Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,025,603 T→C G154G (GGT→GGC ygfQ → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,025,6030TC100.0% 676.2 / NA 209G154G (GGT→GGCygfQhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (116/93);  total (116/93)

Only 100 of 235 total aligned reads displayed.

CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCAGTGGCGCTCGGTG  >  NC_000913/3025513‑3025690
                                                                                          |                                                                                        
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   cATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGgatcggcatcgg                                                                                     >  1:1758921/1‑93 (MQ=255)
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                aTTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctg                                                                        >  2:3483823/1‑93 (MQ=255)
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                     cGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAt                                                                   <  2:2150976/93‑1 (MQ=255)
                     cGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAt                                                                   <  1:795229/93‑1 (MQ=255)
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                       tAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtg                                                                 >  1:3756548/1‑93 (MQ=255)
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                        aaCCGGTGTGCGTACCTGGACCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgc                                                                >  2:1181196/1‑93 (MQ=255)
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                                                                  tATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAgg                      <  1:1038881/93‑1 (MQ=255)
                                                                   aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTTCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTAGGGTGATGAAAAACCCGATTGAAGGc                     >  1:337883/1‑93 (MQ=255)
                                                                   aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGc                     >  2:3865685/1‑93 (MQ=255)
                                                                       cTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGc                >  2:1783246/1‑93 (MQ=255)
                                                                        tCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcc               <  2:2967119/93‑2 (MQ=255)
                                                                        tCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGcc               >  2:1964755/1‑92 (MQ=255)
                                                                          aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGccag             <  2:5108507/93‑4 (MQ=255)
                                                                          aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATCGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGccag             >  2:3798777/1‑90 (MQ=255)
                                                                           cGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGccagt            >  1:2457424/1‑89 (MQ=255)
                                                                              tACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgc          <  1:2877707/93‑1 (MQ=255)
                                                                               aCAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcg         >  1:3852276/1‑93 (MQ=255)
                                                                                cAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcgc        >  1:2403922/1‑93 (MQ=255)
                                                                                cAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcgc        >  2:1643659/1‑93 (MQ=255)
                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc      >  1:2254169/1‑93 (MQ=255)
                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc      <  1:1829015/93‑1 (MQ=255)
                                                                                      tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTg  <  2:1226590/93‑1 (MQ=255)
                                                                                          |                                                                                        
CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCAGTGGCGCTCGGTG  >  NC_000913/3025513‑3025690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: