Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,664,091 | T→C | S271S (AGT→AGC) | b1592 → | putative chloride channel |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,664,091 | 0 | T | C | 99.5% | 700.1 / ‑4.7 | 213 | S271S (AGT→AGC) | b1592 | putative chloride channel |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (115/97); total (116/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
TGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGTCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTGGGGCAACG > NC_000913/1664001‑1664179 | tGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGcct > 1:1263452/1‑93 (MQ=255) cgcTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCa < 2:3747691/93‑1 (MQ=255) gcTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCaa > 1:3377497/1‑93 (MQ=255) cTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCaaa > 2:5162066/1‑93 (MQ=255) tGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAAc > 2:3534416/1‑93 (MQ=255) tGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAAc > 1:5826857/1‑93 (MQ=255) gATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACt < 2:4126666/93‑1 (MQ=255) gATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACt > 1:6095182/1‑93 (MQ=255) ttATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTg > 2:4530002/1‑93 (MQ=255) ttATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTg < 2:2728943/93‑1 (MQ=255) ttATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTg > 2:6438369/1‑93 (MQ=255) ttATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTg < 1:157166/93‑1 (MQ=255) tATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTgc < 1:6073427/93‑1 (MQ=255) tATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTgc < 1:1738081/93‑1 (MQ=255) tATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTgc > 1:772810/1‑93 (MQ=255) cAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGcgcc < 1:3908941/93‑1 (MQ=255) aCAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGccc < 1:3049180/93‑1 (MQ=255) aCAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGccc < 1:3074535/93‑1 (MQ=255) aCAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGccc > 2:2055614/1‑93 (MQ=255) cAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGGTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCATCAAACTTGCGCCGCCCt > 1:4022153/1‑93 (MQ=255) gtgtGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGc > 1:3242576/1‑93 (MQ=255) tgtgCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCa < 2:242018/93‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCa < 2:2456471/93‑1 (MQ=255) gtgCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCaa < 1:408794/93‑1 (MQ=255) tgCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAAc < 1:6352519/93‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTgg > 2:2361507/1‑93 (MQ=255) tGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTgg > 2:579912/1‑93 (MQ=255) ggCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGc > 1:4307567/1‑93 (MQ=255) ggCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGc > 2:5234593/1‑93 (MQ=255) cAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCAc < 2:3150293/93‑1 (MQ=255) aGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACt < 1:2393194/93‑1 (MQ=255) aGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACt > 2:6700167/1‑93 (MQ=255) ggTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTa > 2:5583935/1‑93 (MQ=255) ggTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTa < 1:2996193/93‑1 (MQ=255) gTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAg < 1:2216376/93‑1 (MQ=255) tCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAgg > 1:5097845/1‑93 (MQ=255) cTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGc < 1:1446094/93‑1 (MQ=255) gtgCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCgg < 1:3063674/93‑1 (MQ=255) gtgCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCgg < 1:2449914/93‑1 (MQ=255) gtgCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCgg > 2:6611004/1‑93 (MQ=255) gCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGt < 2:4678932/93‑1 (MQ=255) gacgacTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGa < 1:2870714/93‑1 (MQ=255) gACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGa > 1:1421409/1‑93 (MQ=255) gACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGa < 2:1263452/93‑1 (MQ=255) aCTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGt > 2:3643695/1‑93 (MQ=255) aCTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGt > 1:810824/1‑93 (MQ=255) cTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTg > 2:1823211/1‑93 (MQ=255) tgttgtTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTgg < 1:4798902/93‑1 (MQ=255) tgttgtTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTgg < 2:4349460/93‑1 (MQ=255) gttgttAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTggg > 2:390161/1‑93 (MQ=255) ttgttAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGt > 2:667141/1‑93 (MQ=255) tgttAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTc < 1:5940076/93‑1 (MQ=255) tAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGc > 1:619193/1‑93 (MQ=255) aaCGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCt > 1:2053192/1‑93 (MQ=255) aCGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCtt > 2:5055591/1‑93 (MQ=255) aCGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCtt < 1:999572/93‑1 (MQ=255) gTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTc > 2:4461119/1‑93 (MQ=255) ttAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTcc > 1:3510367/1‑93 (MQ=255) ttAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTcc > 2:4705482/1‑93 (MQ=255) tAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTccc < 1:4814598/93‑1 (MQ=255) tAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTccc < 1:5176610/93‑1 (MQ=255) tAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTccc < 1:3712692/93‑1 (MQ=255) aaTGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCt < 2:1956985/93‑1 (MQ=255) tGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGt > 1:422283/1‑93 (MQ=255) tGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGt > 2:592897/1‑93 (MQ=255) tGAACGCCTGTCATCGTGAATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGt < 2:4981732/93‑1 (MQ=255) gAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGtt < 1:976324/93‑1 (MQ=255) gAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGtt > 2:6715002/1‑93 (MQ=255) gAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGtt > 1:1978154/1‑93 (MQ=255) aCGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTca > 2:4762545/1‑93 (MQ=255) aCGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTca > 2:4884059/1‑93 (MQ=255) cGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTcac < 2:6236511/93‑1 (MQ=255) cGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTcac > 2:264254/1‑93 (MQ=255) cGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTcac < 2:2078075/93‑1 (MQ=255) ccTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCacac > 1:3634495/1‑93 (MQ=255) cTGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACAcc > 1:4925897/1‑93 (MQ=255) tGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCt < 2:5331600/93‑1 (MQ=255) tGTCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCt > 1:2972738/1‑93 (MQ=255) tCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGc > 2:3413075/1‑93 (MQ=255) tCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGc > 2:3290347/1‑93 (MQ=255) tCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGc < 2:2566016/93‑1 (MQ=255) tCATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGc > 1:109776/1‑93 (MQ=255) cATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCa > 2:5468529/1‑93 (MQ=255) cATCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCa > 2:2095200/1‑93 (MQ=255) aTCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACAGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAg > 2:4697566/1‑93 (MQ=255) tCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAgt < 2:5881751/93‑1 (MQ=255) tCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAgt > 2:896484/1‑93 (MQ=255) tCGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAgt > 1:5202664/1‑93 (MQ=255) cGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAgtg < 2:2072449/93‑1 (MQ=255) cGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAgtg < 1:2166113/93‑1 (MQ=255) cGTGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAgtg < 1:1056864/93‑1 (MQ=255) tGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGtgtg > 2:3451447/1‑93 (MQ=255) tGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGtgtg < 2:1524779/93‑1 (MQ=255) tGGATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGtgtg < 1:2645998/93‑1 (MQ=255) ggATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTgg < 2:5292726/93‑1 (MQ=255) gATTTGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTggg < 2:3261844/93‑1 (MQ=255) tttGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTgggga > 1:1947107/1‑92 (MQ=255) tttGTGAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTACCTGTTCACACCTGCAGTGTGGGGc > 1:2824406/1‑93 (MQ=255) ttgAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTGGGGCAAc < 2:1585191/92‑1 (MQ=255) gtgAGCCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTGGGGCAAc > 2:426617/1‑93 (MQ=255) | TGCGCTGATTATCAGTACAGGTGTGCTGGCAGGTCTGTGCGGACCACTGTTGTTAACGTTAATGAACGCCTGTCATCGTGGATTTGTGAGTCTCAAACTTGCGCCGCCCTGGCAACTGGCACTAGGCGGGTTGATCGTGGGTCTGCTTTCCCTGTTCACACCTGCAGTGTGGGGCAACG > NC_000913/1664001‑1664179 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |