Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,339,624 | A→G | K348R (AAG→AGG) | yciM → | putative heat shock protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,339,624 | 0 | A | G | 99.6% | 714.8 / ‑4.7 | 222 | K348R (AAG→AGG) | yciM | putative heat shock protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (107/114); total (108/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CCATAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGT > NC_000913/1339535‑1339713 | cATAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTa > 2:5852890/1‑93 (MQ=255) cATAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTa > 1:1517658/1‑93 (MQ=255) aTAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTAc > 2:2559592/1‑93 (MQ=255) tAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACg > 2:6126764/1‑93 (MQ=255) tAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACg > 2:5079376/1‑93 (MQ=255) tAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACg > 2:4339015/1‑93 (MQ=255) aaGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACgt > 1:1154563/1‑93 (MQ=255) aaGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACgt > 1:4248837/1‑93 (MQ=255) aaGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGACGAGAGGGTACgt > 1:5317112/1‑93 (MQ=255) aGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACgta > 1:3583498/1‑93 (MQ=255) ttAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACgtagt < 1:705057/93‑1 (MQ=255) aaTGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTaa > 1:3844600/1‑93 (MQ=255) aaTGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGGGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTaa > 1:958576/1‑93 (MQ=255) tGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGc > 2:3663042/1‑93 (MQ=255) gATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCt < 2:5107948/93‑1 (MQ=255) gATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCt < 1:2936696/93‑1 (MQ=255) gATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCt > 1:3207690/1‑93 (MQ=255) gATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCt > 2:5484852/1‑93 (MQ=255) aTTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTc > 1:2270655/1‑93 (MQ=255) aTTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTc > 2:6552644/1‑93 (MQ=255) aTTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTc < 2:445885/93‑1 (MQ=255) ttACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCg < 1:1938644/93‑1 (MQ=255) ttACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCg < 2:2392200/93‑1 (MQ=255) ttACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGAGTACGTAGTAAGCCTCg > 1:4768313/1‑93 (MQ=255) tACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGt < 1:5841930/93‑1 (MQ=255) aCCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGtt < 2:139124/93‑1 (MQ=255) aCCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGta > 2:3643002/1‑92 (MQ=255) ccACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTa > 1:1749512/1‑93 (MQ=255) ccACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTa > 2:181154/1‑93 (MQ=255) ccACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTa < 1:1424331/93‑1 (MQ=255) cACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTaa < 1:4139943/93‑2 (MQ=255) cACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTAt < 1:2003987/93‑1 (MQ=255) aCTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGGTGCGTGACATGGTTGGGGAGAGGGTACGTAGTAATCCTCGTTATc < 1:2940296/93‑1 (MQ=255) aCTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATc > 2:6634328/1‑93 (MQ=255) aCTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATc > 2:1254940/1‑93 (MQ=255) cTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCg < 2:4590301/93‑1 (MQ=255) cTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCg > 1:6357774/1‑93 (MQ=255) ttAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGt < 1:2066420/93‑1 (MQ=255) aaaTGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTg > 1:489114/1‑93 (MQ=255) aTGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTTGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGcc < 1:6501763/93‑1 (MQ=255) gAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAg > 2:6279922/1‑93 (MQ=255) aGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGaa > 1:779379/1‑93 (MQ=255) gCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGaaa > 2:3889124/1‑93 (MQ=255) gCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGaaa > 1:5980044/1‑93 (MQ=255) gCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGaaa < 1:5519073/93‑1 (MQ=255) gggAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAAt < 2:2895515/92‑1 (MQ=255) cGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAAt > 2:4798309/1‑93 (MQ=255) cGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAAt < 1:4566469/93‑1 (MQ=255) gaagaaGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAAtgt < 2:6581582/93‑1 (MQ=255) gaagaaGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAAtgt > 2:2919619/1‑93 (MQ=255) aagaagGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAAtgtg < 1:6216620/93‑1 (MQ=255) gaagGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGt < 1:5099960/93‑1 (MQ=255) gaagGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGt > 2:4266813/1‑93 (MQ=255) aagGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGtt < 2:3535339/93‑1 (MQ=255) agGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGttt > 2:3969489/1‑93 (MQ=255) agGGAGTGCGATAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGttt < 2:3283909/93‑1 (MQ=255) gggCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGtttt < 1:4714991/93‑1 (MQ=255) gCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc > 2:5726023/1‑93 (MQ=255) ccAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCAt < 1:5683583/93‑1 (MQ=255) cAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATa < 2:5188275/93‑1 (MQ=255) aaaGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATac > 1:2597096/1‑93 (MQ=255) aaGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATaca > 1:1007625/1‑93 (MQ=255) agagagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATacac < 2:5189624/93‑1 (MQ=255) gagagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACAcc > 2:260366/1‑93 (MQ=255) gagagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACAcc < 1:5018587/93‑1 (MQ=255) agagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATAAAccc > 2:5091556/1‑93 (MQ=255) agagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGGACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGGTTTACCGCATACAccc > 1:6458394/1‑93 (MQ=255) gagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCct > 2:1709306/1‑93 (MQ=255) gCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCctct < 2:4833114/93‑1 (MQ=255) ccTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTa < 1:4303153/93‑1 (MQ=255) ccTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTa < 1:4144809/93‑1 (MQ=255) cTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCTTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTAc > 2:5673020/1‑93 (MQ=255) tGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACt < 2:5363292/93‑1 (MQ=255) tGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACt > 1:6157553/1‑93 (MQ=255) tGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACt < 2:6496170/93‑1 (MQ=255) tGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACt > 1:5299074/1‑93 (MQ=255) tGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACAGCATACACCCTCTACt > 1:1254829/1‑93 (MQ=255) tGATGGTGCGGCCTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACt < 2:4179726/93‑1 (MQ=255) gATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACCCCCTCTACTg < 2:6370712/93‑1 (MQ=255) gATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTg < 1:2433495/93‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTAAGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTgg > 1:1877965/1‑93 (MQ=255) tGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGc > 2:336682/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCa < 2:4710246/93‑1 (MQ=255) gctgcGTGACAGGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCGCTACTGGCATTg < 1:353179/93‑1 (MQ=255) ctgcGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGt > 2:1161732/1‑93 (MQ=255) tgcGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTc > 2:6431604/1‑93 (MQ=255) tgcGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTc < 2:2500780/93‑1 (MQ=255) tgcGTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTc < 1:2184622/93‑1 (MQ=255) gTGACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGt > 1:4656443/1‑93 (MQ=255) gACATGGTTGTCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCt < 2:798380/93‑1 (MQ=255) gACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCt < 2:6171664/93‑1 (MQ=255) gACATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCt < 2:1572349/93‑1 (MQ=255) aCATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCtt > 2:4349236/1‑93 (MQ=255) cATGGTTGGCGAGAGGGTACGTCGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTg < 2:1459626/93‑1 (MQ=255) cATGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCTACCACCCTCTCCTGGCATTGTCCGTCTTg > 2:1925247/1‑93 (MQ=255) aTGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGt < 2:4054048/93‑1 (MQ=255) tGGTTGGCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTc < 2:4985518/93‑1 (MQ=255) gCGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCt < 2:682432/93‑1 (MQ=255) cGAGAGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTg < 2:5287700/93‑1 (MQ=255) gagaGGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTgg > 1:6641880/1‑93 (MQ=255) | CCATAAGTTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGT > NC_000913/1339535‑1339713 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |