| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 688,367 | T→C | intergenic (‑131/+199) | trs53 ← / ← lnt | IS5 transposase/apolipoprotein N‑acyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 688,367 | 0 | T | C | 99.6% | 825.7 / ‑5.2 | 253 | intergenic (‑131/+199) | trs53/lnt | IS5 transposase/apolipoprotein N‑acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (137/114); total (139/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATAACAAAGCAAT > NC_000913/688277‑688456 | tttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCAc > 2:1781328/1‑93 (MQ=255) tttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCAc > 1:324694/1‑93 (MQ=255) tttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCAc < 2:3274440/93‑1 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCAct > 1:4769233/1‑93 (MQ=255) gTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCtt < 2:5436586/93‑1 (MQ=255) gTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCtt > 2:2256408/1‑93 (MQ=255) gTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCtt > 2:3397174/1‑93 (MQ=255) tttGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCttt < 1:949586/93‑1 (MQ=255) tttGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCttt < 2:2863998/93‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTa > 1:5994562/1‑93 (MQ=255) tGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTa < 2:4307359/93‑1 (MQ=255) ggCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAg > 2:371980/1‑93 (MQ=255) gCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGt < 2:2520124/93‑1 (MQ=255) tAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGc > 2:913244/1‑93 (MQ=255) tAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGc > 2:6035741/1‑93 (MQ=255) tGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTAcc > 1:2601838/1‑93 (MQ=255) gTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCg > 2:6113112/1‑93 (MQ=255) gTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCg > 1:4053488/1‑93 (MQ=255) tAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGc < 1:3432893/93‑1 (MQ=255) tAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGc < 1:5534084/93‑1 (MQ=255) aaaGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCt < 2:5567127/93‑1 (MQ=255) aaGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTg > 1:2917921/1‑93 (MQ=255) aGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTgg > 2:3246992/1‑93 (MQ=255) gATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGa < 2:6686163/93‑1 (MQ=255) gATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCCCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGa < 1:4424201/93‑1 (MQ=255) atatTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGAt > 1:4665961/1‑93 (MQ=255) tatTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGAtt > 2:5244296/1‑93 (MQ=255) tatTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGAtt > 2:1044279/1‑93 (MQ=255) ttGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCTCTGGATTAc < 1:6611599/93‑1 (MQ=255) ttGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTAc < 2:2563177/93‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACt > 1:633631/1‑93 (MQ=255) tGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACt < 2:4498188/93‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACt < 2:2294896/93‑1 (MQ=255) gCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtg < 1:5315472/93‑1 (MQ=255) gCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtg > 1:844423/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtg < 1:1937247/93‑1 (MQ=255) cTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtgt < 1:6445844/93‑1 (MQ=255) tGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtgtg > 2:1446724/1‑93 (MQ=255) tGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACtgtg > 1:3516952/1‑93 (MQ=255) tttttATTGGTTGTTTTTGGGAAATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtgg < 1:4981479/92‑1 (MQ=255) gTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtgg < 1:5470208/93‑1 (MQ=255) gTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtgg > 2:5331029/1‑93 (MQ=255) gTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTgtgg > 1:2159634/1‑93 (MQ=255) ttATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGc < 1:993830/93‑1 (MQ=255) ttATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGc > 2:412079/1‑93 (MQ=255) aTTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCaa > 1:5103222/1‑93 (MQ=255) ttgtttgtTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc > 1:1158610/1‑93 (MQ=255) ttgtttgtTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc < 2:2707781/93‑1 (MQ=255) ttgtttgtTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc < 2:5238731/93‑1 (MQ=255) ttgtttgtTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc > 2:70237/1‑93 (MQ=255) ttgtttgtTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAAc < 1:5853452/93‑1 (MQ=255) gtttgtttTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTa > 1:6224889/1‑93 (MQ=255) ttgtttTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAgg > 1:4747978/1‑93 (MQ=255) gtttTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGtt > 1:140709/1‑93 (MQ=255) gtttTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGtt > 1:2111437/1‑93 (MQ=255) gtttTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGtt > 2:6145600/1‑93 (MQ=255) tttttGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTg > 2:6063124/1‑93 (MQ=255) tttttGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTg < 1:276061/93‑1 (MQ=255) gCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTg > 1:4469897/1‑93 (MQ=255) cGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGa < 2:5633777/93‑1 (MQ=255) cGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGa < 2:125803/93‑1 (MQ=255) cGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGa < 2:4190155/93‑1 (MQ=255) gagaTGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGAt > 1:5685525/1‑93 (MQ=255) gagaTGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGAt > 1:4394839/1‑93 (MQ=255) agaTGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATg > 1:3889425/1‑93 (MQ=255) agaTGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATg > 1:1299263/1‑93 (MQ=255) gaTGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGc < 1:3204411/93‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCt > 2:5013728/1‑93 (MQ=255) cgccgcACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGtt < 1:6704637/93‑1 (MQ=255) ccgcACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTc < 1:1588420/93‑1 (MQ=255) cgcACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCa < 1:120571/93‑1 (MQ=255) cgcACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCa < 1:2832323/93‑1 (MQ=255) gcACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAg < 2:3074280/93‑1 (MQ=255) gcACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAg > 2:466309/1‑93 (MQ=255) cACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAgg > 2:4883554/1‑93 (MQ=255) aCCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAggg < 1:1475934/93‑1 (MQ=255) aCCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAggg < 1:1854074/93‑1 (MQ=255) cATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGtt < 1:2465020/93‑1 (MQ=255) cATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGtt < 1:4145096/93‑1 (MQ=255) cGAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCt < 1:6079099/93‑1 (MQ=255) gAAGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCtt < 1:4856514/93‑1 (MQ=255) aaGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTg < 2:3789424/93‑1 (MQ=255) aaGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTg > 2:4638853/1‑93 (MQ=255) aGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGt > 1:6687808/1‑93 (MQ=255) aGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGt < 2:6636804/93‑1 (MQ=255) aGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGt > 1:5177751/1‑93 (MQ=255) aGCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGt < 1:724306/93‑1 (MQ=255) gCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCATGGTTTGTCTTGta > 1:3732837/1‑93 (MQ=255) gCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGta < 1:2311845/93‑1 (MQ=255) gCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGta < 1:3671489/93‑1 (MQ=255) gCAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGta > 1:4571842/1‑93 (MQ=255) cAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGtat < 1:5963143/93‑1 (MQ=255) cAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGtat < 1:334271/93‑1 (MQ=255) cAAAATTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGtat > 1:4607521/1‑93 (MQ=255) aaaTTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATaa > 2:4384214/1‑93 (MQ=255) aaTTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATAAc < 1:1089954/93‑1 (MQ=255) aTTCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATAACa < 2:3014148/93‑1 (MQ=255) ttCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATAACaa > 1:895524/1‑93 (MQ=255) ttCTTAAAACGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGCTTGCCTTGTATAACaa > 2:5807140/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATAACAAAGCaa < 2:6524185/93‑1 (MQ=255) | CATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGCGAGATGCGCCGCACCATTCCGAAGCAAAATTCTTAAAATGCACTCTTTTAGTGCTACCGCTGGATTACTGTGGTGCAACTAGGTTGTACTGATGCTGTTTCAGGGTTTGCCTTGTATAACAAAGCAAT > NC_000913/688277‑688456 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |