BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,479,655	T→C	C241C (TGT→TGC)	ynbD →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,479,655	0	T	C	99.5%	614.1 / NA	189	C241C (TGT→TGC)	ynbD	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (94/94); minor base G (0/1); total (94/95)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 189 total aligned reads displayed.

AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479565‑1479744

aGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTg                                                                                         <  1:5208916/93‑1 (MQ=255)

 gCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTgg                                                                                        >  2:527118/1‑93 (MQ=255)

  cACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGc                                                                                       <  2:964088/93‑1 (MQ=255)

  cACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGc                                                                                       >  2:4480208/1‑93 (MQ=255)

   aCTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGcc                                                                                      >  2:4400658/1‑93 (MQ=255)

     tGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAg                                                                                    >  1:5501076/1‑93 (MQ=255)

      gCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGt                                                                                   >  1:4549947/1‑93 (MQ=255)

        ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 <  2:5856076/93‑1 (MQ=255)

         cTATGTCGTCGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTACTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                <  1:6718727/93‑1 (MQ=255)

         cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                <  2:1474112/93‑1 (MQ=255)

         cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                >  2:1346337/1‑93 (MQ=255)

         cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                >  2:4942925/1‑93 (MQ=255)

         cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                >  2:4640126/1‑93 (MQ=255)

          tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  1:384287/93‑1 (MQ=255)

          tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  1:2356002/93‑1 (MQ=255)

          tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               >  2:2661745/1‑93 (MQ=255)

            tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  1:6344543/93‑1 (MQ=255)

            tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  1:2084778/93‑1 (MQ=255)

            tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             >  2:4241603/1‑93 (MQ=255)

             gTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCg                                                                            >  1:4953171/1‑93 (MQ=255)

               cGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCt                                                                          >  2:2458461/1‑93 (MQ=255)

                gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa                                                                         >  2:271805/1‑93 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTat                                                                        >  2:1275175/1‑92 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        <  1:3736440/93‑1 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  2:4743957/1‑93 (MQ=255)

                 gaGGGGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        <  1:3523067/92‑1 (MQ=255)

                  aGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACt                                                                       >  2:5552490/1‑93 (MQ=255)

                  aGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACt                                                                       >  1:119497/1‑93 (MQ=255)

                   ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      >  2:2252624/1‑93 (MQ=255)

                   ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      <  1:1540712/93‑1 (MQ=255)

                       cgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATaa                                                                  <  1:2552147/93‑1 (MQ=255)

                        gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt                                                                 >  1:8465/1‑93 (MQ=255)

                        gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt                                                                 <  2:3094973/93‑1 (MQ=255)

                         ggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAtt                                                                >  2:4686549/1‑93 (MQ=255)

                          gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  1:4745509/93‑1 (MQ=255)

                              gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           >  1:5048500/1‑93 (MQ=255)

                                 cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        >  2:683075/1‑93 (MQ=255)

                                 cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        <  2:430366/93‑1 (MQ=255)

                                 cATTGTATTGATGCAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        <  2:1469891/93‑1 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       <  1:1396312/93‑1 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  2:4794998/1‑93 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  1:3986067/1‑93 (MQ=255)

                                   ttGTATTGATGGGGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGt                                                      >  2:63272/1‑93 (MQ=255)

                                   ttGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGt                                                      >  1:5589034/1‑93 (MQ=255)

                                     gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    >  2:5417352/1‑93 (MQ=255)

                                      tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACg                                                   <  1:193988/93‑1 (MQ=255)

                                      tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGCACg                                                   >  1:6368559/1‑93 (MQ=255)

                                       aTTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACgg                                                  <  2:5067507/93‑1 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 <  2:5640959/93‑1 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 >  1:2651635/1‑93 (MQ=255)

                                          gATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTgg                                               <  1:5793727/93‑1 (MQ=255)

                                           aTGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTggg                                              >  2:1599622/1‑93 (MQ=255)

                                            tGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGc                                             <  1:43879/93‑1 (MQ=255)

                                             ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt                                            >  1:3468761/1‑93 (MQ=255)

                                              gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           <  2:3407176/93‑1 (MQ=255)

                                                gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg                                         <  1:5680748/93‑1 (MQ=255)

                                                  taatgataatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcg                                       >  1:2764301/1‑93 (MQ=255)

                                                  tAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcg                                       >  2:5939024/1‑93 (MQ=255)

                                                  tAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcg                                       >  1:5901855/1‑93 (MQ=255)

                                                   aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc                                      <  1:3444501/93‑1 (MQ=255)

                                                   aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgagc                                      >  1:2700028/1‑93 (MQ=255)

                                                     tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa                                    <  2:4584225/93‑1 (MQ=255)

                                                     tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa                                    >  1:121093/1‑93 (MQ=255)

                                                     tgatgatgaTTCAGTTATGGCGGTCAGTCTGGTTATGCTTGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGcgcgg                                    >  1:2012248/1‑92 (MQ=255)

                                                      gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt                                   <  1:4680725/93‑1 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  <  1:61458/93‑1 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  2:3996502/1‑93 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  <  1:2410073/93‑1 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  2:567805/1‑93 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  1:3740521/1‑93 (MQ=255)

                                                        tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 >  2:6466419/1‑93 (MQ=255)

                                                         gatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaac                                <  2:6617577/93‑1 (MQ=255)

                                                           tgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa                              <  2:5520440/93‑1 (MQ=255)

                                                            gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaac                             <  2:1680257/93‑1 (MQ=255)

                                                            gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACCCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaac                             <  1:3220881/93‑1 (MQ=255)

                                                             atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            >  1:6541850/1‑93 (MQ=255)

                                                              ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg                           >  2:270034/1‑93 (MQ=255)

                                                              ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg                           <  1:1980375/93‑1 (MQ=255)

                                                               tCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg                          >  1:4641961/1‑93 (MQ=255)

                                                                 aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa                        >  2:5014264/1‑93 (MQ=255)

                                                                  gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa                       >  1:5319465/1‑93 (MQ=255)

                                                                     aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa                    <  2:288770/93‑1 (MQ=255)

                                                                      tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   >  2:2379605/1‑93 (MQ=255)

                                                                      tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  2:3686218/93‑1 (MQ=255)

                                                                       ggtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCAATAACAACAGGGAAAGATa                  <  1:6508181/93‑1 (MQ=255)

                                                                         tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                <  1:5726770/93‑1 (MQ=255)

                                                                         tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                >  2:1083271/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  1:1333757/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  2:4104540/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               >  2:123103/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  2:5739320/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               >  1:3299908/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  1:4480208/93‑1 (MQ=255)

                                                                           gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              >  1:4274548/1‑93 (MQ=255)

                                                                             taGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  1:6306220/92‑1 (MQ=255)

                                                                                  tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  2:193343/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  2:893894/1‑93 (MQ=255)

                                                                                   ggTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAAc      <  2:6004227/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     <  2:4904074/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  <  2:1401356/93‑1 (MQ=255)

AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479565‑1479744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 29 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`