| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 419,767 | T→C | V318A (GTG→GCG) | brnQ → | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 419,767 | 0 | T | C | 97.6% | 384.9 / ‑0.8 | 126 | V318A (GTG→GCG) | brnQ | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base C (75/48); total (75/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.40e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATT > NC_000913/419677‑419855 | tCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGgcgt < 1:3509354/93‑1 (MQ=255) cATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGtt < 2:425358/93‑1 (MQ=255) aTCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGttt > 1:4743132/1‑93 (MQ=255) tCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTa < 1:3562293/93‑1 (MQ=255) tCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTa < 2:2039023/93‑1 (MQ=255) tCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTa < 2:2735188/93‑1 (MQ=255) gcctgcctGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATc > 2:3925977/1‑93 (MQ=255) gcctgcctGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATc > 2:709163/1‑93 (MQ=255) cctgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATcc < 2:4739573/93‑1 (MQ=255) ctgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCt < 2:1459308/93‑1 (MQ=255) ctgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCt < 2:2663339/93‑1 (MQ=255) ctgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGCTTATCCt > 1:889249/1‑93 (MQ=255) tgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTc > 1:1045379/1‑93 (MQ=255) tgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTc > 1:486809/1‑93 (MQ=255) tgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTc > 1:137778/1‑93 (MQ=255) tgcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTc < 1:155432/93‑1 (MQ=255) gcctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTcg > 1:1642817/1‑93 (MQ=255) cctgGTAACGGCAGTTTGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTcgg > 1:583628/1‑93 (MQ=255) cctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTcgg > 2:583956/1‑93 (MQ=255) ctgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTcggc < 1:4340190/93‑1 (MQ=255) tgGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTcggcg < 2:1523536/93‑1 (MQ=255) gTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCggcggc < 1:384940/93‑1 (MQ=255) aaCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCtt > 1:4078290/1‑93 (MQ=255) aaCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCtt > 1:2136145/1‑93 (MQ=255) aaCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTGGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCtt < 2:2242008/93‑1 (MQ=255) aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTtc > 2:2841086/1‑93 (MQ=255) aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTtc > 1:135266/1‑93 (MQ=255) cGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTtct < 1:2916581/93‑1 (MQ=255) cGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTtca < 1:4665548/93‑2 (MQ=255) gCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCg > 1:1161170/1‑93 (MQ=255) gaGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGa < 2:1498277/92‑1 (MQ=255) aGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGAt > 2:663985/1‑93 (MQ=255) aGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGAt < 2:972143/93‑1 (MQ=255) gTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGAtg < 1:2956980/93‑1 (MQ=255) gCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGAtggtgg > 1:3714992/1‑93 (MQ=255) ccTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATggtggt > 1:2623215/1‑93 (MQ=255) cTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGtt > 1:3943311/1‑93 (MQ=255) tGACGTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGttt > 2:3029314/1‑93 (MQ=255) tGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCTATGGTGGttt > 2:862192/1‑93 (MQ=255) gACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTc > 1:3464469/1‑93 (MQ=255) aCCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTTCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGACGGTGGTTTCt > 1:2931885/1‑93 (MQ=255) aCCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGCTGGTGGTTTCt > 1:1711622/1‑93 (MQ=255) aCCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGgtttt > 2:1974201/1‑91 (MQ=255) ccTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTa > 1:1138311/1‑93 (MQ=255) ccTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTa < 1:1416308/93‑1 (MQ=255) tgtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAc > 1:611491/1‑93 (MQ=255) tgtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAc > 2:3156436/1‑93 (MQ=255) gtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAcc < 1:229087/93‑1 (MQ=255) gtgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAAcc > 1:213169/1‑93 (MQ=255) tgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCAGCGGCTTCTAGATGGTGGTTTCTAACCt < 1:954237/93‑1 (MQ=255) gCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTc > 1:3083896/1‑93 (MQ=255) tgtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGc > 1:4496900/1‑93 (MQ=255) tgtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGc > 1:2606806/1‑93 (MQ=255) tgCAGCATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCtt < 2:4110434/93‑1 (MQ=255) cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTaa < 2:1365956/93‑1 (MQ=255) cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTaa > 2:1036500/1‑93 (MQ=255) cAGAATTCTTTACCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTaa < 2:3567669/93‑1 (MQ=255) aGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAg < 1:1674224/93‑1 (MQ=255) aGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAg > 2:822546/1‑93 (MQ=255) gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTTGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGc < 1:2325929/93‑1 (MQ=255) gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGc < 1:4523248/93‑1 (MQ=255) gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGc > 1:4173781/1‑93 (MQ=255) gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGc > 1:3436537/1‑93 (MQ=255) gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGc > 2:2091261/1‑93 (MQ=255) aaTTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGcc < 1:2338986/93‑1 (MQ=255) atCTGTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTGTCTACCCTCGGCTTAAGCCAg < 2:2394913/92‑1 (MQ=255) tttGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTg > 1:2118288/1‑93 (MQ=255) ttGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGa < 1:2573258/93‑1 (MQ=255) ccAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCa > 2:4438288/1‑93 (MQ=255) aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGa > 2:1810801/1‑93 (MQ=255) aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGa < 1:668757/93‑1 (MQ=255) gtacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGAt < 2:4540666/93‑1 (MQ=255) gtacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGAt > 2:4442824/1‑93 (MQ=255) cgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGAtctc < 1:3602773/93‑1 (MQ=255) gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTcc > 2:2904033/1‑93 (MQ=255) gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTcc > 2:2796648/1‑93 (MQ=255) gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTcc < 2:4326840/93‑1 (MQ=255) gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTcc > 2:4315019/1‑93 (MQ=255) tatcGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCg > 2:3809514/4‑93 (MQ=255) ccGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTa > 1:2884928/1‑93 (MQ=255) ccGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTGCTCGATGGTGGATTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGGTCCAGATCTCCGTa > 2:3652351/1‑93 (MQ=255) cGCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTAc < 2:2511209/93‑1 (MQ=255) gCTCTCTTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTAcc > 2:483732/1‑93 (MQ=255) ctctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCg > 1:1147253/1‑93 (MQ=255) ctctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCg > 2:4407091/1‑93 (MQ=255) tctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCgg > 2:1905923/1‑93 (MQ=255) tctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCgg < 2:843501/93‑1 (MQ=255) tctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCgg > 2:2139290/1‑93 (MQ=255) tctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCgg > 2:295647/1‑93 (MQ=255) ctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGt < 2:3763113/93‑1 (MQ=255) ctctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGt < 2:1001981/93‑1 (MQ=255) tctTATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTg > 1:4414841/1‑93 (MQ=255) ttATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt > 2:4156351/1‑93 (MQ=255) ctATCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTCTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt < 2:3149336/92‑1 (MQ=255) tCGTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGAc > 1:2254216/1‑93 (MQ=255) gTACGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCg > 2:2940234/1‑93 (MQ=255) aCGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCt < 2:3445990/93‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCt > 1:4092746/1‑93 (MQ=255) gCTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGGTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAt > 2:3196902/1‑93 (MQ=255) cTGGCGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAtt > 1:4392111/1‑93 (MQ=255) | TCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATT > NC_000913/419677‑419855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |