| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 55,791 | A→G | L440P (CTC→CCC) | imp ← | organic solvent tolerance |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 55,791 | 0 | A | G | 99.6% | 762.7 / ‑5.3 | 236 | L440P (CTC→CCC) | imp | organic solvent tolerance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (132/102); total (133/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TTTCTGGAGTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGGCATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAA > NC_000913/55701‑55880 | tttCTGGAGTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGGGc > 2:6196862/1‑93 (MQ=255)tttCTGGAGTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGGGc < 2:4190612/93‑1 (MQ=255) cTGGAGTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGggcggc < 2:6107588/93‑1 (MQ=255) ggAGTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGGGCGGCaa > 2:4663106/1‑93 (MQ=255) aGTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGGGCGGCAAAt < 2:5610068/93‑1 (MQ=255) gTTATACCAGTCAAGATTGGTTTGCTGATAATGGGTTGCCAGCAACTTCGCTTCGGTATTGATGCTGCCCCAGTTATTAGAGGGCGGCAAAtt > 2:1221964/1‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |