| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3156257 | 3156259 | 3 | 254 [0] | [0] 256 | yqhG | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 0 (0.000) | 243 (0.960) | 118/178 | 0.5 | 100% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 0 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156170‑3156352 | acagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGc > 2:1665494‑M2/91‑93 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt > 2:4905251‑M2/88‑93 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 2:4160587‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt > 1:6698857‑M2/88‑93 (MQ=255) cggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTa < 1:1880907‑M2/8‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 1:1279570‑M2/9‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 1:3001770‑M2/9‑1 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttcccgccaGGCGGTTAAt > 1:3783368‑M2/84‑93 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 1:4453982‑M2/84‑93 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 1:1258764‑M2/84‑93 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 1:6734815‑M2/84‑93 (MQ=255) agcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGc > 1:1643419‑M2/82‑93 (MQ=255) gcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGcc > 2:2644679‑M2/81‑93 (MQ=255) ttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCt > 2:4334079‑M2/77‑93 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta < 1:2576265‑M2/18‑1 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta > 2:5748926‑M2/76‑93 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta > 1:6250587‑M2/76‑93 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctgaccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat < 2:4942305‑M2/19‑1 (MQ=255) tgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaa > 2:2379484‑M2/73‑93 (MQ=255) tgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaa > 1:4740838‑M2/73‑93 (MQ=255) tgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaa > 1:776285‑M2/73‑93 (MQ=255) gccgaactcttggaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaaa < 1:2334706‑M2/22‑1 (MQ=255) cgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAac < 1:2201690‑M2/24‑1 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 1:2785477‑M2/69‑93 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac < 2:1994853‑M2/27‑1 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac < 2:3608342‑M2/27‑1 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac > 2:6469962‑M2/67‑93 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac > 2:2551888‑M2/67‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 1:1373748‑M2/65‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt < 2:4592064‑M2/29‑1 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 2:6672390‑M2/65‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGACGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 2:1810755‑M2/65‑93 (MQ=255) tcgttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt < 1:2135674‑M2/29‑1 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt > 2:5902555‑M2/64‑93 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt > 1:6082227‑M2/64‑93 (MQ=255) ttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCa < 2:3266300‑M2/32‑1 (MQ=255) tgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCaa > 2:3615547‑M2/61‑93 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa < 1:5171800‑M2/35‑1 (MQ=255) atattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAcgc > 2:6012557‑M2/56‑92 (MQ=255) atattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACgg > 2:1420890‑M2/56‑93 (MQ=255) attgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGcc < 2:3191983‑M2/40‑1 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa < 2:3783963‑M2/45‑1 (MQ=255) gattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataat > 1:443409‑M2/48‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc > 1:4305504‑M2/46‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc > 1:4145764‑M2/46‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc > 1:2067877‑M2/46‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 2:2354173‑M2/48‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc > 1:3316098‑M2/45‑93 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc < 2:6413718‑M2/49‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc < 1:6341575‑M2/49‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc < 2:1740529‑M2/49‑1 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgtgtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCCCCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa < 1:544619‑M2/51‑1 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa < 1:6488943‑M2/51‑1 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt > 1:5817734‑M2/42‑93 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg > 1:1015895‑M2/41‑93 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg < 1:4824921‑M2/53‑1 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg > 2:5041752‑M2/41‑93 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg > 1:2885967‑M2/41‑93 (MQ=255) tgggcgtggacgtgggtggtttccgactctcaccgccaGGCGCTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGGCAATAATCCCGATGaa < 1:3244288‑M2/55‑1 (MQ=255) ggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAg > 2:3100621‑M2/38‑93 (MQ=255) ggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAg < 1:1221311‑M2/56‑1 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa < 2:6149060‑M2/57‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 2:1179076‑M2/59‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata > 2:1018816‑M2/35‑93 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 1:3984146‑M2/59‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 2:2957292‑M2/59‑1 (MQ=255) ggacgtgggtggtttccgactcttaccgctaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGc > 2:3817868‑M2/32‑93 (MQ=255) ggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCGAATAATCCCGATGAAGATATGc < 1:1048626‑M2/62‑1 (MQ=255) gacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCa > 1:6277395‑M2/31‑93 (MQ=255) gacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCa < 1:2678423‑M2/63‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa > 2:4510514‑M2/29‑93 (MQ=255) gtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAt < 1:5568701‑M2/66‑1 (MQ=255) gggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAg > 1:4538766‑M2/26‑93 (MQ=255) gggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAg > 2:3427235‑M2/26‑93 (MQ=255) ggtggtttccgactcttatcgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCCTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGa < 2:6590143‑M2/69‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc < 2:4203078‑M2/71‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc < 1:4115757‑M2/71‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCACGATGAAGATATGCAAATAGAAc > 1:6450050‑M2/23‑93 (MQ=255) 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ctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttat > 1:1139477‑M2/13‑93 (MQ=255) cttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttattt < 2:3959820‑M2/83‑1 (MQ=255) cttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttattt < 1:2028534‑M2/83‑1 (MQ=255) taccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 2:1512679‑M2/85‑1 (MQ=255) taccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 1:5368724‑M2/85‑1 (MQ=255) taccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCAAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 1:1513139‑M2/85‑1 (MQ=255) ccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGa < 1:5688648‑M2/87‑1 (MQ=255) cgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGAc > 1:2280983‑M2/6‑93 (MQ=255) ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACaa < 1:4233486‑M2/90‑1 (MQ=255) aGGCTGTTAATGCCTTCTATAAAACCGCCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc < 1:3739474‑M2/92‑1 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc < 2:778176‑M2/92‑1 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 2:5171924‑M2/2‑93 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc < 1:4963829/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc < 1:6044384/93‑1 (MQ=255) | GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156170‑3156352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |