Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,289,431 | T→C | G150G (GGT→GGC) | yraK → | putative fimbrial protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,289,431 | 0 | T | C | 99.7% | 917.1 / ‑5.8 | 286 | G150G (GGT→GGC) | yraK | putative fimbrial protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (158/127); total (158/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
GACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAT > NC_000913/3289342‑3289520 | gACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGAt < 1:3457505/93‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGAt < 1:4183064/93‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGCATATTCTGCTGCAACCCACACGGGTGTTTGCCAGGACGATa > 1:2291670/1‑93 (MQ=255) cAGGTTGTCTCTGTTAACAACCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACg > 1:1324074/1‑93 (MQ=255) aGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGt > 1:4670016/1‑93 (MQ=255) aGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGt > 2:2975132/1‑93 (MQ=255) ggTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtc > 2:1107207/1‑93 (MQ=255) ggTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtc < 2:458304/93‑1 (MQ=255) gTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtct < 1:3236525/93‑1 (MQ=255) gTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtct < 1:3041087/93‑1 (MQ=255) gTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtct > 2:3178192/1‑93 (MQ=255) gTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtct < 1:4347282/93‑1 (MQ=255) ttGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtctc < 2:3707012/93‑1 (MQ=255) ttGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtctc < 1:1524018/93‑1 (MQ=255) tGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCg > 2:4984040/1‑93 (MQ=255) tGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCg < 2:3580974/93‑1 (MQ=255) tcctctGTTAACCCCCGATACGCACAGATAAAAAACCACACGGTCCATTCTGCTGCAACCCAAGCGGGTGTTGGCCAGGGCCATACGTCGCGt < 1:173348/91‑1 (MQ=255) gTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGt > 1:3884016/1‑93 (MQ=255) gTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGt < 1:5938446/93‑1 (MQ=255) gTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGt > 1:6409344/1‑93 (MQ=255) tctcTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGtt < 1:1902233/93‑1 (MQ=255) tctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAt < 2:1212119/93‑1 (MQ=255) tctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAt < 1:6604878/93‑1 (MQ=255) gTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGa > 2:2545876/1‑93 (MQ=255) tAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAcc > 2:2147874/1‑93 (MQ=255) aaCACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAccc < 1:4526695/93‑1 (MQ=255) acacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCg > 1:1421402/1‑93 (MQ=255) cacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGt < 1:972017/93‑1 (MQ=255) cacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGt < 2:3318166/93‑1 (MQ=255) cacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGt < 2:5297643/93‑1 (MQ=255) cacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGt > 1:1285895/1‑93 (MQ=255) ccGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTaa < 2:3663294/93‑1 (MQ=255) ccGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTaa < 2:6673350/93‑1 (MQ=255) gATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAata > 2:721796/1‑93 (MQ=255) gATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAata < 2:5491672/93‑1 (MQ=255) ttCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATAtt < 2:537384/93‑1 (MQ=255) cacacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTgg < 2:1654455/93‑1 (MQ=255) acacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGt < 1:4302373/93‑1 (MQ=255) acacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGt > 2:414237/1‑93 (MQ=255) cacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTg > 1:2410906/1‑93 (MQ=255) acaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGc < 2:3643516/93‑1 (MQ=255) acaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGc > 1:5792038/1‑93 (MQ=255) gATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGaa < 2:5842521/93‑1 (MQ=255) aTAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAac > 2:4266339/1‑93 (MQ=255) aaaaaaCAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAacac > 1:5062601/1‑93 (MQ=255) aaaaaCAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAcacc > 2:4154945/1‑93 (MQ=255) aaaaCAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAcacca > 2:4214956/1‑93 (MQ=255) aaaCAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAcaccac > 2:6554397/1‑93 (MQ=255) aacaacACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACaccacc > 2:1957709/1‑93 (MQ=255) aacaacACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGCGGTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGCTAATATTGGTGCGAACaccacc > 1:1134530/1‑93 (MQ=255) acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCt < 1:5575468/93‑1 (MQ=255) acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTACGAACACCACCt > 1:2584061/1‑93 (MQ=255) acacGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTa > 2:5029599/1‑93 (MQ=255) acacGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTa < 2:2040742/93‑1 (MQ=255) cacGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAc < 1:177396/93‑1 (MQ=255) cGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAccc < 1:4916164/93‑1 (MQ=255) ggTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCt > 1:3180915/1‑93 (MQ=255) gTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTg > 1:1049352/1‑93 (MQ=255) tataTTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTga > 1:858465/1‑92 (MQ=255) atatTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTa < 2:1913986/93‑1 (MQ=255) tatTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTAt > 2:177468/1‑93 (MQ=255) atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg > 1:528439/1‑93 (MQ=255) atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg < 2:3433405/93‑1 (MQ=255) atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg > 2:556864/1‑93 (MQ=255) tCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTCGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTc > 1:6223492/1‑93 (MQ=255) gctgcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCAcc > 2:6261367/1‑93 (MQ=255) gctgcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCAcc > 2:4795447/1‑93 (MQ=255) ctgcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCa > 2:3942965/1‑93 (MQ=255) tgcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCaa < 2:2121786/93‑1 (MQ=255) gcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAg > 2:3156150/1‑93 (MQ=255) cAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGc < 2:4055616/93‑1 (MQ=255) aCCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCa > 1:4731182/1‑93 (MQ=255) cccAAACGGGTGTTGGCCAGTGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCAt < 1:1947794/93‑1 (MQ=255) ccAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCAtt < 2:6470510/93‑1 (MQ=255) aaaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtc > 1:5206131/1‑93 (MQ=255) aaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtct > 1:3559199/1‑93 (MQ=255) aaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtct > 1:2899517/1‑93 (MQ=255) aaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtct > 1:2729311/1‑93 (MQ=255) aaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtct > 2:159676/1‑93 (MQ=255) aCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtctc < 2:4333331/93‑1 (MQ=255) aCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtctc < 2:155506/93‑1 (MQ=255) aCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtctc < 1:6258610/93‑1 (MQ=255) aCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtctc < 1:3810585/93‑1 (MQ=255) ggTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGc > 1:396824/1‑93 (MQ=255) ggTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGGTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGc > 1:482656/1‑93 (MQ=255) ggTGTTGGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGc < 1:6707785/93‑1 (MQ=255) gtgtTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCt > 2:3544556/1‑93 (MQ=255) gtTTGCCAGGGCCATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCg > 2:1406071/1‑93 (MQ=255) ttGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGAt < 1:5113109/93‑1 (MQ=255) tGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACCCCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATg < 1:3586657/93‑1 (MQ=255) tGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATg < 1:3764572/93‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGa < 1:1028803/93‑1 (MQ=255) ccAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGAc > 1:5406475/1‑93 (MQ=255) cAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGAcc > 2:473485/1‑93 (MQ=255) aGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCa < 2:2270450/93‑1 (MQ=255) gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAt > 2:508485/1‑93 (MQ=255) gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAt > 2:5976367/1‑93 (MQ=255) gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAt > 1:4431695/1‑93 (MQ=255) gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAt > 1:6106687/1‑93 (MQ=255) gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGACATTTCTCGGCTCGCTTACCAt > 2:6368397/1‑93 (MQ=255) | GACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAT > NC_000913/3289342‑3289520 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |