| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,077,216 | G→A | A45V (GCA→GTA) | cmtB ← | PTS system mannitol‑specific enzyme IIA component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,077,216 | 0 | G | A | 99.5% | 704.6 / ‑6.6 | 196 | A45V (GCA→GTA) | cmtB | PTS system mannitol‑specific enzyme IIA component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (73/122); minor base C (0/1); total (73/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
AGCGCCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTGCCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGAATGT > NC_000913/3077126‑3077305 | aGCGCCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTAcc < 1:5194896/93‑1 (MQ=255)aGCGCCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTAcc < 2:5816858/93‑1 (MQ=255)aGCGCCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTAcc < 1:5353914/93‑1 (MQ=255)aGCGCCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTAcc > 1:5970532/1‑93 (MQ=255) gcgcCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCt < 1:3929420/93‑1 (MQ=255) gcgcCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCt < 1:2860973/93‑1 (MQ=255) gcCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGa > 2:3099290/1‑93 (MQ=255) ccccACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGaa < 2:1519114/93‑1 (MQ=255) cccACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAAt < 1:3875372/93‑1 (MQ=255) cccACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAAt > 1:6101905/1‑93 (MQ=255) cccACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAAt > 1:5386231/1‑93 (MQ=255) cccACATCCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAAt < 1:3547170/93‑1 (MQ=255) ccACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGCGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATg > 2:4612413/1‑93 (MQ=255) ccACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATg > 2:4336681/1‑93 (MQ=255) caTTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTaa < 1:4599120/93‑1 (MQ=255) aTTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAAt > 1:5218894/1‑93 (MQ=255) aTTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAAt > 2:3593199/1‑93 (MQ=255) ttCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAAtt > 1:2230749/1‑93 (MQ=255) ttCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAAtt < 1:5213072/93‑1 (MQ=255) tCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATtc < 2:1438223/93‑1 (MQ=255) ccGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATtct < 1:5049892/93‑1 (MQ=255) gTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGc > 1:1194426/1‑93 (MQ=255) gcgcATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGa > 1:6712521/1‑93 (MQ=255) cgcATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGat < 2:28086/93‑1 (MQ=255) gcATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGata < 2:166991/93‑1 (MQ=255) cATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGatat > 1:6215427/1‑93 (MQ=255) ctGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGAtata < 1:998764/92‑1 (MQ=255) aTGAGGCCTTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGAtata < 2:2438264/93‑1 (MQ=255) aTGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGAtata < 1:6522292/93‑1 (MQ=255) aTGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGAtata < 2:2477415/93‑1 (MQ=255) aTGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGAtata < 2:5880725/93‑1 (MQ=255) tGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGACTCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAg < 2:3123069/93‑1 (MQ=255) tGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAg < 1:553677/93‑1 (MQ=255) gAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGt > 1:640088/1‑93 (MQ=255) aGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGtt > 1:4504600/1‑93 (MQ=255) gCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGtttt < 2:5062115/93‑1 (MQ=255) gCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGtttt < 2:5727286/93‑1 (MQ=255) aTTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTa < 1:590912/93‑1 (MQ=255) aTTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTa < 1:641792/93‑1 (MQ=255) ttGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTAt > 2:2934690/1‑93 (MQ=255) tGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATc < 2:4995450/93‑1 (MQ=255) gCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATcc > 1:433777/1‑93 (MQ=255) aCGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGc < 2:163480/93‑1 (MQ=255) aCGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGc < 1:187465/93‑1 (MQ=255) aCGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGc > 2:2276154/1‑93 (MQ=255) cGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCa > 1:1404865/1‑93 (MQ=255) gCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCaa < 1:5921074/93‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAAt < 2:5515277/93‑1 (MQ=255) cTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATg > 2:6665233/1‑93 (MQ=255) cTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATg > 2:1174722/1‑93 (MQ=255) ggTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGAt < 2:2024544/93‑1 (MQ=255) gTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATa > 2:2685229/1‑93 (MQ=255) tGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATAc < 2:3210169/93‑1 (MQ=255) gCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATAcc < 1:2006417/93‑1 (MQ=255) gCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATAcc < 1:4587036/93‑1 (MQ=255) cGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCa > 1:3084218/1‑93 (MQ=255) gagaATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCAt < 2:4313575/93‑1 (MQ=255) gagaATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCAt > 1:1881251/1‑93 (MQ=255) gaATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCg > 2:2075898/1‑93 (MQ=255) aaTATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCga < 2:2395883/93‑1 (MQ=255) taataaGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGaaa > 2:3885828/1‑93 (MQ=255) taataaGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGaaa < 2:3644982/93‑1 (MQ=255) taataaGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGaaa > 1:4292613/1‑93 (MQ=255) taaGGTCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATAGAGAAATCg < 1:2933230/93‑1 (MQ=255) aaGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGa < 2:1931874/93‑1 (MQ=255) aGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGAt > 1:5710632/1‑93 (MQ=255) gggCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATa < 2:3111596/93‑1 (MQ=255) gggCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATa < 2:5296753/93‑1 (MQ=255) gggCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATa < 2:1866397/93‑1 (MQ=255) gCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGc < 1:2356424/93‑1 (MQ=255) ccATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCt > 1:4710799/1‑93 (MQ=255) ccATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCt < 2:4766526/93‑1 (MQ=255) cATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCtt > 2:5941999/1‑93 (MQ=255) aTTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTc < 1:4696538/93‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTcc > 2:2051135/1‑93 (MQ=255) ttGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTcc < 1:3866453/93‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTcc < 2:1533798/93‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTcc < 2:459164/93‑1 (MQ=255) ttGTTAATAGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTcc < 1:3723797/93‑1 (MQ=255) tGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCt < 1:2295624/93‑1 (MQ=255) tGTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCt < 2:5646864/93‑1 (MQ=255) gTTAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTg < 2:1273959/93‑1 (MQ=255) tAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGcc < 2:4145812/93‑1 (MQ=255) tAATGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGcc < 1:2141050/93‑1 (MQ=255) aTGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCaa > 1:930433/1‑93 (MQ=255) aTGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCaa < 2:3739460/93‑1 (MQ=255) aTGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCaa < 1:2422938/93‑1 (MQ=255) aTGGTGGAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCaa < 2:6109153/93‑1 (MQ=255) tggtggAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAAt > 1:2551863/1‑93 (MQ=255) ggtggAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATc > 2:89347/1‑93 (MQ=255) ggAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCttt < 1:4955432/93‑1 (MQ=255) ggAATCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCttt < 1:2032013/93‑1 (MQ=255) aTCTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGc > 1:6266502/1‑93 (MQ=255) cTTTAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTg < 2:1719404/93‑1 (MQ=255) tttAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGa > 1:948082/1‑93 (MQ=255) tttAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGa > 1:1866228/1‑93 (MQ=255) ttAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGaa > 2:4842060/1‑93 (MQ=255) ttAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGaa < 1:1185419/93‑1 (MQ=255) tAATTACCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGAAt < 2:705690/93‑1 (MQ=255) aaTTACCTGAATGTAATTCTCGCTAATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGAATg < 1:3433787/93‑1 (MQ=255) | AGCGCCCCACATTCCGGTCGCGCATGAGGCATTGCCACGCCTGGTGCGAGAATATAATAAGGGCCATTGTTAATGGTGGAATCTTTAATTGCCTGAATGTAATTCTCGCTGATATAGTTTTTATCCAGCAATGATACCATCGAGAAATCGATAGCTTCCTGCCAATCTTTTGCTGAATGT > NC_000913/3077126‑3077305 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |