| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,247 | +C | intergenic (+60/‑337) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,245 | 1 | . | C | 98.4% | 382.9 / ‑0.7 | 122 | intergenic (+58/‑339) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (92/28); total (92/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.89e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
ATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CC‑T‑CT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGG > NC_000913/3237156‑3237332 | aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cc < 2:3995997/93‑1 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cc > 2:1308907/1‑93 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cc > 1:2755316/1‑93 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cc > 1:266905/1‑93 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTatccc‑t‑ct‑cc > 2:1500556/1‑93 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cc > 2:5645685/1‑93 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑ccc < 1:310649/93‑2 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑ccct < 1:3151159/93‑3 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑ccct < 2:5804743/93‑3 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑ccctt > 2:1725263/1‑90 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cccttc < 1:2805554/93‑5 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctccc‑t‑ct‑cccttc > 1:5783251/1‑89 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCa > 1:4465698/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAg > 2:1100382/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAg > 1:5676625/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAg < 1:3699143/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAg < 2:1504857/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAg > 2:659367/1‑93 (MQ=255) aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGGCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAggg < 2:1994363/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGga > 1:4571731/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGgag > 1:3398742/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCGTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGgaga < 2:3598974/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGgaga < 1:2909494/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGgaga > 2:5518236/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGgaga > 2:3170595/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGgaga < 1:5808139/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGagag > 2:6032213/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGCGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGCGagag > 1:1330769/1‑93 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAgg < 1:3827329/93‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAgg < 1:3926419/93‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAgg > 1:2152978/1‑93 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAggg > 1:3374044/1‑93 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAggg < 1:1590065/93‑1 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAggg < 1:2115585/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 1:1762711/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:6692431/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 1:2974110/93‑1 (MQ=255) cagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGgggggc > 2:6408677/1‑91 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACACGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 2:2138094/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGTAGAGGGTCgg < 1:4073227/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 2:2783692/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 1:6339815/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 1:5708105/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 1:2243353/93‑1 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 1:4310824/93‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACTCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:4810754/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGGGGGTCGGGGTg > 1:1731803/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 1:1595291/1‑93 (MQ=255) gTGGATATTTTTTATTCTGCCTACGCCGTGTCCCCTGTCATTAACAGGACCACCTTTTTCTCCC‑TCCC‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:5693909/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 1:5136167/93‑1 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg < 2:1709928/93‑1 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg < 1:801335/93‑1 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:6676045/1‑93 (MQ=39) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTaa > 2:5276041/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCTGGGTGAGGGTAAt > 2:3801810/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 1:5351461/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTACtt > 2:1322639/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 2:5893870/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 2:5793124/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 2:3810148/1‑93 (MQ=38) tttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 2:5395639/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 1:4042368/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 1:6425009/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGGGTAAttttt > 1:1848367/1‑93 (MQ=38) tAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTc > 2:344955/1‑93 (MQ=38) aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCg > 2:316531/1‑93 (MQ=37) aaTCTGCCTAAGCCGAGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CCTT‑CTCCCTTCCAGTGAGAGGGTCGGGGTGAGCGGACTTTTTCg > 1:6025732/1‑93 (MQ=255) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:5776244/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 2:2889618/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGAGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 2:3007754/1‑93 (MQ=38) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 1:2412948/1‑93 (MQ=37) cGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGc > 1:6129883/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:357654/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:33028/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:827343/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 1:1206374/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTggt > 1:101343/1‑91 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 1:1145900/1‑93 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGCTcc > 1:6309769/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc > 1:998189/1‑93 (MQ=25) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc > 2:5397337/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtccc > 2:467288/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtccc > 1:5999168/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc > 2:6637073/1‑93 (MQ=37) tCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTc > 2:849817/1‑93 (MQ=25) cATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCa > 1:1955588/1‑93 (MQ=25) aTTAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 1:6195472/1‑93 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTtcccctcccc > 2:866266/1‑93 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCatc > 2:3266235/1‑91 (MQ=21) aaCATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCccccccccc > 1:3578587/1‑92 (MQ=25) aCATGAGCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCAccccc > 2:1230092/1‑91 (MQ=21) gCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCCCCCCCAccccc > 1:3775492/1‑91 (MQ=18) gCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCCCCCTAACCctc > 2:6208714/1‑93 (MQ=18) gCACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCctc > 2:6664112/1‑93 (MQ=18) cACCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTACCCctct > 1:1018013/1‑93 (MQ=18) aCCGTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCtctc > 1:837213/1‑93 (MQ=18) gTTTTCTCCC‑T‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcccc > 2:3989758/1‑93 (MQ=18) tctccc‑t‑ctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAAc > 2:5484056/5‑93 (MQ=18) ccc‑t‑ctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCCAACggg > 1:975948/2‑93 (MQ=18) cc‑t‑ctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCACCACAACCCCCTCCCCCAACaggg > 2:495117/1‑93 (MQ=18) | ATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑CC‑T‑CT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGG > NC_000913/3237156‑3237332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |