| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 543 (0.970) | 171/184 | 0.1 | 67.3% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 527 (0.940) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 592 total aligned reads displayed.
GGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAG > NC_000913/365432‑365622 | aaggtattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac < 1:14099421‑M1/1‑1 (MQ=255)aaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 2:4517292‑M1/96‑96 (MQ=255)aaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac < 2:11863545‑M1/1‑1 (MQ=255)aaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 2:7270901‑M1/96‑96 (MQ=255)aaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac < 1:2666777‑M1/1‑1 (MQ=255) aggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 2:11453351‑M1/95‑96 (MQ=255) gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa < 1:11717351‑M1/4‑1 (MQ=255) gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa > 2:2073092‑M1/93‑96 (MQ=255) gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa < 1:4048324‑M1/4‑1 (MQ=255) cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAg > 1:9533015‑M1/92‑96 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCt < 1:7883041‑M1/7‑1 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCt < 1:6965218‑M1/7‑1 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgtcttaaCATAGCt < 1:11923899‑M1/7‑1 (MQ=255) taaagaacagaccgcctgatgtcagttgaaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTg < 2:13902968‑M1/8‑1 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGt < 2:2451786‑M1/9‑1 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGt < 1:7531632‑M1/9‑1 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagatggtcacaattttgatacgttttaaCATAGATGt < 2:3300893‑M1/9‑1 (MQ=255) aagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt > 2:1555966‑M1/87‑96 (MQ=255) gaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaatgccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc > 1:12660705‑M1/85‑96 (MQ=255) gaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 1:9906066‑M1/12‑1 (MQ=255) gaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 2:12924025‑M1/12‑1 (MQ=255) acagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt < 2:3503921‑M1/14‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt < 2:1076556‑M1/16‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt < 2:12686006‑M1/16‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt > 2:12223349‑M1/81‑96 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt < 2:516537‑M1/16‑1 (MQ=255) accgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt > 1:3207435‑M1/79‑96 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 1:977092‑M1/21‑1 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 2:7955549‑M1/21‑1 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa > 2:14161827‑M1/76‑96 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 1:1441193‑M1/21‑1 (MQ=255) ctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt < 2:7782117‑M1/23‑1 (MQ=255) tgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt < 2:2929092‑M1/24‑1 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg < 1:8485934‑M1/25‑1 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg < 2:12057447‑M1/25‑1 (MQ=255) gtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 1:10634673‑M1/28‑1 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc > 1:10820375‑M1/67‑96 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 2:4351222‑M1/66‑96 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCg > 2:8916671‑M1/65‑96 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaaatttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCg > 2:3022867‑M1/65‑96 (MQ=255) ttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc < 1:1782454‑M1/33‑1 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 2:11285358‑M1/64‑96 (MQ=255) tgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCt < 1:5302794‑M1/34‑1 (MQ=255) aggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt > 2:11090293‑M1/57‑96 (MQ=255) ggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAtt > 1:10029473‑M1/56‑96 (MQ=255) ggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGATTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAtt < 2:6471459‑M1/41‑1 (MQ=255) caaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCca > 1:6688499‑M1/53‑96 (MQ=255) cggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaac < 1:3536518‑M1/50‑1 (MQ=255) ggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:6853836‑M1/51‑1 (MQ=255) ggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:5608362‑M1/51‑1 (MQ=255) ggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca > 1:2881743‑M1/46‑96 (MQ=255) ccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 2:1782454‑M1/44‑96 (MQ=255) caaaaccagcagtaagggggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTGTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAc < 1:2054987‑M1/54‑1 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAc > 2:13787607‑M1/43‑96 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAc < 2:13586211‑M1/54‑1 (MQ=255) aaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATact > 1:13902968‑M1/42‑95 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGa > 1:7234576‑M1/41‑96 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAGTCCACACAACATACGa < 1:12165021‑M1/56‑1 (MQ=255) aaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg > 1:5053976‑M1/40‑96 (MQ=255) 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2:12577789‑M1/92‑1 (MQ=255) aaCATCGCTGTTGCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCCCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATg > 2:2800107‑M1/3‑96 (MQ=255) CATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAg < 1:2492884‑M1/96‑1 (MQ=255) CATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAg < 2:10504406‑M1/96‑1 (MQ=255) | GGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAG > NC_000913/365432‑365622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |