Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,449,280 | T→C | T109A (ACC→GCC) | b2335 ← | putative fimbrial protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,449,280 | 0 | T | C | 99.6% | 713.3 / ‑5.1 | 223 | T109A (ACC→GCC) | b2335 | putative fimbrial protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (98/124); total (98/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GTTATTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGTGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGTTTGTGC > NC_000913/2449191‑2449369 | gTTATTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGat > 1:1646937/1‑93 (MQ=255) ttATTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGata > 2:2691423/1‑93 (MQ=255) tATTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGatat < 1:1524531/93‑1 (MQ=255) tATTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGatat > 2:4528964/1‑93 (MQ=255) aTTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATAtt > 2:650664/1‑93 (MQ=255) aTTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATAtt < 1:9169/93‑1 (MQ=255) aTTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATAtt > 1:2400919/1‑93 (MQ=255) ttGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTg > 1:5789471/1‑93 (MQ=255) tGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTgg < 1:1177648/93‑1 (MQ=255) tGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTgg < 2:759758/93‑1 (MQ=255) gATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGt > 1:3210326/1‑93 (MQ=255) gATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGt < 2:3511904/93‑1 (MQ=255) gATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGt > 2:5751901/1‑93 (MQ=255) atatTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTa < 2:6260670/93‑1 (MQ=255) atatTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTa > 1:4327862/1‑93 (MQ=255) tatTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTAc > 1:1627720/1‑93 (MQ=255) ttAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTg < 2:1742693/93‑1 (MQ=255) ttAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTg < 2:3702513/93‑1 (MQ=255) aaaTGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAg < 2:93197/93‑1 (MQ=255) aTGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTa < 2:3366202/93‑1 (MQ=255) aTGGCGCCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTCGTACTGAgga > 1:5727564/1‑91 (MQ=255) ggCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTAcc > 2:5261795/1‑93 (MQ=255) ggCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTAcc < 1:5054343/93‑1 (MQ=255) ggCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTAcc > 1:4790737/1‑93 (MQ=255) cGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGt > 2:637603/1‑93 (MQ=255) gTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGtt > 2:2300774/1‑93 (MQ=255) tCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGttt > 2:1222541/1‑93 (MQ=255) ccAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTc < 2:4068459/93‑1 (MQ=255) ccAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTc < 1:1071462/93‑1 (MQ=255) ccAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTc > 1:3277659/1‑93 (MQ=255) aGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGc > 2:5683623/1‑93 (MQ=255) gCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGcc > 1:2187144/1‑93 (MQ=255) tATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGt < 2:2077581/93‑1 (MQ=255) tATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGt < 2:4179130/93‑1 (MQ=255) ttttCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTa > 1:1299857/1‑93 (MQ=255) ttttCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTa > 1:6462333/1‑93 (MQ=255) ttCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAAt > 1:5683059/1‑93 (MQ=255) tCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATc > 1:5076578/1‑93 (MQ=255) cACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTACTCg > 1:2044200/1‑93 (MQ=255) ccGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGtt < 2:1321051/93‑1 (MQ=255) ccGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGtt > 2:2763891/1‑93 (MQ=255) ccGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGtt > 1:450275/1‑93 (MQ=255) cGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTg < 1:2646353/93‑1 (MQ=255) gACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGttaa > 2:5455978/1‑91 (MQ=255) gACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGa > 1:2531526/1‑93 (MQ=255) ggCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGt > 1:1969525/1‑93 (MQ=255) cAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTAt < 2:3228772/93‑1 (MQ=255) aaaCAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTAtt > 1:4487864/1‑93 (MQ=255) aaCAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTg < 1:4023082/93‑1 (MQ=255) aaCAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTg > 1:759025/1‑93 (MQ=255) aaCAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTg > 2:1114922/1‑93 (MQ=255) aCAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGc > 1:123221/1‑93 (MQ=255) aaTGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGccc < 1:1017910/93‑1 (MQ=255) aTGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCt < 1:3858060/93‑1 (MQ=255) aTGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGCACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCt > 1:2768942/1‑93 (MQ=255) tGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTCATCGTTGAGGTATTGCCCtt > 1:1902079/1‑93 (MQ=255) tGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCtt > 1:3610919/1‑93 (MQ=255) tGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCtt > 2:1851388/1‑93 (MQ=255) gAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTa < 1:338379/93‑1 (MQ=255) aGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGTTATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTaa < 1:5857449/93‑1 (MQ=255) aGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTaa < 1:5891078/93‑1 (MQ=255) aGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTaa < 2:3095967/93‑1 (MQ=255) aGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTaa < 2:2850116/93‑1 (MQ=255) aGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTaa < 1:542541/93‑1 (MQ=255) ttATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGt > 2:5329999/1‑93 (MQ=255) tATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGtt < 2:5248869/93‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTg < 2:676848/93‑1 (MQ=255) tCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGc < 2:198815/93‑1 (MQ=255) ggCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCAt > 1:6236563/1‑93 (MQ=255) ggCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCAt < 1:4647772/93‑1 (MQ=255) cgcTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATcc > 2:5813470/1‑93 (MQ=255) cgcTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATcc < 2:6080184/93‑1 (MQ=255) cTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGCTTCGCCGTTAATCGCTGAGGCCTTGCCCTTAAGTTGCATCCGc > 2:1594728/1‑93 (MQ=255) tATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCa > 1:5178062/1‑93 (MQ=255) aTTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCaa < 1:3773578/93‑1 (MQ=255) ttttCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAg > 2:1437965/1‑93 (MQ=255) tttCTATCCGAATGCCCAGCCCGGTGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGt < 2:1452619/93‑1 (MQ=255) tttCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGt < 1:3475223/93‑1 (MQ=255) tttCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGt < 2:5535262/93‑1 (MQ=255) tttCTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGt < 2:244912/93‑1 (MQ=255) cTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGt < 1:4182306/93‑1 (MQ=255) cTATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGt < 2:5166008/93‑1 (MQ=255) tATCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGtt < 1:412891/93‑1 (MQ=255) aTCCGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTa > 2:379432/1‑93 (MQ=255) ccGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGc < 2:4270679/93‑1 (MQ=255) cGAATGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCa > 2:5098143/1‑93 (MQ=255) aaTGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAg < 2:5852014/93‑1 (MQ=255) aTGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGa > 1:554311/1‑93 (MQ=255) aTGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGa < 2:2130074/93‑1 (MQ=255) aTGCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGa < 2:4211104/93‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACt < 1:6038690/93‑1 (MQ=255) cccAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTg < 2:587933/93‑1 (MQ=255) cAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCTTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGtt < 1:769996/93‑1 (MQ=255) cAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGtt < 1:2855771/93‑1 (MQ=255) cAGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGtt > 2:1555987/1‑93 (MQ=255) aGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGttt < 2:3657421/93‑1 (MQ=255) aGCCCGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGttt < 2:4733160/93‑1 (MQ=255) cccGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGTTtgt < 2:1076409/93‑1 (MQ=255) ccGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCGGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGTTtgtg < 1:6020276/93‑1 (MQ=255) cGGCGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGTTTGTGc < 1:2901406/93‑1 (MQ=255) | GTTATTGATATTAAATGGCGTCCAGCTATTTTCACCGACGGCAAACAATGAGTTATCGGCGCTATTTTCTATCCGAATGCCCAGCCCGGTGATATTGGTACTGAGTACCGTTTCGCCGTTAATCGTTGAGGTATTGCCCTTAAGTTGCATCCGCAAGTCGTTAGCAAGACTGTTTGTGC > NC_000913/2449191‑2449369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |