| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 301,875 | A→G | intergenic (‑78/‑340) | yagT ← / → yagU | putative xanthine dehydrogenase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 301,875 | 0 | A | G | 99.6% | 809.1 / NA | 245 | intergenic (‑78/‑340) | yagT/yagU | putative xanthine dehydrogenase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (144/100); minor base T (0/1); total (144/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATGATG > NC_000913/301785‑301964 | cTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGt > 2:785849/1‑93 (MQ=255)cTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGt < 2:1375183/93‑1 (MQ=255) ttGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTc < 1:2055090/93‑1 (MQ=255) ttGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTc > 2:6523482/1‑93 (MQ=255) gTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGc < 2:1904064/93‑1 (MQ=255) ttGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCAGGGTCGGCg < 1:6573183/93‑1 (MQ=255) cTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAca > 1:5660501/1‑93 (MQ=255) tACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAcagcag > 1:1521692/1‑93 (MQ=255) tACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAcagcag > 2:2818380/1‑93 (MQ=255) ccAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCagga > 1:1591586/1‑93 (MQ=255) ccAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCagga > 1:3114099/1‑93 (MQ=255) cAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCaggag > 2:4448168/1‑93 (MQ=255) aGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCaggagg < 1:2823049/93‑1 (MQ=255) ggCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAggagga > 2:3000328/1‑93 (MQ=255) ggCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAggagga > 1:643062/1‑93 (MQ=255) ggCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAggagga > 1:5983856/1‑93 (MQ=255) gCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGat < 2:4119494/93‑1 (MQ=255) gCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGat > 1:89034/1‑93 (MQ=255) gCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGat < 1:3815366/93‑1 (MQ=255) ccTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGatt > 2:1053560/1‑93 (MQ=255) cTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGatta > 1:5643685/1‑93 (MQ=255) cTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGatta > 2:2422360/1‑93 (MQ=255) tCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGattat < 1:5333869/93‑1 (MQ=255) tCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGattat > 2:2152303/1‑93 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc < 2:4139949/93‑1 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc > 1:2154009/1‑93 (MQ=255) gTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCtt > 2:5473699/1‑93 (MQ=255) tATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTa < 2:2633180/93‑1 (MQ=255) tATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTa > 2:4302316/1‑93 (MQ=255) aTTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaa > 2:3116018/1‑93 (MQ=255) ttCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaa > 2:2173980/1‑93 (MQ=255) ttCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaa > 1:5060428/1‑93 (MQ=255) ttCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaa > 2:542970/1‑93 (MQ=255) tAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcg > 2:1933286/1‑93 (MQ=255) tAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcg > 1:675355/1‑93 (MQ=255) aaaTGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcgc < 2:206034/93‑1 (MQ=255) aaGGGGCAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGTTGCTTTTTTACACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGCTTATCCTTAAAAcccc > 1:5200081/1‑90 (MQ=255) aGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGa > 1:2436392/1‑93 (MQ=255) aGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGa < 2:3211440/93‑1 (MQ=255) aGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGa > 2:3936228/1‑93 (MQ=255) ggggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGaa < 1:2972329/93‑1 (MQ=255) ggggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGaa > 2:4624403/1‑93 (MQ=255) ggggAAAATAAGAGTGCGCTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGaa > 2:6675238/1‑93 (MQ=255) gggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAAt < 2:2792264/93‑1 (MQ=255) ggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATg > 1:36374/1‑93 (MQ=255) ggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATg > 2:1438470/1‑93 (MQ=255) aaaaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCa < 2:5270588/93‑1 (MQ=255) aaaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAg < 2:6188757/93‑1 (MQ=255) aaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGc < 1:6400770/93‑1 (MQ=255) aTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCt > 1:6287605/1‑93 (MQ=255) aTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCt > 1:4240241/1‑93 (MQ=255) tAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTa > 2:5750221/1‑93 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATTGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 2:4734009/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 2:3269451/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 1:3562622/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 1:4467193/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa > 1:1254225/1‑93 (MQ=255) gTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGc > 1:4776812/1‑93 (MQ=255) tGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGcc < 1:1009426/93‑1 (MQ=255) tGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGcc < 2:4595527/93‑1 (MQ=255) cGTGGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCg < 1:1168024/93‑1 (MQ=255) gTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCgg > 1:4990692/1‑93 (MQ=255) gCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAATCGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCta > 1:5390888/1‑93 (MQ=255) cGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtat > 1:3188486/1‑92 (MQ=255) cGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaa > 1:1684378/1‑93 (MQ=255) cGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaa > 2:5774644/1‑93 (MQ=255) gagaGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaat > 1:1970893/1‑93 (MQ=255) agagTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaata > 2:6489992/1‑93 (MQ=255) gTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCATGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAAt < 2:4291545/93‑1 (MQ=255) tGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAAtt > 1:6016902/1‑93 (MQ=255) cTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCa < 2:199785/93‑1 (MQ=255) tGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCAt < 2:1709065/93‑1 (MQ=255) tGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCAt > 1:1835074/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATg > 1:1091145/1‑93 (MQ=255) aTGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGt > 2:3665277/1‑93 (MQ=255) aTGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGt > 2:5958781/1‑93 (MQ=255) tGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCTCGGCTAATAAATTCATGtt < 1:260713/93‑1 (MQ=255) tGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGtt < 1:3765083/93‑1 (MQ=255) tGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGtt < 2:5286420/93‑1 (MQ=255) ttttttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGc < 1:2200781/93‑1 (MQ=255) ttttttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGc > 1:3378081/1‑93 (MQ=255) tttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCgg < 2:4852396/93‑1 (MQ=255) ttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCggg < 1:4580093/93‑1 (MQ=255) ttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCggg > 1:620675/1‑93 (MQ=255) tAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGa < 2:2677410/93‑1 (MQ=255) aaaCGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGAt > 1:780714/1‑93 (MQ=255) aaCGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATg < 2:6307008/93‑1 (MQ=255) aCGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGt > 2:4036634/1‑93 (MQ=255) aCGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGACGt > 1:1787719/1‑93 (MQ=255) gatAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtg > 1:6620908/3‑93 (MQ=255) gTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtg > 1:2813903/1‑93 (MQ=255) gTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtg > 2:3311111/1‑93 (MQ=255) ttAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGATGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtga < 2:2490623/93‑1 (MQ=255) ttAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtga < 1:4720717/93‑1 (MQ=255) ttAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtga < 1:4297443/93‑1 (MQ=255) tAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgat < 2:37421/93‑1 (MQ=255) aGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgatga > 2:723356/1‑93 (MQ=255) gCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgatgat > 2:5064327/1‑93 (MQ=255) cATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgatgatg > 2:5041762/1‑93 (MQ=255) cATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgatgatg > 1:334737/1‑93 (MQ=255) | CTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATGATG > NC_000913/301785‑301964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |