| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,896,819 | +C | coding (622/657 nt) | ygcU ← | putative oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 99.6% | 822.8 / ‑4.9 | 252 | A208G (GCA→GGA) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base C (146/105); minor base T (1/0); total (147/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
CCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896727‑2896905 | ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑c < 2:1169732/93‑1 (MQ=255) aGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccg > 2:3724507/1‑91 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccgat > 2:6175835/1‑89 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccgat > 2:4679781/1‑89 (MQ=255) ataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgat < 2:3456399/93‑1 (MQ=255) ataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgat > 1:3568339/1‑93 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatga < 1:3096178/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatga < 2:5239793/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGa < 1:4308104/93‑1 (MQ=255) agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAc > 1:641133/1‑93 (MQ=255) gaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACg > 2:6130576/1‑93 (MQ=255) agagGTGGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGaa < 1:1749096/93‑1 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAAt > 1:28203/1‑93 (MQ=255) agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATg < 2:3155234/93‑1 (MQ=255) agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATg < 1:672257/93‑1 (MQ=255) ggTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGt > 1:2017525/1‑93 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCg < 2:487531/93‑1 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCg > 1:5596459/1‑93 (MQ=255) ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCggg < 1:5097416/93‑1 (MQ=255) tttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGc > 1:470701/1‑93 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGcc > 2:5625589/1‑93 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGcc < 2:5474119/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc < 2:3310507/93‑1 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc < 1:6494883/93‑1 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 2:2871815/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg < 2:170253/93‑1 (MQ=255) ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCcgccgc > 1:2928588/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgc < 2:1054570/93‑1 (MQ=255) tGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgc < 2:6043147/93‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg < 2:398358/93‑1 (MQ=255) aTTTAAATATTTTCATTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 1:1681927/93‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc > 1:4473238/1‑93 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc > 2:4526978/1‑93 (MQ=255) tttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcg > 2:428807/1‑93 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:5563606/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt > 2:4452703/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 1:6115498/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 1:3453598/1‑93 (MQ=255) aGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa < 2:3788920/93‑1 (MQ=255) aTTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACg > 2:165463/1‑93 (MQ=255) aTTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACg < 1:2064287/93‑1 (MQ=255) aTTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACg > 2:5170830/1‑93 (MQ=255) ttttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt > 1:4799609/1‑93 (MQ=255) ttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttt > 2:1805485/1‑93 (MQ=255) tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt < 1:4574700/93‑1 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCGCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 1:2996309/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 2:1764331/93‑1 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa > 1:1059371/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTCGCACGTTTTTaa > 1:541358/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt < 2:2532818/93‑1 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:1188931/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCAGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:1717863/1‑93 (MQ=255) tttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg < 1:4011729/92‑1 (MQ=255) gTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg > 2:5829725/1‑93 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt > 1:806682/1‑93 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt < 2:2077473/93‑1 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt > 1:3319149/1‑93 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt > 2:2448292/1‑93 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg < 2:5021954/93‑1 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 1:5311676/1‑93 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCCCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa < 2:1880573/93‑1 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa < 1:5352063/93‑1 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCATCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa < 2:6508177/93‑1 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc < 1:3776016/93‑1 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 1:3144679/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc < 2:6440224/93‑1 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc < 2:2308269/93‑1 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 2:813355/1‑93 (MQ=255) gTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg > 2:2716479/1‑93 (MQ=255) gTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg > 2:2107753/1‑93 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 1:5784240/93‑1 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg > 2:3039489/1‑93 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACggg > 1:232753/1‑92 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACggg > 2:4236698/1‑92 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGt < 1:1412248/93‑1 (MQ=255) atatAGCACAATGCGCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg < 1:1296094/93‑1 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg > 2:2168333/1‑93 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCGGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc > 2:681592/1‑93 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc < 1:2653793/93‑1 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc < 1:963591/93‑1 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt < 1:164347/93‑1 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt > 2:2011663/1‑93 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 1:6575331/93‑1 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 1:3843286/93‑1 (MQ=255) gCACAACGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGACTGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 1:1844582/93‑1 (MQ=255) cacaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCa > 1:5937337/1‑93 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg > 2:5058135/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 2:4117197/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 1:5200780/1‑93 (MQ=255) cACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 2:3189249/1‑93 (MQ=255) aCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc > 2:474807/1‑93 (MQ=255) ccTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt < 1:1372272/93‑1 (MQ=255) cTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg > 2:5191274/1‑93 (MQ=255) ttCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc < 1:4724685/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt > 2:5542847/1‑93 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt < 2:6245554/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt < 2:3053567/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt < 1:6481908/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGGTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt > 2:3551942/1‑93 (MQ=255) cGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCtt < 2:4222855/93‑1 (MQ=255) | CCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896727‑2896905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |