| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 367,140 | C→T | A207T (GCC→ACC) | mhpR ← | transcriptional regulator for mhp operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 367,140 | 0 | C | T | 95.6% | 726.8 / NA | 230 | A207T (GCC→ACC) | mhpR | transcriptional regulator for mhp operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (79/140); minor base G (10/0); total (90/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GTCCGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGCTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTC > NC_000913/367050‑367229 | tCCGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTaa > 2:6511360/1‑93 (MQ=255) ccGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAAc > 2:5873337/1‑93 (MQ=255) ccGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAAc > 1:2646310/1‑93 (MQ=255) cGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACa < 2:1250530/93‑1 (MQ=255) gTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAt > 1:6330832/1‑93 (MQ=255) gaaCCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAtt < 2:3150703/92‑1 (MQ=255) aaCCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACAttt > 1:5808132/1‑93 (MQ=255) aCCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTc < 2:4334808/93‑1 (MQ=255) aCCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTc < 2:3503595/93‑1 (MQ=255) cccTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCg < 2:3551524/93‑1 (MQ=255) ctctTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGAt > 2:5334195/1‑93 (MQ=255) tctTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGAtt > 2:181763/1‑93 (MQ=255) tctTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGAtt > 2:2722667/1‑93 (MQ=255) ctTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTa < 2:5596382/93‑1 (MQ=255) tttGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTaa > 2:4019709/1‑93 (MQ=255) tGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACATTTCGATTAAtt > 1:3470505/1‑93 (MQ=255) ttgcgcgcgcgcGAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTc < 1:5409102/91‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcTAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCt < 1:1115488/93‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGTTTCGCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGC‑GGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCtt < 1:1483679/93‑1 (MQ=255) gcgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCt < 2:266999/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCtt < 1:5251879/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCtt < 1:6057882/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCtt < 1:1994211/93‑1 (MQ=255) gcgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTg < 1:364346/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGc < 2:1852390/93‑1 (MQ=255) cgcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCATTGc > 2:2910694/1‑93 (MQ=255) gcgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTGAACATTTCGATTAATTCCTTGCg < 2:3961648/93‑1 (MQ=255) cgcgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCgg > 2:6714364/1‑93 (MQ=255) cgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTc < 2:3796886/93‑1 (MQ=255) cgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTc < 1:2063898/93‑1 (MQ=255) cgcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATAACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTc < 2:4705870/93‑1 (MQ=255) gcCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCt > 2:2990878/1‑93 (MQ=255) ccAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCtt < 2:2843147/93‑1 (MQ=255) cAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTg > 2:5231419/1‑93 (MQ=255) aGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGt < 1:2950052/93‑1 (MQ=255) aGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGt > 2:712476/1‑93 (MQ=255) aGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAACTCCTTGCGGTCTTGt > 1:1731271/1‑93 (MQ=255) aGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGt > 1:4246472/1‑93 (MQ=255) aaTGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTc < 1:5341151/93‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCAGCTTTAACGCTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTcg > 1:2086236/1‑92 (MQ=255) tGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCg > 1:2763745/1‑93 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCgg < 2:6273419/93‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCgg < 1:476084/93‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCgg < 2:6068221/93‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCgg > 2:5645977/1‑93 (MQ=255) gCTTTCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCggg < 1:5680449/93‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCggg < 1:6730736/93‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCggg > 2:1520835/1‑93 (MQ=255) gCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCggg < 2:6278347/93‑1 (MQ=255) cTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGGTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGc > 2:6449017/1‑93 (MQ=255) ttCCAGCTTTAACGGTTTCCGTGCCAGTTGATAGTTATCACCGGGGCGGGAGCTTAACATTTCGCTTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCCGGCa > 1:6665444/1‑93 (MQ=255) tCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCaa < 2:5428139/93‑1 (MQ=255) tCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCaa > 1:1928257/1‑93 (MQ=255) aGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAg < 1:3349381/93‑1 (MQ=255) gCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAgg > 2:4059186/1‑93 (MQ=255) gCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAgg > 1:513678/1‑93 (MQ=255) ttAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTTCGGGCAAAAGgcca > 1:2436030/1‑93 (MQ=255) aaCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagc > 1:6434469/1‑93 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc > 1:4431573/1‑93 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc < 2:538693/93‑1 (MQ=255) aCGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcc > 1:1765573/1‑93 (MQ=255) cGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGgccagcca < 2:2811726/93‑1 (MQ=255) gTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAgg > 1:5937921/1‑93 (MQ=255) ttCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGt < 1:2218386/93‑1 (MQ=255) tCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTc < 2:2270084/93‑1 (MQ=255) tCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTc < 1:4050960/93‑1 (MQ=255) tCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTc < 1:3587934/93‑1 (MQ=255) ccGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAg > 1:3674315/1‑93 (MQ=255) cGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAgg < 1:6050222/93‑1 (MQ=255) tGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGcc < 1:2845514/93‑1 (MQ=255) gCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCGGCCAGGTCAGGccc > 1:5180223/1‑93 (MQ=255) gCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGCCCAGCCAGGTCAGGccc < 2:5080325/93‑1 (MQ=255) cAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGa > 2:819498/1‑93 (MQ=255) cAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGa < 2:880447/93‑1 (MQ=255) aGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAg < 1:2603713/93‑1 (MQ=255) gTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAgg < 1:4232902/93‑1 (MQ=255) gTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAgg < 2:1201324/93‑1 (MQ=255) ttGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGc < 1:213210/93‑1 (MQ=255) tGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCg < 1:229950/93‑1 (MQ=255) gATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCgg > 2:1472706/1‑93 (MQ=255) gATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCgg > 2:4226983/1‑93 (MQ=255) aTAGTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGt > 2:161027/1‑93 (MQ=255) gTCATCACCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGtttt > 2:4774298/1‑93 (MQ=255) tcatcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTc > 2:5935325/1‑93 (MQ=255) atcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAg < 2:3665968/93‑1 (MQ=255) atcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTCCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAg < 1:5617454/93‑1 (MQ=255) tcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGa > 2:1056946/1‑93 (MQ=255) tcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGa < 1:823049/93‑1 (MQ=255) tcaCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGCCAGGCCCGCGGCGGTTTTCAGa > 2:861097/1‑93 (MQ=255) aCCGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGGTTTCAGAAg > 2:3421450/1‑93 (MQ=255) ccGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGc > 2:4912068/1‑93 (MQ=255) ccGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGc < 1:3868555/93‑1 (MQ=255) ccGGGGCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGc < 2:4463651/93‑1 (MQ=255) cGGGGCGGTAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCg < 1:6499007/93‑1 (MQ=255) gggCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGc < 1:1008138/93‑1 (MQ=255) gggCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGc > 2:2625371/1‑93 (MQ=255) ggCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCa < 1:2868013/93‑1 (MQ=255) ggCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCa < 2:5711639/93‑1 (MQ=255) gCGGGAGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCaa > 2:2424007/1‑93 (MQ=255) aGGTTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTc < 2:4517967/93‑1 (MQ=255) | GTCCGTAACCCTCTTTGCGCGCGCGCGCCAGAATGGCTTCCAGCTTTAACGGTTCCCGTGCCAGTTGATAGTCATCACCGGGGCGGGAGGCTAACATTTCGATTAATTCCTTGCGGTCTTGTTCCGGGCAAAAGGCCAGCCAGGTCAGGCCCGAGGCGGTTTTCAGAAGCGGCAAACGTC > NC_000913/367050‑367229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |