Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,972,637 | 2 bp→GC | coding (430‑431/546 nt) | wecD → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,972,637 | 0 | C | G | 99.6% | 772.6 / ‑5.0 | 235 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (108/126); minor base T (0/1); total (108/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
* | NC_000913 | 3,972,638 | 0 | G | C | 99.6% | 771.4 / ‑4.7 | 236 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (108/127); minor base A (0/1); total (108/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCA > NC_000913/3972553‑3972730 || aTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTa > 1:5237367/1‑93 (MQ=255) tGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTaa > 2:5352873/1‑93 (MQ=255) cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTaaaa > 1:4311891/1‑93 (MQ=255) gACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaac > 1:1543994/1‑93 (MQ=255) aCAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaaca > 1:3671828/1‑93 (MQ=255) cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa < 2:1015244/93‑1 (MQ=255) gATGCGCTAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt < 1:2714382/93‑1 (MQ=255) gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt < 2:5731659/93‑1 (MQ=255) gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 1:4082329/1‑93 (MQ=255) gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 2:2982416/1‑93 (MQ=255) gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt < 1:1599652/93‑1 (MQ=255) aTGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACtt < 2:5477873/93‑1 (MQ=255) aTGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACtt < 1:2856628/93‑1 (MQ=255) aTGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACtt < 2:1730231/93‑1 (MQ=255) aTGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACtt < 2:2034890/93‑1 (MQ=255) tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt > 1:620563/1‑93 (MQ=255) tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt > 2:2369670/1‑93 (MQ=255) cgcgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTgg > 2:6358752/1‑92 (MQ=255) aTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTg < 2:5302087/93‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg > 2:5972411/1‑93 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg < 2:6247971/93‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAACCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCg < 1:5965163/93‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAc < 2:3736024/93‑1 (MQ=255) tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 2:2554107/1‑93 (MQ=255) tggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCaaaa > 1:1909072/1‑93 (MQ=255) ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAt < 2:6632623/93‑1 (MQ=255) ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAt > 2:3826886/1‑93 (MQ=255) ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAt < 1:2045813/93‑1 (MQ=255) gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 2:5218516/93‑1 (MQ=255) gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 1:6048015/93‑1 (MQ=255) gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 1:5514339/93‑1 (MQ=255) gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 1:1329238/93‑1 (MQ=255) ctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATgg < 1:3477100/93‑1 (MQ=255) tggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGGGGGGGGCGCCCCAAATggg > 2:2790234/1‑93 (MQ=255) ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc > 2:3494779/1‑93 (MQ=255) aCGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCaa < 1:6533522/93‑1 (MQ=255) cgcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac > 1:421509/1‑93 (MQ=255) ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc < 2:4061561/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc > 2:2503752/1‑93 (MQ=255) gTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCCACAcca > 1:2982393/1‑92 (MQ=255) cAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgccg < 2:1535412/93‑1 (MQ=255) aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 1:108532/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 1:3817890/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc < 2:4100237/93‑1 (MQ=255) aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 1:4974399/1‑93 (MQ=255) aGGCGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 2:6076767/1‑93 (MQ=255) tGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCt < 1:5624907/93‑1 (MQ=255) tGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCt < 2:4932806/93‑1 (MQ=255) tGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCt < 2:5850778/93‑1 (MQ=255) gctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCtt < 2:2089761/93‑1 (MQ=255) gctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCtt < 2:2163835/93‑1 (MQ=255) gctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCtt > 1:3167362/1‑93 (MQ=255) ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa < 2:1451741/93‑1 (MQ=255) gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa < 1:4459687/93‑1 (MQ=255) gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa < 2:4801434/93‑1 (MQ=255) agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 2:1932095/93‑1 (MQ=255) gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACg > 2:5250399/1‑93 (MQ=255) tgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGat < 2:5114308/93‑1 (MQ=255) gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 1:6584282/1‑93 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:1630402/93‑1 (MQ=255) cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata > 2:3693394/1‑93 (MQ=255) cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 2:1171444/93‑1 (MQ=255) cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 1:4688526/93‑1 (MQ=255) aaaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacatac > 1:72674/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 2:3859056/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 2:4313368/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 1:503275/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 2:2568782/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca < 2:1873208/93‑1 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 2:1419219/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 1:839044/1‑93 (MQ=255) aCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaa > 1:2473287/1‑93 (MQ=255) aCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaa > 1:2413825/1‑93 (MQ=255) aCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaa > 2:149130/1‑93 (MQ=255) aCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaa > 1:3962875/1‑93 (MQ=255) cGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGT‑AAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAg < 2:4855183/93‑1 (MQ=255) gcgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgt < 1:1965432/93‑1 (MQ=255) gcgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgt > 2:676640/1‑93 (MQ=255) cgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg < 1:6226813/93‑1 (MQ=255) cgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg > 1:5403764/1‑93 (MQ=255) cgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg > 2:6528290/1‑93 (MQ=255) gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtgg > 1:661455/1‑93 (MQ=255) gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtgg > 1:1703066/1‑93 (MQ=255) cTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt < 2:621440/93‑1 (MQ=255) tAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg > 1:3100711/1‑93 (MQ=255) aaaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGc > 2:3604274/1‑93 (MQ=255) aaaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGc > 2:3301220/1‑93 (MQ=255) aaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCg > 1:2227226/1‑93 (MQ=255) aCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGa > 1:4934937/1‑93 (MQ=255) cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 2:1367211/93‑1 (MQ=255) cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 2:447157/93‑1 (MQ=255) cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa > 1:1507543/1‑93 (MQ=255) tGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt > 2:5064996/1‑93 (MQ=255) tGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt < 1:2258436/93‑1 (MQ=255) gggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg > 1:4020137/1‑93 (MQ=255) gggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg > 1:1754126/1‑93 (MQ=255) gggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATg < 2:782267/93‑1 (MQ=255) ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGt < 1:5752359/93‑1 (MQ=255) gCGTATTCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACTCCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 1:3214690/93‑1 (MQ=255) gCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa > 2:4591248/1‑93 (MQ=255) || AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAGAAAGCA > NC_000913/3972553‑3972730 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |