| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,242 | +C | intergenic (+55/‑342) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 99.2% | 383.9 / ‑3.7 | 122 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (92/29); total (92/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑T‑CC‑T‑CT‑CC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 | cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t > 2:4100522/1‑93 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑c > 1:6607435/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑cc < 2:1410093/93‑1 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccc < 1:3961364/93‑2 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccc < 2:403022/93‑2 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctc < 2:3736663/93‑4 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctc < 1:4417761/93‑4 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctc < 1:5288990/93‑4 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctc < 2:2163502/93‑4 (MQ=255) gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctct < 2:4542486/93‑5 (MQ=255) gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctct < 1:4609848/93‑5 (MQ=255) gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtc‑t‑ccctct > 2:6316815/1‑89 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑cc > 2:1308907/1‑93 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑cc > 1:2755316/1‑93 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑cc > 2:5645685/1‑93 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑ccct < 1:3151159/93‑3 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑ccct < 2:6200756/93‑3 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑ccctt > 2:4457396/1‑90 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑ccctt > 2:1725263/1‑90 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑ccctt > 2:1307114/1‑90 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑cccttc > 1:5783251/1‑89 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTc‑tccc‑t‑ct‑cccttc < 1:2805554/93‑5 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCa > 1:4465698/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCa > 1:878042/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAg < 1:3699143/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAg < 2:1504857/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAg < 1:4241560/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAg > 2:1100382/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAg > 1:5676625/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAg > 2:659367/1‑93 (MQ=255) aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGGCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAggg < 2:1994363/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGga < 2:584104/93‑1 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGgag > 1:3398742/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCGTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGgaga < 2:3598974/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGgaga < 1:2909494/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGgaga > 2:5518236/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGCGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGCGagag > 1:1330769/1‑93 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAgg < 1:3827329/93‑1 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAggg > 1:3374044/1‑93 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAggg < 1:2115585/93‑1 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAggg < 1:1590065/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAATCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGt < 2:333396/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGt < 2:6692431/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGt < 1:2974110/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGt < 1:1762711/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGt < 1:3810919/93‑1 (MQ=255) cagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGgggggc > 2:6408677/1‑91 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCgg < 2:3200479/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCgg > 2:2928638/1‑93 (MQ=255) gcGGGGTGGAAAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCgg < 1:264278/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCggg < 1:6339815/93‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACTCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:4810754/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTg > 1:1731803/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 1:1595291/1‑93 (MQ=255) gTGGATATTTTTTATTCTGCCTACGCCGTGTCCCCTGTCATTAACAGGACCACCTTTTTC‑TCCC‑TCCC‑CC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:5693909/93‑1 (MQ=255) gTGGATATTTTTTAATCTGCCTAAGACGTGTACCCTGTCATTACCATGAGCACCGTTTTCAC‑CC‑T‑CT‑CCATTCCAGGGAGAGGATCGGGGTGa < 1:6720143/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 1:5136167/93‑1 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg < 1:801335/93‑1 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg < 2:1709928/93‑1 (MQ=255) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgggga > 1:1184955/1‑91 (MQ=38) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTa > 2:149957/1‑93 (MQ=38) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTaa > 2:5276041/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCTGGGTGAGGGTAAt > 2:3801810/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 1:5351461/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 2:5893870/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 1:583216/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 2:5793124/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 2:3810148/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 1:6425009/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 1:4042368/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 2:775063/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGGGTAAttttt > 1:1848367/1‑93 (MQ=38) aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCg > 2:316531/1‑93 (MQ=37) aaTCTGCCTAAGCCGAGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑T‑CCTT‑CTCCC‑TTCCAGTGAGAGGGTCGGGGTGAGCGGACTTTTTCg > 1:6025732/1‑93 (MQ=255) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:6659493/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:5776244/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 2:2889618/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACTGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 1:5769990/1‑93 (MQ=37) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 1:2159286/1‑93 (MQ=38) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 2:527874/1‑93 (MQ=38) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 1:2412948/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:357654/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:827343/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTggt > 1:101343/1‑91 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 1:1145900/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTgcc > 1:3081030/1‑93 (MQ=25) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc > 2:5397337/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc > 1:998189/1‑93 (MQ=25) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc > 2:6637073/1‑93 (MQ=37) aTTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 1:2005473/1‑93 (MQ=25) aTTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 2:2146045/1‑93 (MQ=25) aTTAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 1:6195472/1‑93 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTtcccctcccc > 2:866266/1‑93 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCTCAcc > 1:6126184/1‑93 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCatc > 2:3266235/1‑91 (MQ=21) aaCATGAGCACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCccccccccc > 1:3578587/1‑92 (MQ=25) cACCGTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTACCCctct > 1:1018013/1‑93 (MQ=18) gTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcccc > 2:3989758/1‑93 (MQ=18) gTTTTC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcccc > 1:6256232/1‑93 (MQ=18) ttttC‑TCCC‑T‑CTCCC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCa > 1:5065271/1‑93 (MQ=18) | CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTC‑T‑CC‑T‑CT‑CC‑TTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |