| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 328,027 | T→C | T184A (ACC→GCC) | betI ← | putative transcriptional repressor of bet genes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 328,027 | 0 | T | C | 99.1% | 353.7 / NA | 112 | T184A (ACC→GCC) | betI | putative transcriptional repressor of bet genes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (27/84); total (27/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑TTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCTGTGCCTGTTC > NC_000913/327937‑328117 | ctgTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑ctt < 1:2272912/93‑1 (MQ=255) tgTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑cttt < 2:384830/93‑1 (MQ=255) tgTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGGATTAGAGCGGG‑gttt > 2:843758/1‑93 (MQ=255) gTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTa < 1:4714169/93‑1 (MQ=255) gTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTa < 2:5957613/93‑1 (MQ=255) gTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGGATTAGCGCGGG‑gtttt > 1:1834726/1‑92 (MQ=255) ttCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGGAGGGGAATAGGGCGGG‑ATTTA‑t > 2:5379724/1‑93 (MQ=255) ttCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGAATTAGCGCGGG‑GGTTA‑t > 2:639272/1‑93 (MQ=255) tCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑Tc < 2:410640/93‑1 (MQ=255) cTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑Tcc < 1:3733457/93‑1 (MQ=255) tGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCa < 1:5458284/93‑1 (MQ=255) tGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCa < 1:538311/93‑1 (MQ=255) aTTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGGGGGGG‑GTTTA‑TTCAG‑Cgg > 2:5448675/1‑93 (MQ=255) aTTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑Cgg < 2:1162729/93‑1 (MQ=255) aTTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑Cgg < 2:4720244/93‑1 (MQ=255) tCGGGAGATCAGGTCTCCTCGGTTAATCGGGTGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGtt < 1:6143271/93‑1 (MQ=255) tCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGtt < 1:193488/93‑1 (MQ=255) tCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGtt < 1:5888439/93‑1 (MQ=255) tCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGGATTAGCGCGGG‑CGTTT‑TCCCG‑Cgggt > 1:6505295/1‑91 (MQ=255) cGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGttt < 2:1412436/93‑1 (MQ=255) gggACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGGCGGGGATTAGCGCGGG‑GTTTT‑TTCCG‑CGGgttt > 2:2248412/1‑92 (MQ=255) gACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGcc < 1:5104784/93‑1 (MQ=255) aCATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAAGTAGCGCGGG‑GTTTT‑TCCCC‑CGGTTTTCCg > 1:2380124/1‑93 (MQ=255) cATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGGGTTAGCGCGGG‑CTTTA‑TTCAGACGGtttccgc > 1:2421293/1‑89 (MQ=255) cATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGc < 1:188640/93‑1 (MQ=255) aTCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTGGTGGGAATAGCGCGGG‑GGTTATTCCAC‑GGGTTTgtgcc > 2:3173504/1‑89 (MQ=255) aTCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGGAGTAGTGCGGG‑CGTTA‑TTCAG‑CGGGTTGgcgcc > 1:5569835/1‑92 (MQ=255) tCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTc < 1:3346922/93‑1 (MQ=255) cACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCa < 2:5295234/93‑1 (MQ=255) aCGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGAGCGGG‑GTTTA‑TCCAG‑CGGGTTGGCGCTCaa > 2:4283623/1‑92 (MQ=255) cGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTTGCGGGGGCGTTTT‑TCCAG‑‑GGGTTGCTGCTCacc > 2:276801/1‑91 (MQ=255) tctcCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGGAATAGCGCGGG‑GTTTT‑TTCAG‑CGGGTTGGCGCTCAGAGc > 2:4347291/1‑93 (MQ=255) tctcCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGc < 1:6058189/93‑1 (MQ=255) tctcCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGAAATAACGCGGG‑GCTTA‑TCCTG‑CGGCTTGCCGCTCACAGc > 1:4406964/1‑93 (MQ=255) ctcctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGcc < 2:1486811/93‑1 (MQ=255) tcctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCcg < 1:2896365/93‑1 (MQ=255) tcctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCcg < 2:4546896/93‑1 (MQ=255) tcctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCCGGGGAATAGCGCGGG‑CGTTA‑TTCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGccc > 2:3623902/1‑92 (MQ=255) cctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAAATAGCGCGGG‑GTTTA‑TTCAG‑CGGTTTTCCGCTCAGAGcccc > 2:3354609/1‑91 (MQ=255) ctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCcgcg < 1:4670950/93‑1 (MQ=255) ctcGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGAAATAACGCGGG‑CTTTA‑TTCCA‑CGGTTTGTCGCTCAAAGCcgcg > 1:1653850/1‑93 (MQ=255) ggTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTT‑TTCAG‑CCGTTTGCCGCTCAGAGACgcgcgc > 2:5527096/1‑93 (MQ=255) gTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCa < 1:1373317/93‑1 (MQ=255) gTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCa < 2:3538015/93‑1 (MQ=255) ttAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGGTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAg > 2:1665152/1‑93 (MQ=255) tAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGGATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCTAG‑CGGGTTGGCGCTCAGAGCCGCCCGCAGc > 2:6497098/1‑93 (MQ=255) aaTCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGcc < 1:6366652/93‑1 (MQ=255) aaTCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGGTTGCCGCTCAGAGCCGCGCgccgcc > 2:579532/1‑93 (MQ=255) aTCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCa < 2:4236118/93‑1 (MQ=255) aTCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCa < 1:4523268/93‑1 (MQ=255) aTCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGGCAGGGGAATAGCGCGGG‑CGTTA‑TTCAG‑CGGGTTGCCGCTCAGAGGCGCGCGCAGCCa > 2:5019356/1‑93 (MQ=255) ggTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATaa < 1:1045622/93‑1 (MQ=255) ggTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATaa < 1:277215/93‑1 (MQ=255) gTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAAt < 1:2785724/93‑1 (MQ=255) ggTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCa < 2:5148649/93‑1 (MQ=255) gTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCat < 1:6499663/93‑1 (MQ=255) tAGATGCTGAGTGATAAAGTTGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCatc < 2:4412460/93‑1 (MQ=255) tAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCatc < 1:3908710/93‑1 (MQ=255) aGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAACGCGGG‑CTTTT‑TTCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCCTAATCCatca > 2:421033/1‑93 (MQ=255) gATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGAAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCatcaa < 1:5788732/93‑1 (MQ=255) tGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCatcaatc < 1:3137306/93‑1 (MQ=255) tGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TTCAG‑CGGGTTTCCGCTCAGAGCCCCGCGCAGCCCTAAAACATCAATCAgc > 2:2938546/1‑93 (MQ=255) tGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAgc < 1:2132994/93‑1 (MQ=255) gATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGTTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGc < 1:4510325/93‑1 (MQ=255) aaTAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCTCGGC‑TTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCTCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGc < 2:2084296/92‑1 (MQ=255) aTAAAGTGGCGGGTCAGGGGATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCCGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCCTCCATCAACGCGGcc > 2:1010563/1‑93 (MQ=255) aTAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGcc < 1:1106940/93‑1 (MQ=255) tAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCa < 2:5446523/93‑1 (MQ=255) tAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCa < 2:6443366/93‑1 (MQ=255) aaaGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAg < 2:6697530/93‑1 (MQ=255) aGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGc > 1:519022/1‑93 (MQ=255) aGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGc < 1:3120457/93‑1 (MQ=255) tGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCg < 2:1866266/93‑1 (MQ=255) gCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTa < 2:1825002/93‑1 (MQ=255) gCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTa > 1:3244916/1‑93 (MQ=255) gCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTa < 1:5789733/93‑1 (MQ=255) gCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTGGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTa < 2:1218011/93‑1 (MQ=255) cGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAg > 2:2462391/1‑93 (MQ=255) gggTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGc > 2:5610952/1‑93 (MQ=255) ggTCAGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGcc > 2:2188355/1‑93 (MQ=255) aGGGAATTAGCGCGGG‑TTTTA‑TCCAG‑CGTTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCt < 2:4781252/93‑1 (MQ=255) aGGGAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCt > 2:3589578/1‑93 (MQ=255) gggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCTATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCtt > 1:1021361/1‑93 (MQ=255) gggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCtt > 1:5661217/1‑93 (MQ=255) gggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCtt > 1:5182460/1‑93 (MQ=255) gggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCtt > 2:614325/1‑93 (MQ=255) gggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAACCCGCtt > 2:4979643/1‑93 (MQ=255) ggAATTAGCGCGGG‑TTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTc < 2:4021913/93‑1 (MQ=255) ggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTc > 1:4793342/1‑93 (MQ=255) ggAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTc > 2:4149029/1‑93 (MQ=255) gAATTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTcc < 2:4505466/93‑1 (MQ=255) aaTTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCGG‑CGTTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCt < 1:2611429/93‑1 (MQ=255) aTTAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCtg < 2:6251652/93‑1 (MQ=255) ttAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCtgt > 2:2989473/1‑93 (MQ=255) ttAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCtgt > 1:1160138/1‑93 (MQ=255) tAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCtgtg < 2:4976387/93‑1 (MQ=255) tAGCGCGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCtgtg < 2:1941408/93‑1 (MQ=255) gcgcGGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCTGTGcc < 2:1550910/93‑1 (MQ=255) gcgGG‑CTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCTGTGCCTg < 1:1813343/93‑1 (MQ=255) ggg‑CTTTA‑TCCAG‑CGTTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCTGTGCCTGtt < 2:259723/93‑1 (MQ=255) | CTGTTCTGCCATTCGGGACATCACGTCTCCTCGGTTAATCGGTGGGTAGATGCTGAGTGATAAAGTGGCGGGTCAGGGAATTAGCGCGGG‑TTTTA‑TCCAG‑CGGTTTGCCGCTCAGAGCCGCGCGCAGCCATAATCCATCAATCAGCGCGGCCAGGCCGTAGCCCGCTTCCTGTGCCTGTTC > NC_000913/327937‑328117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |