Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 629,933 | T→C | W273R (TGG→CGG) | cstA → | carbon starvation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 629,933 | 0 | T | C | 99.4% | 491.7 / NA | 158 | W273R (TGG→CGG) | cstA | carbon starvation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (65/92); minor base G (1/0); total (66/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629843‑630022 | gACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCgggt > 2:3515651/1‑91 (MQ=255) aCCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTa > 2:4846488/1‑93 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCGGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTTCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTAc > 2:1760635/1‑93 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc < 1:5968596/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc < 2:6600487/93‑1 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc < 2:3637152/93‑1 (MQ=255) ggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgct < 2:4574836/93‑1 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGc > 2:138936/1‑93 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGc < 1:3478048/93‑1 (MQ=255) ccGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTggac > 2:2537055/1‑91 (MQ=255) ccGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGcc > 2:5568402/1‑93 (MQ=255) cGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGGCGGTGCGGGTACTGCTGGccc > 1:623892/1‑93 (MQ=255) cGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGgcc > 1:453339/1‑93 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGGTGGCGGGGCGGTTACTGCTGGcccc > 2:64025/1‑93 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGcccc < 1:4862883/93‑1 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGcccc < 1:5504967/93‑1 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGcccc > 1:6594516/1‑93 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGGTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGGTTTGTTGCGGCGGGGATGCCGGTGCGGTGACTGCTGGcccc > 2:1473222/1‑93 (MQ=255) tACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcg < 1:4908702/93‑1 (MQ=255) tACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAATTCTGGGCCcg > 1:1893432/1‑93 (MQ=255) aCTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgc < 1:695258/93‑1 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCGt > 1:6303640/1‑93 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGt > 1:1036961/1‑93 (MQ=255) tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGa > 2:1574776/1‑93 (MQ=255) taCTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGAc < 2:728742/92‑1 (MQ=255) gACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGAc < 2:5090524/93‑1 (MQ=255) aCTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACt > 2:2265888/1‑93 (MQ=255) cTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTa < 1:3011254/93‑1 (MQ=255) tttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTAc > 2:3138542/1‑93 (MQ=255) tttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTAc < 2:831581/93‑1 (MQ=255) tttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTAc > 2:1548748/1‑93 (MQ=255) tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACct < 2:204248/93‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctc < 1:2790511/93‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctct < 2:4774917/93‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGGCCCGCGTGACTAActct > 1:3778383/1‑93 (MQ=255) ccGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGATTTGTGGCGGGGGCGGCGCCGGGGGGGTTACTGCTGGGCCCGCGAGACTACctct > 1:2851574/1‑93 (MQ=255) cGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctc > 1:3826689/1‑93 (MQ=255) ggCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctct < 2:1553706/93‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctct < 2:2914696/93‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCCGTGCTGCCGGTGCGGATACTGCTGGCCCCGCGTGGCTAActctct > 1:4219335/1‑93 (MQ=255) gTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTAcc > 2:4735806/1‑93 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCt < 1:3777984/93‑1 (MQ=255) cAGTTGACGTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTc < 2:2409478/93‑1 (MQ=255) cAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTc > 2:1604869/1‑93 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGGGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTTCCGGTGCGGTTACTCCTGGCCCCGCGTGCCTACCTCTCCACcctcct > 2:4201451/1‑93 (MQ=255) gTTGACCTAGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCt < 1:2755595/93‑1 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTg > 2:1224111/1‑93 (MQ=255) tGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGa > 2:1629398/1‑93 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaa > 1:4287852/1‑93 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaa > 1:5342682/1‑93 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaa < 2:5416158/93‑1 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaa > 2:6712344/1‑93 (MQ=255) aCCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaa > 1:823454/1‑93 (MQ=255) ccTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaaa < 1:2534506/93‑1 (MQ=255) ccTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaaa > 1:4300004/1‑93 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAt > 2:4026901/1‑93 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAt < 1:4543019/93‑1 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAt > 2:3061456/1‑93 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAt > 1:5064218/1‑93 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc > 2:6045722/1‑93 (MQ=255) ggATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGGCTACCTCTCTACCTTCCTGCAAATCg > 1:1416780/1‑93 (MQ=255) ggATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCg < 1:2998416/93‑1 (MQ=255) gATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg < 1:2092850/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa > 2:6013727/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa > 1:2296694/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCGCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa < 1:2912916/93‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACt > 1:3939592/1‑93 (MQ=255) ggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAt > 2:2770899/1‑93 (MQ=255) ggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAt < 2:4964373/93‑1 (MQ=255) gtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtc > 1:4970696/1‑93 (MQ=255) gggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt > 1:6064343/1‑93 (MQ=255) gggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt < 2:3428546/93‑1 (MQ=255) ttACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCgg < 1:5512148/93‑1 (MQ=255) ttACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCgg > 2:6309681/1‑93 (MQ=255) aCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTc > 1:5583065/1‑93 (MQ=255) aCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTc < 2:3052284/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 2:5929101/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 2:1874021/93‑1 (MQ=255) gTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTgg > 2:450738/1‑93 (MQ=255) tgtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGt < 1:1674884/93‑1 (MQ=255) tgtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGt < 1:4884242/93‑1 (MQ=255) gtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTa < 2:3985460/93‑1 (MQ=255) gtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTa < 1:5866763/93‑1 (MQ=255) ggcggcGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAgg < 2:2178327/93‑1 (MQ=255) ggcggcGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAgg < 1:5778043/93‑1 (MQ=255) gcggcgGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGc > 1:5108169/1‑93 (MQ=255) ggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAt > 1:2360711/1‑93 (MQ=255) ggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAt > 1:6469433/1‑93 (MQ=255) gcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtt < 2:415215/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt < 2:6211964/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt < 2:1369312/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt < 2:2480842/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt < 1:3980958/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt < 1:3136058/93‑1 (MQ=255) tgctgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGa < 2:6483603/93‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTa > 1:3418343/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt < 2:4442995/93‑1 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt > 1:1216389/1‑93 (MQ=255) gtgcGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc > 2:5025665/1‑93 (MQ=255) gtgcGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc < 1:4180126/93‑1 (MQ=255) | CCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629843‑630022 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |