| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,573,700 | +C | intergenic (+403/+997) | yhgN → / ← gntK | hypothetical protein/gluconokinase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,573,700 | 1 | . | C | 99.8% | 1562.4 / ‑4.3 | 411 | intergenic (+403/+997) | yhgN/gntK | hypothetical protein/gluconokinase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (209/201); total (210/201) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
TTAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCG > NC_000913/3573605‑3573789 | ttAAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACg < 1:13155867/96‑1 (MQ=255) aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgct < 2:136741/96‑3 (MQ=255) aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgct > 2:5640332/1‑94 (MQ=255) aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAACgct > 1:5501921/1‑94 (MQ=255) aaaCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTCAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgct < 2:9618834/96‑3 (MQ=255) aCAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc > 1:8523977/1‑92 (MQ=255) 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aCGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGt > 2:5876699/1‑96 (MQ=255) cGGTGGCAGACCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTg < 2:6562872/96‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCCGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTg < 1:5656339/96‑1 (MQ=255) ggTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCATCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGc < 1:7042022/96‑1 (MQ=255) ggTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGTAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGc > 1:9150723/1‑96 (MQ=255) ggTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGc > 2:7721267/1‑96 (MQ=255) gaggCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGcc > 1:7565591/3‑96 (MQ=255) gTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGcc > 2:6087637/1‑96 (MQ=255) 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gatgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTc < 2:11941469/96‑1 (MQ=255) atgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCa < 2:4756094/96‑1 (MQ=255) tgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCaa < 2:2841861/96‑1 (MQ=255) tgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCaa < 1:11552224/96‑1 (MQ=255) gcACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCa < 2:7565591/96‑1 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGTCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGc > 1:8120137/1‑96 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCatc < 1:11814461/96‑3 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGc > 1:11712218/1‑96 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGc > 2:1225597/1‑96 (MQ=255) gCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCAcc < 2:4555141/96‑1 (MQ=255) aGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg < 1:2534706/96‑1 (MQ=255) aGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg < 2:13741804/96‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGt > 2:12561217/1‑96 (MQ=255) cTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGACCAGGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGGGCCGGAGCTATGCCAGAGTCATACAGCAGCTGta > 1:9882623/1‑95 (MQ=255) tGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGttt > 2:333300/1‑96 (MQ=255) gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAATCAGCACCTGTTTg < 1:10938989/96‑1 (MQ=255) gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTg > 2:731143/1‑96 (MQ=255) gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTg < 1:9666816/96‑1 (MQ=255) cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGaa > 2:7975387/1‑96 (MQ=255) cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGaa > 2:11568488/1‑96 (MQ=255) cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGaa < 2:12806477/96‑1 (MQ=255) aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAac < 2:1822177/96‑1 (MQ=255) aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAac > 1:13493659/1‑96 (MQ=255) aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAac > 1:4028870/1‑96 (MQ=255) aCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcg > 2:131035/1‑96 (MQ=255) gAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGCACAcgcc > 1:4844936/1‑96 (MQ=255) gAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgcc < 1:14109080/96‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg < 2:6244779/96‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg > 1:3065970/1‑96 (MQ=255) aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg > 2:12776882/1‑96 (MQ=255) aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGCCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGCGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccg < 1:6886527/96‑1 (MQ=255) aGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgccgg > 2:10389226/1‑95 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |