054/93‑1 (MQ=255)

                                 tATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGt                                                           >  2:3716860/1‑93 (MQ=255)

                                  aTCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTg                                                          >  1:1977293/1‑93 (MQ=255)

                                  aTCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTg                                                          >  2:1789290/1‑93 (MQ=255)

                                    ccTCGGTGGTTTCCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCt                                                        <  1:426092/93‑1 (MQ=255)

                                    ccTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCt                                                        >  1:1540933/1‑93 (MQ=255)

                                     cTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtg                                                       <  2:116321/93‑1 (MQ=255)

                                      tCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtga                                                      <  1:3718753/93‑1 (MQ=255)

                                      tCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtga                                                      >  2:4616281/1‑93 (MQ=255)

                                         gtggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgatga                                                   <  2:2220244/93‑1 (MQ=255)

                                          tggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTgatgat                                                  >  1:4191143/1‑93 (MQ=255)

                                           ggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGAtt                                                 <  1:4042533/93‑1 (MQ=255)

                                           ggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGAtt                                                 <  1:817815/93‑1 (MQ=255)

                                            gtTGCCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTTTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTg                                                <  1:360800/93‑1 (MQ=255)

                                            gtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTg                                                >  1:3342536/1‑93 (MQ=255)

                                             ttACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTgg                                               <  2:863669/93‑1 (MQ=255)

                                               tccTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGcc                                             <  1:3812615/92‑1 (MQ=255)

                                                 cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                           >  1:2477573/1‑93 (MQ=255)

                                                 cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGGTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                           >  2:3240030/1‑93 (MQ=255)

                                                   gccgccGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCggg                                         <  2:590479/93‑1 (MQ=255)

                                                   gccgccGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCggg                                         <  2:1030306/93‑1 (MQ=255)

                                                    ccgccgCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGt                                        >  1:3071804/1‑93 (MQ=255)

                                                     cgccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTa                                       <  1:911231/93‑1 (MQ=255)

                                                      gccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTAt                                      >  1:4151711/1‑93 (MQ=255)

                                                         gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                   >  1:3442560/1‑93 (MQ=255)

                                                         gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                   >  2:4473988/1‑93 (MQ=255)

                                                         gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                   <  1:1183027/93‑1 (MQ=255)

                                                         ccTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGCCGCAGTGCTTATGATTGGCCCGGGTATGAt                                   <  1:984551/92‑1 (MQ=255)

                                                          cTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATc                                  <  2:1761485/93‑1 (MQ=255)

                                                           tGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCg                                 >  2:500286/1‑93 (MQ=255)

                                                            gTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCgg                                <  1:3875725/93‑1 (MQ=255)

                                                            gTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGCATGATCgg                                >  1:1006637/1‑93 (MQ=255)

                                                              tctaGCGTTTGGTTTGTGTGAACCTGATTGCTTCCCGTAAGATGGTCGTACCGCGGATTGCGGTGCTGATGATTGTGCCGGGTATGATCGGcc                              <  2:3649578/90‑1 (MQ=255)

                                                              tCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGcc                              >  2:2708265/1‑93 (MQ=255)

                                                              tCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGcc                              <  2:3585079/93‑1 (MQ=255)

                                                               ccAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCt                             >  1:2093164/1‑93 (MQ=255)

                                                                cAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTg                            >  2:4691388/1‑93 (MQ=255)

                                                                  gCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGtt                          >  1:686717/1‑93 (MQ=255)

                                                                    gTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCa                        >  2:4165805/1‑93 (MQ=255)

                                                                    gTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCa                        >  1:1043723/1‑93 (MQ=255)

                                                                     ttggtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCAc                       <  2:575792/93‑1 (MQ=255)

                                                                         tttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCCCCAAc                   >  1:1341139/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAcc                  <  1:2570738/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAcc                  <  1:3451096/93‑1 (MQ=255)

                                                                              tgtgAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTa              <  1:1172974/93‑1 (MQ=255)

                                                                              tgtgAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTa              <  1:4702092/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 gAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGt           <  1:4695195/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 gAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGt           <  2:3584488/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  aaCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCGGTATGTc          >  2:3467245/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  aaCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTc          <  2:2977368/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   aCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCg         >  2:3337426/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    ccTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGc        >  1:1569852/1‑93 (MQ=255)

                                                                                     cTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCa       >  2:2975854/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCaa      >  1:631486/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCaa      <  1:4364959/93‑1 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCTTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt    >  1:838023/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt    >  2:108439/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt    >  2:2004754/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt    >  1:2321830/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt    >  1:1410040/1‑93 (MQ=255)

CTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTAT  >  NC_000913/3243670‑3243852

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 18 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`