Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,608,595 | 2 bp→GC | intergenic (+23/‑369) | prfC → / → osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,608,595 | 0 | C | G | 99.8% | 1850.0 / ‑5.8 | 486 | intergenic (+23/‑370) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (225/260); minor base T (1/0); total (226/260) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
* | NC_000913 | 4,608,596 | 0 | G | C | 99.6% | 1898.4 / NA | 486 | intergenic (+24/‑369) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/OsmY |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (225/259); minor base A (1/1); total (226/260) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 505 total aligned reads displayed.
TGGTCAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCC > NC_000913/4608505‑4608685 || tGGTCAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCt < 1:7866948/96‑1 (MQ=255) ggTCAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTg > 1:5520905/1‑96 (MQ=255) gTCAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgc < 2:7566032/96‑1 (MQ=255) gTCAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgc < 1:971362/96‑1 (MQ=255) acAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTGCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTgcg < 2:9016637/95‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGccc > 2:3736425/1‑96 (MQ=255) aCCTGCGCCGGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGccc > 1:14249082/1‑96 (MQ=255) cTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTg < 2:12473322/96‑1 (MQ=255) tGCGCCGGGCCCAGGAACCTTATCCGGACGTTCAGTTACACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGt < 1:4736509/96‑1 (MQ=255) cgcCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTGGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCCGTCa > 2:3257017/1‑96 (MQ=255) gcCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCaa > 2:246865/1‑96 (MQ=255) gcCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCaa > 1:725228/1‑96 (MQ=255) gcCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCaa < 1:13120896/96‑1 (MQ=255) cTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAtt > 1:8777540/1‑96 (MQ=255) tGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAttt > 1:14132265/1‑96 (MQ=255) tGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAAttt > 1:3539794/1‑96 (MQ=255) gtcacaGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTc < 1:12875274/94‑1 (MQ=255) gCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTcc < 1:10769562/96‑1 (MQ=255) cacaGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGTGGTAGCGGCGGCGACCGGTCAATTTccc > 1:7505794/1‑96 (MQ=255) cacaGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTccc > 2:1593717/1‑96 (MQ=255) acaGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCcct > 2:11449069/1‑96 (MQ=255) aGGAACTTTAACCGGCCGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAAAATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCcctgc < 1:9385685/96‑3 (MQ=255) aGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttc < 2:10943185/96‑1 (MQ=255) ggAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCccttcc > 2:8375705/1‑96 (MQ=255) ttATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCttatta < 1:8471359/96‑1 (MQ=255) ccGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCg < 2:11960781/96‑1 (MQ=255) cGGCCGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGc < 1:3256704/96‑1 (MQ=255) ggACGTTCAGTTCCCCCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCt < 2:1292786/96‑1 (MQ=255) ggACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCt > 2:8231442/1‑96 (MQ=255) ggACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCt > 1:4230133/1‑96 (MQ=255) gACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt > 1:9235821/1‑96 (MQ=255) gACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCtt < 2:13766440/96‑1 (MQ=255) aCGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTa < 2:5086060/96‑1 (MQ=255) cGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTAc > 2:5524453/1‑96 (MQ=255) gTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACg > 1:5123730/1‑96 (MQ=255) gTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACg < 2:2216902/96‑1 (MQ=255) gTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACg < 1:1595027/96‑1 (MQ=255) ttCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACgg > 2:4336537/1‑96 (MQ=255) tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTTATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGa > 1:4535854/1‑96 (MQ=255) tCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGa > 2:12209120/1‑96 (MQ=255) cAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGaa > 2:2559652/1‑96 (MQ=255) aGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAt > 1:6125272/1‑96 (MQ=255) aGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAAt < 2:578732/96‑1 (MQ=255) ttCCACCAGACCCGCGAGCATTATTTCGTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCAGTCAATTGCCCTTCCTCATTAGCCGCGTACGGAATGt < 1:10106091/96‑1 (MQ=255) ttCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt < 2:14259960/96‑1 (MQ=255) ttCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGt < 1:12014423/96‑1 (MQ=255) tCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGtt > 1:8138406/1‑96 (MQ=255) ccaccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTc > 2:10286252/1‑96 (MQ=255) caccaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCt > 2:8498244/1‑96 (MQ=255) accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCtt < 2:6670143/96‑1 (MQ=255) accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCtt > 2:5304741/1‑96 (MQ=255) accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCtt < 2:8777540/96‑1 (MQ=255) accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCtt < 2:14372375/96‑1 (MQ=255) accaGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCtt > 2:13874098/1‑96 (MQ=255) cgccccGCGAGCCTTCATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGCAGCCGCTGCCCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACCGCATGTTCTTaaa < 1:2115809/93‑1 (MQ=255) aGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaa < 1:267737/96‑1 (MQ=255) gACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCTCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa < 2:4726445/96‑1 (MQ=255) gACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTaaaa > 1:11490309/1‑96 (MQ=255) aCCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAAc < 1:9860290/96‑1 (MQ=255) ccGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAt > 1:2996629/1‑96 (MQ=255) cgcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt < 2:10760634/96‑1 (MQ=255) cgcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt < 1:2312170/96‑1 (MQ=255) cgcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACAtt < 2:9554639/96‑1 (MQ=255) gcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTc < 1:13236246/96‑1 (MQ=255) gcgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTc > 1:6883304/1‑96 (MQ=255) cgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCa > 2:13561101/1‑96 (MQ=255) cgAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCa < 2:10607459/96‑1 (MQ=255) gAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCAc < 2:1950495/96‑1 (MQ=255) gAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCAc > 2:7366447/1‑96 (MQ=255) aGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACt < 1:5838651/96‑1 (MQ=255) cATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACttt > 1:4360702/1‑96 (MQ=255) cATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACttt > 1:13369214/1‑96 (MQ=255) cATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACttt < 1:6584798/96‑1 (MQ=255) cttAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACtttt > 1:11297554/2‑96 (MQ=255) tAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGc < 1:5302715/96‑1 (MQ=255) tAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGc < 2:2838534/96‑1 (MQ=255) aaTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCt > 1:5689501/1‑96 (MQ=255) aaTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCt > 2:9317598/1‑96 (MQ=255) aTTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCtt < 1:12266761/96‑1 (MQ=255) tCTTGCCTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTAt < 2:6615004/96‑1 (MQ=255) tGCCTCCCGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGtt < 2:2062985/96‑1 (MQ=255) ccTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGtttt < 2:6095215/96‑1 (MQ=255) cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGTATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc > 1:1768537/1‑96 (MQ=255) cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc > 2:7112917/1‑96 (MQ=255) cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc < 2:13111291/96‑1 (MQ=255) cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc > 2:11713268/1‑96 (MQ=255) cTCCAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTc < 1:9014570/96‑1 (MQ=255) cccAGGGCGCGGTCGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCg < 1:4923222/95‑1 (MQ=255) cggggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCt > 1:11000532/3‑96 (MQ=255) cAGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCt > 1:11824674/1‑96 (MQ=255) aGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTg > 1:13669165/1‑96 (MQ=255) aGGGCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTg > 2:6386056/1‑96 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTgtt < 1:10286252/96‑3 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGat < 2:12300510/96‑1 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGat < 1:3459597/96‑1 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGat < 1:10539509/96‑1 (MQ=255) cgcgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGatat < 1:9450079/96‑1 (MQ=255) gcgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATc > 2:3484321/1‑96 (MQ=255) gcgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATc < 1:13506381/96‑1 (MQ=255) cgGTAGCCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATcc < 1:3945554/96‑1 (MQ=255) || TGGTCAACCTGCGCCTGGCACAGGAACGTTATCCGGACGTTCAGTTCCACCAGACCCGCGAGCATTAATTCTTGCCTCCAGGGCGCGGTACGCGCTGCGCCCTGTCAATTTCCCTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCC > NC_000913/4608505‑4608685 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |