| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,766,382 | C→G | P218A (CCC→GCC) | b2632 → | putative GTP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,766,382 | 0 | C | G | 99.5% | 673.8 / NA | 215 | P218A (CCC→GCC) | b2632 | putative GTP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (100/114); minor base T (0/1); total (100/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGCCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGGACATGGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAG > NC_000913/2766292‑2766472 | ccGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCca > 1:652624/1‑93 (MQ=255) ccGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCca < 2:2039609/93‑1 (MQ=255) cGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcag < 2:6694204/93‑1 (MQ=255) cGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcag > 2:1984700/1‑93 (MQ=255) gTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagc < 1:3433043/93‑1 (MQ=255) gTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagc < 1:5902093/93‑1 (MQ=255) tGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagca > 1:4816007/1‑93 (MQ=255) tGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGCGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagca > 1:1549988/1‑93 (MQ=255) gCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagcag < 2:2100863/93‑1 (MQ=255) gCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagcag > 1:413294/1‑93 (MQ=255) gCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTAGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCcagcag < 2:2857371/93‑1 (MQ=255) aTCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGcc > 1:706301/1‑93 (MQ=255) tCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGccc < 1:1334798/93‑1 (MQ=255) tCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGccc > 1:4034170/1‑93 (MQ=255) tCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGccc > 1:1149839/1‑93 (MQ=255) tCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGGGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGccc > 2:180778/1‑93 (MQ=255) cGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCgg > 2:3286243/1‑93 (MQ=255) ggTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgt > 2:2911938/1‑93 (MQ=255) gtgtgtGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgta > 1:4205943/1‑93 (MQ=255) tgtgtgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgtag < 2:1556857/93‑1 (MQ=255) gtgtgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgtagt > 1:4564187/1‑93 (MQ=255) gtgtgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATAGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgtagt > 2:4693662/1‑93 (MQ=255) tgtgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgtagta < 1:392371/93‑1 (MQ=255) tgtgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgtagta < 1:2926122/93‑1 (MQ=255) tgtgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGgtagta < 1:2845112/93‑1 (MQ=255) tgCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAgc < 1:2611941/93‑1 (MQ=255) gtCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACt > 1:5340791/1‑93 (MQ=255) tCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTg < 2:3703406/93‑1 (MQ=255) cGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGc > 1:4535936/1‑93 (MQ=255) cGGTTCGCCTGCAGTGCGAAGTAAGGGTGGTGGCGGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCTGCGTGAGGCCAGCAGCCGGGTAGTAGCGCTACTGc < 1:2580768/93‑1 (MQ=25) ggTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCa > 2:5452330/1‑93 (MQ=255) gTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCaa > 1:5886167/1‑93 (MQ=255) ttCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAAc < 1:4753719/93‑1 (MQ=255) tCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACa < 2:221496/93‑1 (MQ=255) tCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACa > 2:1878955/1‑93 (MQ=255) ccTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATcc < 2:1466182/93‑1 (MQ=255) ccTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATcc < 1:840926/93‑1 (MQ=255) cTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATccc > 2:1035093/1‑93 (MQ=255) 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ggggACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCgaa > 2:316936/1‑91 (MQ=255) ggACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACa < 2:4825846/93‑1 (MQ=255) gACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACaa < 1:930641/93‑2 (MQ=255) aCTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACaac < 2:5859154/93‑3 (MQ=255) tAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACaacgg > 1:6194004/1‑89 (MQ=25) tAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACaacgg < 1:6444323/93‑5 (MQ=25) aGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTa < 1:3055909/93‑1 (MQ=21) aGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTa > 1:4376983/1‑93 (MQ=21) aGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTa > 1:487171/1‑93 (MQ=21) gTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGcc > 2:121083/1‑93 (MQ=21) gTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGcc > 1:65463/1‑93 (MQ=21) gTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGcc < 2:2346976/93‑1 (MQ=25) tGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGccc < 1:2437095/93‑1 (MQ=21) tGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCggg < 2:5133041/93‑1 (MQ=25) ggCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGa > 2:2505788/1‑93 (MQ=21) gCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAg > 2:1158706/1‑93 (MQ=21) agagCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGcg > 2:1998391/1‑92 (MQ=21) agagCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCa < 1:1920250/93‑1 (MQ=25) gagCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGGGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAg > 2:6574466/1‑93 (MQ=21) gagCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAg < 1:27869/93‑1 (MQ=25) gagCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAg < 2:4181494/93‑1 (MQ=25) gagCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAg > 1:5588658/1‑93 (MQ=21) agCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAgg < 2:4231651/93‑1 (MQ=21) ggATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCAc < 2:1392172/93‑1 (MQ=255) ggATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCAc > 1:2354782/1‑93 (MQ=255) atgatTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGt < 1:2567670/93‑1 (MQ=255) atgatTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGt < 2:5495785/93‑1 (MQ=255) atgatTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGt < 2:3938323/93‑1 (MQ=255) atgatTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGt < 1:4458203/93‑1 (MQ=255) gatTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGa > 1:6015165/1‑93 (MQ=255) atTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGAc < 1:4916547/93‑1 (MQ=255) atTAAGTGTCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGAc < 1:5991071/93‑1 (MQ=255) 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gtgtCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGAttt > 1:3908743/1‑93 (MQ=255) tgtCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTc < 2:4013092/93‑1 (MQ=255) tgtCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTc < 1:3715374/93‑1 (MQ=255) tgtCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTc < 2:741842/93‑1 (MQ=255) gtCTGCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCg < 2:3347077/93‑1 (MQ=255) gCCGCGTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGa < 1:2945906/93‑1 (MQ=255) cgcgTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGaaa > 1:5036915/1‑93 (MQ=255) gcgTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAAc < 1:5250417/93‑1 (MQ=255) gcgTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACAATTTCGGTGAAAc > 2:3801019/1‑93 (MQ=255) gTGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCg > 2:6026073/1‑93 (MQ=255) tGAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGt > 1:1888431/1‑93 (MQ=255) gAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTa < 2:4547188/93‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTa < 2:1840022/93‑1 (MQ=255) aGCCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGAACAACGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAg < 2:5791765/93‑1 (MQ=255) | CCCGTGCATCCGGTGTGTGCCGTGTCGGTTCGCCTGCAGTGGGGACTAAGGGTGATGGCAGAGCGGATGATTAAGTGTCTGCCGCGTGAGCCCAGCAGCCCGGTAGTAGCGCTACTGCAACATCCCTTTCGGACATGGGTAGCCCGGGAGCAGGCACGTGACGATTTCGGTGAAACCGTAG > NC_000913/2766292‑2766472 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |