| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,979,546 | Δ1 bp | coding (1047/1386 nt) | yifK → | putative amino acid/amine transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,979,545 | 0 | G | . | 99.8% | 2448.0 / ‑3.5 | 510 | coding (1046/1386 nt) | yifK | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (258/251); minor base C (0/1); total (258/252) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 538 total aligned reads displayed.
CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > NC_000913/3979451‑3979636 | aCCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 2:11149969/1‑96 (MQ=255) ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTAc > 1:12427412/1‑96 (MQ=255) ggcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat < 2:3121302/96‑1 (MQ=255) gcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatc > 1:4119677/1‑96 (MQ=255) gcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt < 2:13463923/96‑1 (MQ=255) gcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt < 2:7951968/96‑1 (MQ=255) cAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc < 1:9040639/96‑1 (MQ=255) aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTTTTGCTATTCTGCT‑GATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc > 2:10476941/1‑96 (MQ=255) tagCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa > 1:7774170/3‑96 (MQ=255) tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa < 1:11241927/96‑1 (MQ=255) ggCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCaa < 2:10178868/96‑1 (MQ=255) gCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt < 2:4284314/96‑1 (MQ=255) gCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt > 2:4978650/1‑96 (MQ=255) cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc < 1:9583458/96‑1 (MQ=255) cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc < 1:2326589/96‑1 (MQ=255) gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 2:8308084/96‑1 (MQ=255) gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc > 1:6120503/1‑96 (MQ=255) aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg < 2:13089575/96‑1 (MQ=255) aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGc < 1:1648227/96‑1 (MQ=255) aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGc < 2:353943/96‑1 (MQ=255) aGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCa < 2:5085343/96‑1 (MQ=255) gTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCaa < 1:11353353/96‑2 (MQ=255) tgtCCCGTCACGGCGTCCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc < 1:12793290/94‑1 (MQ=255) ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgt < 1:7158121/96‑1 (MQ=255) ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGCGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCACCgtgg > 1:3203903/1‑95 (MQ=255) gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt < 2:13331205/96‑1 (MQ=255) tCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 1:3508275/96‑1 (MQ=255) tCACGGCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt > 2:6963219/1‑96 (MQ=255) cACGGCGTACCGGTTGCGAGTGTGGCATTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGttt < 2:8948738/96‑1 (MQ=255) aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTg < 2:1996259/96‑1 (MQ=255) cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt > 1:2454350/1‑96 (MQ=255) cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt > 2:7666623/1‑96 (MQ=255) ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCTAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc > 2:1750097/1‑96 (MQ=255) ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCTGCAGCGTGTGTTTgtc > 2:7332264/1‑96 (MQ=255) gCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct < 2:8633631/96‑1 (MQ=255) gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctcc < 1:9301011/96‑3 (MQ=255) gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac > 2:9285828/1‑96 (MQ=255) gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac < 2:6051013/96‑1 (MQ=255) tACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg > 1:7421127/1‑96 (MQ=255) ccGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc < 1:7231667/96‑1 (MQ=255) cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct < 2:1183053/96‑1 (MQ=255) cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct > 2:5763502/1‑96 (MQ=255) ggTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtcta < 1:14426138/96‑1 (MQ=255) tGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg > 1:6504354/1‑96 (MQ=255) tGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg < 2:12113268/96‑1 (MQ=255) cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTg > 1:14024448/1‑96 (MQ=255) cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTg > 1:14221791/1‑96 (MQ=255) gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGc < 1:13503957/96‑1 (MQ=255) tgtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg < 2:185982/96‑1 (MQ=255) gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc < 2:2682388/96‑1 (MQ=255) gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc < 2:139787/96‑1 (MQ=255) tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCg > 2:14384406/1‑96 (MQ=255) ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 2:2765430/1‑96 (MQ=255) ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 2:5514675/1‑96 (MQ=255) gCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg > 1:6368768/1‑96 (MQ=255) cAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGc > 2:4497455/1‑96 (MQ=255) cAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACAGCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGCTTGTCTACGTCTACGGTGCCAGCGtcc > 1:4424274/1‑94 (MQ=255) ggaTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt > 1:10052736/3‑96 (MQ=255) gTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt < 2:11459166/96‑1 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 2:10001701/96‑1 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 2:5260511/96‑1 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc > 1:6724342/1‑96 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 1:5987525/96‑1 (MQ=255) tCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACTTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg > 1:10317009/1‑96 (MQ=255) tCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg < 1:119374/96‑1 (MQ=255) cTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 1:4747216/1‑96 (MQ=255) tATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTGCTTCCggg < 1:1515360/96‑1 (MQ=255) aTTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgggg < 1:2656894/96‑1 (MQ=255) tGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt < 1:2038328/96‑1 (MQ=255) tGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt > 1:8032137/1‑96 (MQ=255) gCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 1:2209418/96‑1 (MQ=255) gCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 2:4626217/96‑1 (MQ=255) gCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 2:638968/96‑1 (MQ=255) cTATTCTGCTAAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCAAATCCGCAGCGGGTGTTTGTCTACTTCTCCAGTGCCAGCGTGCTTCGGGGGATg > 1:8403792/1‑96 (MQ=255) cTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg < 2:3745961/96‑1 (MQ=255) tCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc > 2:2421833/1‑96 (MQ=255) cggCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa > 1:8227463/3‑96 (MQ=255) cTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa < 1:5859532/96‑1 (MQ=255) cTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa > 2:10645847/1‑96 (MQ=255) tGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:13615607/96‑1 (MQ=255) tGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:5547813/96‑1 (MQ=255) gCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATg > 1:370528/1‑96 (MQ=255) cT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAtcg < 1:10517536/96‑3 (MQ=255) cT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATgg > 2:3257630/1‑96 (MQ=255) t‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGt > 1:1089104/1‑96 (MQ=255) t‑AATTGGCTCATGACT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTCCGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGt < 1:11585646/96‑1 (MQ=255) attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt > 1:13219130/5‑96 (MQ=255) attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 1:4972532/92‑1 (MQ=255) attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 1:870925/92‑1 (MQ=255) attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 2:11349414/92‑1 (MQ=255) tggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgt < 2:6504354/94‑1 (MQ=255) tggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgt > 1:9775641/3‑96 (MQ=255) ggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg > 1:2785818/2‑96 (MQ=255) ggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg < 2:12988275/95‑1 (MQ=255) ggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGCGTTTGTCTACGTCTCCAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgat > 1:13102069/2‑94 (MQ=255) cTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGat < 2:9660892/96‑1 (MQ=255) aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATAtt > 2:7085653/1‑96 (MQ=255) tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTg > 1:5231722/1‑96 (MQ=255) tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTg < 2:13828916/96‑1 (MQ=255) tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTg < 2:12545241/96‑1 (MQ=255) | CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > NC_000913/3979451‑3979636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |