Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,870,631 | Δ1 bp | coding (610/1764 nt) | dgoA ← | 2‑oxo‑3‑deoxygalactonate 6‑phosphate aldolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,870,630 | 0 | C | . | 99.4% | 2412.7 / 1.7 | 506 | coding (611/1764 nt) | dgoA | 2‑oxo‑3‑deoxygalactonate 6‑phosphate aldolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base . (276/226); total (277/229) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.26e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 529 total aligned reads displayed.
GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCC > NC_000913/3870536‑3870721 | gCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGGGATTTTCATTGCAct > 1:5657660/1‑95 (MQ=255) ccccAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCActg > 2:6808329/1‑94 (MQ=255) cAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCct > 1:9098223/1‑96 (MQ=255) aaCCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCctc > 1:6893352/1‑96 (MQ=255) aaCCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGAAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCctc > 2:12786907/1‑96 (MQ=255) ccGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCtctc > 2:12986133/1‑96 (MQ=255) cGACCCCGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCg < 2:882728/96‑1 (MQ=255) gACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGa < 1:9479279/96‑1 (MQ=255) gACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGa < 2:3860484/96‑1 (MQ=255) aCCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAt < 1:13550294/96‑1 (MQ=255) aCCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGGGGTAATTTTGGGGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAt > 2:5555860/1‑96 (MQ=255) aCGCCTTCATCGTTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGTTTTTCACTGCA‑CTGCCTCTCGATACg < 1:13223645/96‑1 (MQ=255) aCGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACg < 1:7364595/96‑1 (MQ=255) cGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGc < 2:1802950/96‑1 (MQ=255) ccTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCt > 2:11621098/1‑96 (MQ=255) cctCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt > 1:11874846/3‑96 (MQ=255) cTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt > 1:2918442/1‑96 (MQ=255) cTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt < 2:7360694/96‑1 (MQ=255) cTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCtt < 2:4752540/96‑1 (MQ=255) ttCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTa < 1:12024882/96‑1 (MQ=255) ttCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTa > 2:8621715/1‑96 (MQ=255) cATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAAc > 2:10770505/1‑96 (MQ=255) cGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGGTACGTGGGAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACaaa > 1:4599234/1‑96 (MQ=255) ggTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAt < 2:13529785/96‑1 (MQ=255) ggTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAt > 1:1711869/1‑96 (MQ=255) gTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtg < 2:8269472/96‑1 (MQ=255) gTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGAAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCATCTCGATACGCCTTAACAAAtg > 2:9382702/1‑96 (MQ=255) ttCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgct < 1:10369555/96‑1 (MQ=255) atCAATCTTCAGGACCATCAAGCCGGGAGGTAACCGATACGTTGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtttt < 1:3524667/95‑4 (MQ=255) cAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgc > 1:4763132/1‑96 (MQ=255) aaTTTTCAGGAACTTCCAGCGATGATGTAAACGATACGTTGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGTCTCTCGATACTCCTTAACAAAtgctgct < 2:13905784/96‑1 (MQ=255) aaTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgct < 1:1956541/96‑1 (MQ=255) aaTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgct > 1:2212263/1‑96 (MQ=255) aTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctg > 2:6109887/1‑96 (MQ=255) aTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctg > 1:9984541/1‑96 (MQ=255) aTTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATAAGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctg < 1:3238239/96‑1 (MQ=255) ttttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctgc < 2:2456986/96‑1 (MQ=255) ttttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAAtgctgctgc > 1:5317374/1‑96 (MQ=255) tttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcc < 1:8725548/96‑1 (MQ=255) tttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcc > 1:13979096/1‑96 (MQ=255) ttCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTCATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACTAATGctgctgcct < 1:11004103/96‑1 (MQ=255) tCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctg < 1:9698316/96‑1 (MQ=255) tCAGGAACATCCAGCGGGGAGGCAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGAt < 2:10285941/71‑1 (MQ=255) aGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctgct < 1:8907855/96‑1 (MQ=255) aGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctgct > 1:10016127/1‑96 (MQ=255) ggAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGctgctgcctgctg < 1:4099501/96‑1 (MQ=255) aaCATCCAGCTGTGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcg < 1:13385592/96‑1 (MQ=255) aaCATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcg > 2:3580890/1‑96 (MQ=255) aaCATCCAGCGGGGAGGCAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcg > 1:6176949/1‑96 (MQ=255) aCATCCAGCGGGGAGGAAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTgcgc > 2:13233635/1‑96 (MQ=255) tCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGt > 2:13741645/1‑96 (MQ=255) tCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGt < 1:12567611/96‑1 (MQ=255) cAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgc < 1:8386083/96‑1 (MQ=255) cAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgc < 1:4982254/96‑1 (MQ=255) cAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgc < 2:3163049/96‑1 (MQ=255) gtggggAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTgcgc > 1:10587055/3‑96 (MQ=255) ggAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTa < 1:708547/96‑1 (MQ=255) ggggTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTAc > 1:13016852/3‑96 (MQ=255) gAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTAc > 2:1651327/1‑96 (MQ=255) gggTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACg > 1:11392669/2‑96 (MQ=255) aGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACg > 2:5075138/1‑96 (MQ=255) ggTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACgg < 2:13191326/96‑1 (MQ=255) tAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAt > 2:12061665/1‑96 (MQ=255) aaaCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAtt > 2:12559101/1‑96 (MQ=255) aaaCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAtt > 2:8350317/1‑96 (MQ=255) aaaCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGAtt < 1:8633547/96‑1 (MQ=255) aCGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGc < 2:11459710/96‑1 (MQ=255) gATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTCAGCTCTACGGATTGccc > 1:12773851/1‑96 (MQ=255) aTACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCg > 1:13665633/1‑96 (MQ=255) aTACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCg < 1:6629059/96‑1 (MQ=255) tACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCgg > 2:11019491/1‑96 (MQ=255) tACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCgg > 1:2045823/1‑96 (MQ=255) aCGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCgcc < 1:7543569/96‑3 (MQ=255) cGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcg < 2:1050690/96‑1 (MQ=255) cGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcg > 1:8196377/1‑96 (MQ=255) gTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcgc < 2:6195702/96‑1 (MQ=255) gTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCAGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGgcgc > 2:14125301/1‑96 (MQ=255) tAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATa > 2:4375893/1‑96 (MQ=255) tAATTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATa < 1:10770505/96‑1 (MQ=255) aTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATaga > 1:256573/1‑96 (MQ=255) aTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATaga > 2:14302655/1‑96 (MQ=255) aTTTTGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATaga > 2:6477024/1‑96 (MQ=255) ttttGGTGATTTTCATTGCA‑CTTCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATagag < 2:11274507/96‑1 (MQ=255) ttttGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCAGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATagag < 2:2210028/96‑1 (MQ=255) tttGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAgaga > 1:14061122/1‑96 (MQ=255) ttGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGAt > 2:2674376/1‑96 (MQ=255) tGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGGGCGATAGAGATc > 2:2930630/1‑96 (MQ=255) tGGTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATc < 1:1012597/96‑1 (MQ=255) gTGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGc > 1:3875558/1‑96 (MQ=255) tGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGTTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCt > 2:12251626/1‑96 (MQ=255) tGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCt < 2:12694559/96‑1 (MQ=255) tGATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCt < 2:9222295/96‑1 (MQ=255) gATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGTCATAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTg < 1:10863522/96‑1 (MQ=255) gATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTg < 2:11906834/96‑1 (MQ=255) gATTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTg > 2:9710984/1‑96 (MQ=255) aTTTTCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGTCGCGATATAGATCGCTGc > 2:5320371/1‑96 (MQ=255) tttCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCt < 2:700340/96‑1 (MQ=255) ttCATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTa < 2:2044115/96‑1 (MQ=255) cATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGCTAGAGATCGCTGCCTAAg > 1:1211535/1‑96 (MQ=255) cATTGCA‑CTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAg > 2:4105768/1‑96 (MQ=255) | GCCCCAACCGACCACGCCTTCATCGGTTTCAATTTTCAGGAACATCCAGCGGGGAGGTAAACGATACGTGGTAATTTTGGTGATTTTCATTGCACCTGCCTCTCGATACGCCTTAACAAATGCTGCTGCCTGCTGCGCGGTGCGCTCTACGGATTGCCCGGCGCGATAGAGATCGCTGCCTAAGCC > NC_000913/3870536‑3870721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |