| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,652,626 | T→C | E180E (GAA→GAG) | rspA ← | starvation sensing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,652,626 | 0 | T | C | 99.8% | 2217.6 / NA | 568 | E180E (GAA→GAG) | rspA | starvation sensing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (290/277); minor base A (1/0); total (291/277) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 623 total aligned reads displayed.
ATGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGTTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAGGGATTCCGCA > NC_000913/1652533‑1652718 | aTGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGctc > 1:4871659/1‑96 (MQ=255)aTGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGctc > 1:6602982/1‑96 (MQ=255)aTGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGGATTTCTCCGTCGACCACAGCTGctc > 2:2254930/1‑96 (MQ=255) tGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGCTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGctct < 2:11638266/96‑1 (MQ=255) gcagcaAATGTTCTTTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGctctt > 1:13473068/1‑96 (MQ=255) gcagcaAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGctctt > 2:6527731/1‑96 (MQ=255) agcaAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTcc < 2:13413006/96‑1 (MQ=255) agcaAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTcc < 1:11903045/96‑1 (MQ=255) aaaTGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGc > 1:3019799/1‑96 (MQ=255) tGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAGCAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCaa > 1:6429372/1‑95 (MQ=255) tGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCAc > 2:4538694/1‑96 (MQ=255) tGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCAc > 1:4412472/1‑96 (MQ=255) tGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCAc < 1:12010072/96‑1 (MQ=255) tCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGt < 2:2899859/96‑1 (MQ=255) cATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTc < 1:7532439/96‑1 (MQ=255) tAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCtt > 2:10333523/1‑96 (MQ=255) aaaaCCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCttt > 1:4526349/1‑96 (MQ=255) aaaCCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCGCAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTg > 1:12244815/1‑96 (MQ=255) aaCCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTgg < 1:10053199/96‑1 (MQ=255) aaCCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTgg > 2:639080/1‑96 (MQ=255) aaaCTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGc > 2:434283/1‑96 (MQ=255) aaaCTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGc < 2:13577788/96‑1 (MQ=255) accTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCATAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCg < 2:6657702/94‑1 (MQ=255) aCTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCgg < 2:2499768/96‑1 (MQ=255) aCTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCgg > 2:9649522/1‑96 (MQ=255) aCTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCgg < 1:5564136/96‑1 (MQ=255) tGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGtt > 2:2667288/1‑96 (MQ=255) gTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTc < 2:12197160/96‑1 (MQ=255) ttACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCa < 1:8952975/96‑1 (MQ=255) tACGTACCGCGTCAAACAATTCCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCCCAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCAt < 2:913984/96‑1 (MQ=255) aCGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATa > 2:4880401/1‑96 (MQ=255) aCGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTGGCGGGTTCTTa > 2:5865866/1‑96 (MQ=255) aCGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATATCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTAATa > 1:12950202/1‑96 (MQ=255) cGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATaa < 1:4048887/96‑1 (MQ=255) cGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATaa < 2:7840846/96‑1 (MQ=255) gTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAg > 2:5677566/1‑96 (MQ=255) aCCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGcc > 2:9284986/1‑96 (MQ=255) ccGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGCCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCa < 1:10656118/96‑1 (MQ=255) gcgTCAAACAATTTCGGCATTAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGa < 1:9620569/96‑1 (MQ=255) cgTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGac > 2:1588079/1‑96 (MQ=255) tCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacct > 2:11784044/1‑96 (MQ=255) tCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacct < 1:9861559/96‑1 (MQ=255) cAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacctt < 1:1999692/96‑1 (MQ=255) cAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacctt > 2:8097277/1‑96 (MQ=255) aaaCAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGaccttt < 2:13992895/96‑1 (MQ=255) cAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacctttacc < 2:708000/96‑1 (MQ=255) aaTTTCGGCATGAAATCGAGGGATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAATCCAGacctttacct > 1:1695335/1‑96 (MQ=255) aTTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTTGTTGCGGGTTCATAAGCAAGacctttacctt < 1:13855303/96‑1 (MQ=255) aTTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacctttacctt < 1:1234349/96‑1 (MQ=255) tttCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGacctttaccttt < 2:5501505/96‑1 (MQ=255) ttCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTc < 2:13169484/96‑1 (MQ=255) tCGGCATGAAATCGAGGTATGTCTCCGACGACCTCTGCTGCTCTTCCGGCCCCTGTCCTTGGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCg < 2:1785283/96‑1 (MQ=255) ggCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGAc < 2:11322172/96‑1 (MQ=255) ggCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGAc < 2:4061315/96‑1 (MQ=255) ggCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGAc > 2:3846313/1‑96 (MQ=255) ggCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGGCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGAc > 2:14150348/1‑96 (MQ=255) tGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGc > 1:8138593/1‑96 (MQ=255) tGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGc > 2:11964476/1‑96 (MQ=255) tGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGc > 2:3295774/1‑96 (MQ=255) gAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGcc > 1:1153953/1‑96 (MQ=255) gAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGcc > 2:7194557/1‑96 (MQ=255) aaaTCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCg > 1:2315631/1‑96 (MQ=255) aaaTCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCg < 2:3155080/96‑1 (MQ=255) aagcGAGTTATTTCTCCCTCGACCACAGCTGCTCTTCCCGCCACTGTCCTTTGGTTGCGTGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGt < 1:1358608/93‑1 (MQ=255) aaTCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGt > 2:5350556/1‑96 (MQ=255) aTCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTa > 1:6002750/1‑96 (MQ=255) aTCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTa < 2:14340254/96‑1 (MQ=255) aTCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTa < 1:12507821/96‑1 (MQ=255) tCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTTTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAg < 1:14377165/96‑1 (MQ=255) tCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAg < 1:7308996/96‑1 (MQ=255) gAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAggt > 2:3656092/1‑96 (MQ=255) aGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTACCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAggtg < 1:12726310/96‑1 (MQ=255) ggTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAggtgg > 2:12420718/1‑96 (MQ=255) ggTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAggtgg > 1:3361782/1‑96 (MQ=255) gctATTTCTCTGTCGACCCCGGCTGTTCTTCCGGCCAGTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAggtgg < 1:5308406/94‑1 (MQ=255) tATTTCTCCGTCGGCCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGtt > 1:10958331/1‑96 (MQ=255) tATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGtt > 2:8825221/1‑96 (MQ=255) tATTTCTCCGTCGACCAAAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGtt < 2:7348355/96‑1 (MQ=255) aTTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGttt > 1:9169460/1‑96 (MQ=255) tttCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGtttt < 2:7557102/96‑1 (MQ=255) ctcCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCAt > 2:10565063/1‑96 (MQ=255) ctcCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCAt < 1:3665018/96‑1 (MQ=255) tcCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATa < 1:2803898/96‑1 (MQ=255) tcCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATa < 1:8553528/96‑1 (MQ=255) ccGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATAc < 1:8695006/96‑1 (MQ=255) ccGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATAc < 1:6271815/96‑1 (MQ=255) ccGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTCGCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCAttc < 1:10285931/96‑3 (MQ=255) tCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAg > 2:5019893/1‑96 (MQ=255) cGACCCCAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTCCCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAgg < 1:2512903/96‑1 (MQ=255) cGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAgg > 2:8509427/1‑96 (MQ=255) gACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAggg > 2:6860999/1‑96 (MQ=255) gACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAggg < 1:11230372/96‑1 (MQ=255) gACCACAGCTGCTCTCCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAggg < 1:7053338/96‑1 (MQ=255) aCCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATGAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAGGGa > 2:12884635/1‑96 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |