| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,825,102 | T→C | F230L (TTC→CTC) | srlE → | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,825,102 | 0 | T | C | 99.6% | 828.9 / NA | 256 | F230L (TTC→CTC) | srlE | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (122/133); total (123/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > NC_000913/2825012‑2825191 | aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 1:4290152/93‑1 (MQ=255)aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 2:6126686/93‑1 (MQ=255) ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg > 1:2698508/1‑93 (MQ=255) ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg > 2:3874642/1‑93 (MQ=255) ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg > 2:3372293/1‑93 (MQ=255) ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg < 2:6546422/93‑1 (MQ=255) ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg < 1:2056484/93‑1 (MQ=255) ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg < 2:6242283/93‑1 (MQ=255) ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTTGTCATGCTGGCTCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 2:1187726/93‑1 (MQ=255) ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 1:6077879/93‑1 (MQ=255) ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 2:4993804/93‑1 (MQ=255) ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 1:2375060/93‑1 (MQ=255) ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 2:151135/93‑1 (MQ=255) cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa < 1:642213/93‑1 (MQ=255) aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg < 2:5106654/93‑1 (MQ=255) cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg > 1:3072593/1‑93 (MQ=255) cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg < 1:3729523/93‑1 (MQ=255) gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg > 1:1276138/1‑93 (MQ=255) gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTACTTCCCACTGCTTTCATCTTTCCTCGGCCCAGgcg > 2:3652010/1‑93 (MQ=255) ttccTCCGCGGGCGAGCCATCCACTGTGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCACCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAg < 1:2289648/90‑1 (MQ=255) gCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt < 2:1822962/93‑1 (MQ=255) gCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt > 2:768487/1‑93 (MQ=255) gCTCCGCTGGCCAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt < 2:114199/93‑1 (MQ=255) cTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTa < 2:92615/93‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 2:1273905/93‑1 (MQ=255) cTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGca > 2:4651211/1‑93 (MQ=255) tGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac < 1:5957205/93‑1 (MQ=255) gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt > 1:668666/1‑93 (MQ=255) gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt < 1:4383638/93‑1 (MQ=255) gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt < 1:4984285/93‑1 (MQ=255) aGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGtt > 1:418445/1‑93 (MQ=255) cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:6404955/93‑1 (MQ=255) cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc > 1:4601082/1‑93 (MQ=255) aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg > 1:3145539/1‑93 (MQ=255) tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg > 2:4950141/1‑93 (MQ=255) cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg < 1:4847365/93‑1 (MQ=255) aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt < 2:3926526/93‑1 (MQ=255) aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt < 1:5319169/93‑1 (MQ=255) tGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTat > 1:1059907/1‑93 (MQ=255) gTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattga > 2:408591/1‑93 (MQ=255) gTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattga < 2:5152893/93‑1 (MQ=255) cTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgatt < 2:2541830/93‑1 (MQ=255) cTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgatt < 2:4521804/93‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg < 2:2111060/93‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg > 1:6328144/1‑93 (MQ=255) gTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc < 1:860446/93‑1 (MQ=255) cATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGt < 1:1990221/93‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTg > 2:441113/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTg < 1:4939709/93‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:3488623/1‑93 (MQ=255) tGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc < 1:1408410/93‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:4759059/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTTGCGTGCAg > 1:6587/1‑93 (MQ=255) cTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAg > 2:2807841/1‑93 (MQ=255) tGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGa < 2:5629032/93‑1 (MQ=255) gcgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:4403152/93‑1 (MQ=255) cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt > 2:1738818/1‑93 (MQ=255) cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt < 1:5396251/93‑1 (MQ=255) cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt > 2:2184527/1‑93 (MQ=255) tCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGTCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc > 2:3563383/1‑93 (MQ=255) tCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc < 1:3876327/93‑1 (MQ=255) tCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc < 1:2794502/93‑1 (MQ=255) cATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtct > 1:5684667/1‑93 (MQ=255) aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 2:5053623/1‑93 (MQ=255) aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 2:2982169/1‑93 (MQ=255) cTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCgg > 1:1609839/1‑93 (MQ=255) tgctccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGc < 1:2468049/90‑1 (MQ=255) tgctccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGc > 2:42078/4‑93 (MQ=255) gctccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGGCGATTGGTCTCGGCa > 1:4652232/3‑93 (MQ=255) ctccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCaa < 1:6268211/92‑1 (MQ=255) tccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAat > 1:4924106/1‑93 (MQ=255) tccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAat > 2:3973663/1‑93 (MQ=255) ccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAata < 1:1740437/93‑1 (MQ=255) ccttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAata < 2:3060420/93‑1 (MQ=255) cttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAatat < 1:1539818/93‑1 (MQ=255) cttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGCCTCGGCAatat > 2:1941181/1‑93 (MQ=255) ttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAtt > 1:4530756/1‑93 (MQ=255) ttccCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATAtt > 1:5144261/1‑93 (MQ=255) 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ccTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCt < 1:1439332/93‑1 (MQ=255) cTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCtt < 1:3295539/93‑1 (MQ=255) tttCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCttt > 2:1589692/1‑93 (MQ=255) tttCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCttt > 1:2539330/1‑93 (MQ=255) tttCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCttt < 1:1144690/93‑1 (MQ=255) ttcctcGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTa > 2:621708/1‑93 (MQ=255) | ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAATATTCCGCCGCATCTGGCTTTA > NC_000913/2825012‑2825191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |