| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,099,309 | (G)7→8 | coding (48/993 nt) | kdgT → | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,099,302 | 1 | . | G | 98.8% | 514.2 / ‑0.8 | 162 | coding (41/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (90/69); total (91/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCA > NC_000913/4099211‑4099388 | cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑g > 2:5254041/1‑93 (MQ=255)cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑g < 2:250183/93‑1 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggg > 1:4820650/1‑93 (MQ=255) cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggg < 1:1884937/93‑1 (MQ=255) cTCCATTGAGAAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggg < 1:3231751/93‑1 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑gggggggg > 2:1828789/1‑92 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggat > 1:4626926/1‑90 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggat < 1:2129964/93‑4 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggat > 1:3161850/1‑90 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggag > 2:4128476/1‑90 (MQ=255) aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑ggggggggatg > 2:933967/1‑89 (MQ=255) aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGc > 2:6537205/1‑93 (MQ=255) ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCt > 2:3597313/1‑93 (MQ=255) aaTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCg > 2:5037966/1‑93 (MQ=255) aaTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCg > 2:6150063/1‑93 (MQ=255) aCGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGAGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTccc > 1:2855736/1‑93 (MQ=255) cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCt > 1:2266809/1‑93 (MQ=255) cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCt > 2:1123147/1‑93 (MQ=255) cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGAAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAACCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCt < 1:6303926/93‑1 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt < 2:1814545/93‑1 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt < 1:6729152/93‑1 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt > 1:2070197/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTAAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt < 1:4004418/93‑1 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt > 2:4289562/1‑93 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt > 2:4183579/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTc < 2:3067205/93‑1 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:5750445/1‑93 (MQ=255) cccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCt < 2:841052/93‑1 (MQ=255) cccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCt > 2:2689279/1‑93 (MQ=255) ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCtt > 1:1298126/1‑93 (MQ=255) ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCtt > 2:2134081/1‑93 (MQ=255) ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCtt < 2:4029566/93‑1 (MQ=255) cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg < 1:5145517/93‑1 (MQ=255) cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:2580582/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg > 2:5394192/1‑93 (MQ=255) aaaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg > 1:5732501/1‑93 (MQ=255) aaaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg > 2:1187064/1‑93 (MQ=255) aaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgcc > 1:4776327/1‑92 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc > 2:2901700/1‑93 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCAGCTATTCCTTGGCGAAc > 1:5339899/1‑93 (MQ=255) atatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt < 2:5127127/93‑1 (MQ=255) tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtg > 1:3710546/1‑93 (MQ=255) atGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgt > 2:2715248/1‑93 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGcc > 1:6602569/1‑93 (MQ=255) cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca > 2:6366278/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAACCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca < 2:4912911/93‑1 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca > 2:462588/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 2:3657601/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 2:2612350/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTAGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt < 1:4213192/93‑1 (MQ=255) gTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCtt < 1:4235359/93‑1 (MQ=255) tGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtc < 1:6159860/93‑1 (MQ=255) gATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtct < 1:4515300/93‑1 (MQ=255) gATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtct > 1:3124642/1‑93 (MQ=255) gATGAAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtct < 1:5038252/93‑1 (MQ=255) aTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc > 2:5453414/1‑93 (MQ=255) aTGAAAATTCAGAAAAACCTCTTGATTGAAAATACCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc < 2:3693471/93‑1 (MQ=255) ggAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGc > 1:3724110/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACTCCTTCTCGCCg > 2:6037240/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCg > 2:2217807/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCg < 2:1016664/93‑1 (MQ=255) aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 2:497026/1‑93 (MQ=255) tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg > 2:4564935/1‑93 (MQ=255) aGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCg > 1:3505615/1‑93 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg < 1:1771941/93‑1 (MQ=255) aaaaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg < 1:4975390/92‑1 (MQ=255) aaaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa < 1:3956303/93‑1 (MQ=255) aaaaCGCTCAATTGAGAAAACCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGa < 1:1597276/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaa > 2:5866952/1‑93 (MQ=255) aaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 1:5245942/1‑93 (MQ=255) aaCGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 2:6092440/1‑93 (MQ=255) cGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 1:4906527/1‑93 (MQ=255) cGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata < 2:1514463/93‑1 (MQ=255) cGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 2:5581841/1‑93 (MQ=255) cGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata < 1:3882703/93‑1 (MQ=255) cGCTCGATTGAGAAAATCCCAGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAat < 1:6430322/93‑1 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAATGttt > 1:5708450/1‑93 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAATAttt > 1:1184119/1‑93 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAttt < 2:6628267/93‑1 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAttt < 2:2744896/93‑1 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAttt < 1:5448500/93‑1 (MQ=255) cGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACCCCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtttt < 2:6722386/93‑1 (MQ=255) gATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGCAATATTTTg > 1:364619/1‑93 (MQ=255) agtGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg > 1:4449829/3‑93 (MQ=255) aTTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg > 2:6463592/1‑93 (MQ=255) aTTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTgg > 1:3833042/1‑93 (MQ=255) ttGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 2:5236234/93‑1 (MQ=255) ttGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa > 1:2913348/1‑93 (MQ=255) ttGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 2:1899270/93‑1 (MQ=255) ttGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa > 2:4888009/1‑93 (MQ=255) gaaaaaaaCCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt < 1:4672527/89‑1 (MQ=255) gagaAAATCCCG‑GGGGGGGCTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTCGAta > 2:1995809/1‑92 (MQ=255) gagaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATc < 2:5344789/93‑1 (MQ=255) gagaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATc < 2:4470707/93‑1 (MQ=255) agaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCa < 2:6211255/93‑1 (MQ=255) agaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCa > 1:830885/1‑93 (MQ=255) gaAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAt > 2:4070917/1‑93 (MQ=255) aaaTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTc > 2:4883022/1‑93 (MQ=255) aaaTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTc > 2:3124647/1‑93 (MQ=255) aaTCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCa > 1:5989810/1‑93 (MQ=255) | CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCA > NC_000913/4099211‑4099388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |