Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,127,778 | C→T | G239G (GGC→GGT) | mviN → | putative virulence factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,127,778 | 0 | C | T | 99.6% | 934.3 / NA | 255 | G239G (GGC→GGT) | mviN | putative virulence factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (112/142); minor base G (1/0); total (113/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCG > NC_000913/1127688‑1127866 | gaagaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGgtgt > 2:5394087/1‑93 (MQ=255) gaagaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGgtgt < 2:5676746/93‑1 (MQ=255) aagaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtc < 2:4760823/93‑1 (MQ=255) agaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtct > 2:362068/1‑93 (MQ=255) agaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtct > 2:3518151/1‑93 (MQ=255) gaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtctc > 2:2800008/1‑93 (MQ=255) gaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtctc > 1:2641664/1‑93 (MQ=255) aTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTctct > 1:967707/1‑93 (MQ=255) cGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCtgt > 1:6008181/1‑93 (MQ=255) cGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCtgt < 1:905360/93‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGa > 2:6629672/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGc > 2:364938/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGcc > 2:6586917/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGcc > 2:5177803/1‑93 (MQ=255) gCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCa > 2:4823145/1‑93 (MQ=255) tGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGa < 1:2625303/93‑1 (MQ=255) tGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGa > 1:2916437/1‑93 (MQ=255) gttCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGAt < 2:6123214/91‑1 (MQ=255) ggTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGAt < 1:5465256/93‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGAtctc < 2:2141923/93‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTcc > 2:3360292/1‑93 (MQ=255) tGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCCATGCGCGTGCTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTCTGAGCCAGATCTCCt > 1:2211984/1‑93 (MQ=255) tGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCt < 2:6467039/93‑1 (MQ=255) gCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCtt < 2:3808329/93‑1 (MQ=255) cgcgCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTaa < 2:5359633/93‑1 (MQ=255) gcgcATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAat > 1:3343582/1‑93 (MQ=255) cgcATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatc < 1:6136829/93‑1 (MQ=255) gcATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatca > 2:2245817/1‑93 (MQ=255) aTTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatcatc > 2:2728148/1‑93 (MQ=255) tAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCaa < 1:1533632/93‑1 (MQ=255) tAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCaa > 1:2374453/1‑93 (MQ=255) aaCTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAac > 2:4327342/1‑93 (MQ=255) cTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAacac < 2:1106259/93‑1 (MQ=255) cTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAacac > 1:1018462/1‑93 (MQ=255) tCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCa > 2:156307/1‑93 (MQ=255) cACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAtt < 1:5146712/93‑1 (MQ=255) cACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAtt > 2:5604981/1‑93 (MQ=255) cACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAtt > 1:6531145/1‑93 (MQ=255) aCGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttt > 1:5613131/1‑93 (MQ=255) cGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAtttt < 1:2336626/93‑1 (MQ=255) gATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttttt > 1:4630642/1‑93 (MQ=255) gATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttttt < 2:1384232/93‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGc < 1:5905099/93‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGc > 1:2242563/1‑93 (MQ=255) gCCTGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGcc < 1:1929707/93‑1 (MQ=255) cGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTc < 1:4215364/93‑1 (MQ=255) cGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTc < 1:3749027/93‑1 (MQ=255) cGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTc < 2:5852894/93‑1 (MQ=255) gAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGt < 1:447344/93‑1 (MQ=255) gAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGt > 2:5257583/1‑93 (MQ=255) gAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGt > 2:1446427/1‑93 (MQ=255) ggCAATCCGCGTGGTGAATCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 1:6715575/92‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 2:3092937/93‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt > 1:1015486/1‑93 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 1:1233337/93‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 1:3608036/93‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt > 2:1811316/1‑93 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 2:1836446/93‑1 (MQ=255) gCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGttt > 1:4863509/1‑93 (MQ=255) gCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGttt > 1:3276851/1‑93 (MQ=255) cAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTc < 2:829706/93‑1 (MQ=255) cAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTc < 2:2062155/93‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCtt < 1:4158077/93‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCtt < 1:6403943/93‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGc < 2:2348729/93‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGc < 2:6157539/93‑1 (MQ=255) gcgTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCtt < 1:807881/93‑1 (MQ=255) cgTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTc < 2:4162110/93‑1 (MQ=255) cgTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTc < 1:2570746/93‑1 (MQ=255) gtggtgAAGCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTcc < 2:1918072/93‑1 (MQ=255) tggtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCg > 1:5189809/1‑93 (MQ=255) ggtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCgg > 1:2701998/1‑93 (MQ=255) ggtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCgg > 2:5024026/1‑93 (MQ=255) gAAACAGATTGGACCGGCCATCCTTGGTGTCCCTGGGACCCAGATCTCCTTAATCATCAACTCCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTc < 1:2514577/93‑1 (MQ=255) aaCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCgg > 1:3923797/1‑93 (MQ=255) aCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgt < 2:1146047/93‑1 (MQ=255) cAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgtg < 1:5024457/93‑1 (MQ=255) cAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgtg < 2:2003717/93‑1 (MQ=255) agagGGCACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgtgt < 1:1513676/93‑1 (MQ=255) aGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgtgt < 2:3966800/93‑1 (MQ=255) aTGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACCCCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCt < 2:1300104/93‑1 (MQ=255) ggACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTgg < 2:5951875/93‑1 (MQ=255) ggACCGGCGATCCTTGGGGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTgg > 2:4505718/1‑93 (MQ=255) aCCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGAt < 2:6216533/93‑1 (MQ=255) gCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAt > 2:4633992/1‑93 (MQ=255) gCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAt > 1:569126/1‑93 (MQ=255) gCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAt > 1:6314935/1‑93 (MQ=255) gCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAt < 1:669033/93‑1 (MQ=255) gCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAt > 1:3190434/1‑93 (MQ=255) cGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAtt < 1:3115148/93‑1 (MQ=255) gATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTa > 1:1836272/1‑93 (MQ=255) aTCCTTGTTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc < 1:1983281/93‑1 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc > 2:3123250/1‑93 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc < 2:2969279/93‑1 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc > 2:5867342/1‑93 (MQ=255) tCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATTATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACg > 1:5629944/1‑93 (MQ=255) tCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACg > 2:1044396/1‑93 (MQ=255) tCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACg < 1:34749/93‑1 (MQ=255) tCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACg < 2:2623700/93‑1 (MQ=255) cTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGcc > 1:2030341/1‑93 (MQ=255) | GAAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCG > NC_000913/1127688‑1127866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |