Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,913,076 | (G)6→7 | intergenic (‑248/+105) | glmU ← / ← atpC | N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/membrane‑bound ATP synthase, F1 sector, epsilon‑subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,913,070 | 1 | . | G | 96.4% | 975.2 / 25.5 | 306 | intergenic (‑242/+111) | glmU/atpC | N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/membrane‑bound ATP synthase, F1 sector, epsilon‑subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/4); new base G (167/128); total (174/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 |
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
CTTTTGTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑GGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACTG > NC_000913/3912978‑3913156 | ttttGTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑g > 2:1719692/1‑93 (MQ=255) ttGTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑ggg < 1:4385548/93‑1 (MQ=255) tGTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑gggg < 2:2537690/93‑1 (MQ=255) tGTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑gggg < 2:4103500/93‑1 (MQ=255) gTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑ggggg > 1:5080185/1‑93 (MQ=255) gTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑ggggg > 1:2240877/1‑93 (MQ=255) tCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑gggggg < 1:2511334/93‑1 (MQ=255) tCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑gggggg < 1:2456190/93‑1 (MQ=255) cTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑ggggggg < 1:1860159/93‑2 (MQ=255) tGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATAAATAAACAGGAAAACA‑gggggggt < 1:3497074/93‑3 (MQ=255) cAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑GGGGGGgttt < 2:4907271/93‑1 (MQ=255) aGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑GGGGGGgtttt > 1:1631610/1‑92 (MQ=255) aGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑GGGGGGgtttt > 1:4757919/1‑92 (MQ=255) aaaaTTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTtat > 1:5176312/1‑93 (MQ=255) aaaaTTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTtat > 1:4694770/1‑93 (MQ=255) aaaTTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTtata > 1:722119/1‑93 (MQ=255) aaaTTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTtata < 2:2074452/93‑1 (MQ=255) aaTTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTatat < 1:6453616/93‑1 (MQ=255) ttAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGCATAAACAGGACAACAGGGGGGGTTTTATATca > 1:6639996/1‑93 (MQ=255) aaGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATcagc > 1:6284693/1‑93 (MQ=255) aGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATcagca > 1:1026256/1‑93 (MQ=255) gCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAgg > 1:5981589/1‑93 (MQ=255) aGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGAt > 2:4146741/1‑93 (MQ=255) aGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGAt > 1:4526755/1‑93 (MQ=255) gTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATc < 2:5061788/93‑1 (MQ=255) tACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCt > 2:654108/1‑93 (MQ=255) aCCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTa > 1:939022/1‑93 (MQ=255) aCCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTa > 2:2119688/1‑93 (MQ=255) ccTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAt < 2:4858567/93‑1 (MQ=255) ccTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAt > 2:4671451/1‑93 (MQ=255) cTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAtg < 2:6186352/93‑1 (MQ=255) cTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAtg > 1:2366690/1‑93 (MQ=255) cTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAtg < 1:382834/93‑1 (MQ=255) cTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAtg > 1:2116017/1‑93 (MQ=255) ttAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATTTCAGCAGGATCTAtgt > 1:6173322/1‑93 (MQ=255) ttAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAtgt > 1:3259111/1‑93 (MQ=255) ttAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAtgt < 2:2872446/93‑1 (MQ=255) aTTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGaa > 2:752807/1‑93 (MQ=255) tttAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAAc > 1:2623405/1‑93 (MQ=255) ttAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACg > 1:2668374/1‑93 (MQ=255) tAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGc > 1:4008966/1‑93 (MQ=255) aGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTa > 2:3705539/1‑93 (MQ=255) aGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAgg > 2:2341805/1‑93 (MQ=255) aGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAgg > 2:6468088/1‑93 (MQ=255) ggTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGa < 2:5718742/93‑1 (MQ=255) gTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGAc > 1:4234819/1‑93 (MQ=255) tGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACg < 2:3846881/93‑1 (MQ=255) tGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACg < 2:6047242/93‑1 (MQ=255) tGGATGTTTTTGCTCTTATCTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACg < 2:4303260/93‑1 (MQ=255) ggATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCCGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACgg > 2:2944209/1‑93 (MQ=255) ggATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACgg > 2:6337556/1‑93 (MQ=255) gATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACggg > 1:3189832/1‑93 (MQ=255) aTGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGt < 1:1705593/93‑1 (MQ=255) tGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTc > 2:3316716/1‑93 (MQ=255) tGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTc > 2:1181192/1‑93 (MQ=255) tttttGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTcac > 1:1113068/1‑93 (MQ=255) tttttGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTcac > 2:1584467/1‑93 (MQ=255) ttttGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTcaca < 1:1775604/93‑1 (MQ=255) ctctTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACgcgc > 2:2438055/1‑93 (MQ=255) ctctTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTCATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACgcgc > 1:4150152/1‑93 (MQ=255) tctTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCa > 2:3920666/1‑93 (MQ=255) ctTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaa > 1:3299878/1‑93 (MQ=255) ttATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaa > 2:1090154/1‑93 (MQ=255) tATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaa < 2:314888/93‑1 (MQ=255) ttCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaa < 1:6537900/93‑1 (MQ=255) tCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaaa < 1:5675074/93‑1 (MQ=255) tCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaaa < 1:5416490/93‑1 (MQ=255) tCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaaa < 1:494978/93‑1 (MQ=255) tCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaaa > 1:482387/1‑93 (MQ=255) tCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaaa > 2:275764/1‑93 (MQ=255) tCGATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCaaaaaaaa > 2:5263649/1‑93 (MQ=255) gATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAagc > 1:128768/1‑93 (MQ=255) gATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGACACACGCGCAAAAAAAagc > 2:435289/1‑93 (MQ=255) gATCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTAAGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAagc < 1:2002868/93‑1 (MQ=255) tCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAagcca < 2:3057091/93‑1 (MQ=255) tCAATGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAagcca < 2:5840315/93‑1 (MQ=255) aTGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAagccagcc < 1:975522/93‑1 (MQ=255) aTGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAagccagcc > 2:1512035/1‑93 (MQ=255) tGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCt > 2:675177/1‑93 (MQ=255) tGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCt < 2:2787417/93‑1 (MQ=255) tGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCt > 2:2213158/1‑93 (MQ=255) tGAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCt > 2:35420/1‑93 (MQ=255) ggAATAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCt < 2:3488561/92‑1 (MQ=255) aaTAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGt < 1:1527444/93‑1 (MQ=255) aaTAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATACCAGCAGGATCTATGTGAACCCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGt < 2:3378078/93‑1 (MQ=255) aTAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGtt > 2:4472169/1‑93 (MQ=255) tAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGttt > 1:50347/1‑93 (MQ=255) tAAACAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGttt > 2:1846828/1‑93 (MQ=255) aaaCAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTc < 1:5603095/93‑1 (MQ=255) aaaCAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCCATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTc < 1:3408878/93‑1 (MQ=255) aaCAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTcc > 2:4749142/1‑93 (MQ=255) aCAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCa < 2:841374/93‑1 (MQ=255) aCAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCa > 1:2801335/1‑93 (MQ=255) cAGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAg > 2:4526340/1‑93 (MQ=255) aGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGa > 2:6006476/1‑93 (MQ=255) aGGAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGa > 2:3790424/1‑93 (MQ=255) ggAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTGCAGAc > 1:2087415/1‑93 (MQ=255) ggAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGAc > 2:1610583/1‑93 (MQ=255) agAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGAc < 2:5506279/92‑1 (MQ=255) gAAAACAGGGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACt < 1:5900947/93‑1 (MQ=255) | CTTTTGTCTGCAGAAAATTAAGGCAGTACCTTAATTTAAGCGTCAGGTGGATGTTTTTGCTCTTATTTCGATCAATGAATAAACAGGAAAACA‑GGGGGGTTTTATATCAGCAGGATCTATGTGAACGCTATTCAGGACGGGTCACACGCGCAAAAAAAAGCCAGCCTGTTTCCAGACTG > NC_000913/3912978‑3913156 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |