| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,315,907 | +A | coding (436/759 nt) | phnK ← | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,315,903 | 1 | . | A | 98.5% | 994.9 / 4.7 | 270 | coding (440/759 nt) | phnK | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base A (147/119); total (149/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCG > NC_000913/4315811‑4315989 | caTCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCg‑g < 2:537269/93‑1 (MQ=255) aTCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑a < 2:6480237/93‑1 (MQ=255) ccAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaa < 1:3205881/93‑1 (MQ=255) aGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaa < 1:584196/93‑2 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaag < 2:6517432/93‑3 (MQ=255) cccGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaagg < 2:3065076/93‑4 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt < 2:2480392/93‑5 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt > 2:2935180/1‑89 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt < 1:4634364/93‑5 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt > 1:4338180/1‑89 (MQ=255) ccgccgGTCGGTGCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTCCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt < 1:1748408/93‑5 (MQ=255) ccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAggtggt < 2:5643834/93‑1 (MQ=255) ccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCATCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAggtggt < 1:5696648/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTc < 2:4582723/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTc < 1:295861/93‑1 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGc < 2:1727594/93‑1 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGc < 2:1527556/93‑1 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGc < 1:6344135/93‑1 (MQ=255) cggtACATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATTCCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCa < 1:6103590/93‑1 (MQ=255) ggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAg > 1:835377/1‑93 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAgg > 1:707559/1‑93 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAgg > 1:1504889/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgt > 2:3579434/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGGTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGGGGTCGGCAggc > 2:1263832/1‑92 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcg < 1:4090630/93‑1 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgt < 1:6308189/93‑1 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgt > 2:4971207/1‑93 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtc > 1:3601853/1‑93 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtc > 1:989310/1‑93 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtc > 1:3706205/1‑93 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa > 1:2836714/1‑93 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa > 1:656744/1‑93 (MQ=255) aTAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGAt > 2:1672175/1‑93 (MQ=255) tAAACACCAGCTTTGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc < 2:3798348/93‑1 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc > 1:2283177/1‑93 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc < 1:1772851/93‑1 (MQ=255) aaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCg < 1:4811074/93‑1 (MQ=255) acacCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCgg < 1:1932687/93‑1 (MQ=255) cacCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGt > 1:5231605/1‑93 (MQ=255) cacCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGt < 2:225594/93‑1 (MQ=255) acCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGAA‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt < 1:4545207/93‑1 (MQ=255) acCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt < 1:6453057/93‑1 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg < 2:3444856/93‑1 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg > 2:3259392/1‑93 (MQ=255) cTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCgg > 2:806960/1‑93 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg < 1:4933891/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGa > 2:3983061/1‑93 (MQ=255) cGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGaa < 2:5162752/93‑1 (MQ=255) cGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGaa < 1:3936065/93‑1 (MQ=255) ggATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAt < 2:5260957/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 2:6182487/1‑93 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc < 1:3857473/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc < 1:2665415/93‑1 (MQ=255) aTGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtct > 2:2579941/1‑93 (MQ=255) gCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTcc > 2:1827426/1‑93 (MQ=255) gTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAc < 1:4163760/93‑1 (MQ=255) gTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAc < 1:2768902/93‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc < 1:5979926/93‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 2:5839828/93‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 2:1788475/93‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTc > 1:1335924/1‑93 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTc < 1:3157159/93‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTc > 1:3302884/1‑93 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACATCTTc > 2:613158/1‑93 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc < 1:3018015/93‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGTCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 2:1311372/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa < 2:2029790/93‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa < 1:3404070/93‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa < 2:4929089/93‑1 (MQ=255) ttGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAg < 1:5348582/93‑1 (MQ=255) tGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGc < 2:661806/93‑1 (MQ=255) tGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGc < 2:5418791/93‑1 (MQ=255) gCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGcc < 1:3539438/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc > 2:6288740/1‑93 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGCCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCATCCAc > 2:1468112/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACt > 2:596410/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACt > 1:221545/1‑93 (MQ=255) gCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACtt > 1:4754377/1‑93 (MQ=255) 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aaaCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGt > 1:6639880/1‑93 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTg > 2:3865090/1‑93 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTg > 2:703523/1‑93 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGAAATCTCCACCTCTTCCAGCGACTTCTGGGCGGTg > 2:4734649/1‑93 (MQ=255) aCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTgg < 2:4202993/93‑1 (MQ=255) aCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTgg < 1:1312336/93‑1 (MQ=255) gctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGa > 1:2156863/1‑93 (MQ=255) gctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGa < 2:3617345/93‑1 (MQ=255) gctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGa < 2:1901380/93‑1 (MQ=255) tgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 2:2825357/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 1:3576745/1‑93 (MQ=255) gcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata > 2:1401501/1‑93 (MQ=255) aTACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc > 1:2540112/1‑93 (MQ=255) aTACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc < 2:2287272/93‑1 (MQ=255) | CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCG > NC_000913/4315811‑4315989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |