Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 274,443 | C→T | intergenic (‑102/‑106) | trs51 ← / → ykfD | IS5 transposase/putative amino acid/amine transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 274,443 | 0 | C | T | 99.6% | 834.3 / NA | 228 | intergenic (‑102/‑106) | trs51/ykfD | IS5 transposase/putative amino acid/amine transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (118/109); total (119/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
AGGGACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGCGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTC > NC_000913/274353‑274529 | aGGGACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGgtgc > 2:3850811/1‑93 (MQ=255) aGGGACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGgtgc > 1:2997284/1‑93 (MQ=255) gggACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTTTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGtgcg > 1:857909/1‑93 (MQ=255) ggACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCgg < 1:5329013/93‑1 (MQ=255) ggACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCgg > 1:5288583/1‑93 (MQ=255) ggACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCgg < 1:2930899/93‑1 (MQ=255) ggACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCgg < 2:4780095/93‑1 (MQ=255) ggACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCgg > 2:5453545/1‑93 (MQ=255) aCTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGc > 2:2098959/1‑93 (MQ=255) aCTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGc > 1:3383390/1‑93 (MQ=255) cTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCa > 1:116303/1‑93 (MQ=255) ttGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCAt < 2:2504921/93‑1 (MQ=255) ttGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCAt > 2:5743168/1‑93 (MQ=255) ttGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGCCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCAt < 1:1691748/93‑1 (MQ=255) tgctCGCACCTTCTGCAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATc < 1:2271235/90‑1 (MQ=255) tGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATc > 1:803172/1‑93 (MQ=255) gTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCt < 2:5884039/93‑1 (MQ=255) cGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCg > 1:5686415/1‑93 (MQ=255) gCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGt > 1:2291692/1‑93 (MQ=255) cACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTc < 2:1442827/93‑1 (MQ=255) gccTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCt < 2:3449509/92‑1 (MQ=255) ccTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTg < 2:4107962/93‑1 (MQ=255) ccTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTg > 1:588817/1‑93 (MQ=255) ccTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTg > 1:4016028/1‑93 (MQ=255) cTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTgg < 2:5351010/93‑1 (MQ=255) cTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTgg > 1:1322862/1‑93 (MQ=255) ttCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTggg > 1:4091237/1‑92 (MQ=255) ttCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGt > 2:1928195/1‑93 (MQ=255) tCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTg > 1:3283376/1‑93 (MQ=255) ccGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGc > 2:3896082/1‑93 (MQ=255) cGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCa > 2:2288897/1‑93 (MQ=255) cGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCa < 2:2966842/93‑1 (MQ=255) aGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAggg > 2:26717/1‑93 (MQ=255) ggCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGt > 1:2700344/1‑93 (MQ=255) ggCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGt < 2:1643056/93‑1 (MQ=255) ggCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGt < 1:4967249/93‑1 (MQ=255) ggCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGt > 2:5570927/1‑93 (MQ=255) ggCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGt > 1:3443016/1‑93 (MQ=255) gTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGa > 2:3097101/1‑93 (MQ=255) gTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGa > 1:5133864/1‑93 (MQ=255) gTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGa > 2:3656490/1‑93 (MQ=255) ttATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGAc > 1:2503695/1‑93 (MQ=255) tGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACttt < 2:4265187/93‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCa < 1:3947354/93‑1 (MQ=255) tGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCAtt > 2:5067203/1‑93 (MQ=255) cggcCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTg < 2:6675504/93‑1 (MQ=255) cggcCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTg > 1:1088346/1‑93 (MQ=255) ggcCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGt < 1:5986351/93‑1 (MQ=255) gcCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGtt > 2:6325493/1‑93 (MQ=255) gcCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGtt > 1:6297127/1‑93 (MQ=255) gcCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGtt < 2:2404214/93‑1 (MQ=255) ccTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTaa < 1:4592251/93‑1 (MQ=255) ccTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTaa < 1:1490348/93‑1 (MQ=255) tttttGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACa > 1:2632294/1‑93 (MQ=255) ttttGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACaa > 1:2422678/1‑93 (MQ=255) ttttGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACaa > 2:283831/1‑93 (MQ=255) ttttGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACaa > 2:1523933/1‑93 (MQ=255) tttGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACaaa < 2:89593/93‑1 (MQ=255) tGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAAcg > 2:5326259/1‑93 (MQ=255) tATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAAcgcg < 2:3739698/93‑1 (MQ=255) aTCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCgg > 2:3233954/1‑93 (MQ=255) tCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGt < 1:2020806/93‑1 (MQ=255) cTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGta < 1:1273345/93‑1 (MQ=255) cTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGta < 1:1420516/93‑1 (MQ=255) cTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGta < 1:1758825/93‑1 (MQ=255) tGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGtat > 2:5972073/1‑93 (MQ=255) tGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGtat < 1:5729432/93‑1 (MQ=255) gATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGtata > 2:1206880/1‑93 (MQ=255) gATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGtata > 2:2853140/1‑93 (MQ=255) attattAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATaa < 2:2730543/93‑1 (MQ=255) ttattaATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAAc < 2:2797362/93‑1 (MQ=255) ttattaATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAAc > 1:2889918/1‑93 (MQ=255) aaTCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAAcc > 2:2025128/1‑93 (MQ=255) aTCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACct < 1:3883725/93‑1 (MQ=255) aTCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACct < 1:6621744/93‑1 (MQ=255) aTCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACct < 2:3784402/93‑1 (MQ=255) aTCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACct > 1:4369779/1‑93 (MQ=255) tCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACctt > 1:1849716/1‑93 (MQ=255) tCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACctt < 1:2434552/93‑1 (MQ=255) ccccACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACcttc < 1:3076825/93‑1 (MQ=255) ccccACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACcttc < 1:4630389/93‑1 (MQ=255) cccACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACcttct < 2:851715/93‑1 (MQ=255) cccACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACcttct < 2:5504615/93‑1 (MQ=255) ccACCCGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACcttctt > 1:5229149/1‑93 (MQ=255) cccGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTgg > 1:4547703/1‑93 (MQ=255) cccGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTgg > 2:3385067/1‑93 (MQ=255) ccGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGa < 1:751263/93‑1 (MQ=255) cGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGAt > 2:6120566/1‑93 (MQ=255) cGCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGAt < 1:2088641/93‑1 (MQ=255) gCTATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATg > 1:6204209/1‑93 (MQ=255) tATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGtt < 2:1512307/93‑1 (MQ=255) tATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGtt < 2:2246715/93‑1 (MQ=255) tATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGtt > 1:3604018/1‑93 (MQ=255) tATTAAGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGtt < 2:2451/93‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGa < 1:2601385/93‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGa < 1:5779555/93‑1 (MQ=255) aGCGCCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGAt > 2:4868028/1‑93 (MQ=255) gcgcCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATg > 2:1070841/1‑93 (MQ=255) gcCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTc < 1:2117062/93‑1 (MQ=255) gcCCGGTGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTc < 1:2850094/93‑1 (MQ=255) | AGGGACTTGTTCGCACCTTCCGGAGGCGTTATGAGCTGGCGGCCCTTTTTGTATCTGATTATTAATCCCCACCCGCTATTAAGCGCCCGGCGCGGGCATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTC > NC_000913/274353‑274529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |