| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,085,675 | Δ1 bp | intergenic (+38/+13) | yiiG → / ← frvR | hypothetical protein/putative frv operon regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,085,675 | 0 | G | . | 99.5% | 899.2 / ‑3.4 | 194 | intergenic (+38/+13) | yiiG/frvR | hypothetical protein/putative frv operon regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (120/73); minor base A (1/0); total (121/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CATTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGCGATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGACA > NC_000913/4085588‑4085762 | ttACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGaca > 1:3325802/1‑93 (MQ=255) tACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATCCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGacac > 2:53717/1‑93 (MQ=255) aCGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGAcaca < 2:1105694/93‑1 (MQ=255) cgcgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAg < 1:811587/93‑1 (MQ=255) gcgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGTCGC‑ATCCGACACAgc > 1:800257/1‑92 (MQ=255) gcgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGt > 1:3122435/1‑93 (MQ=255) gcgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGt > 1:3822202/1‑93 (MQ=255) cgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGtt < 1:3784472/93‑1 (MQ=255) gTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAc > 2:287595/1‑93 (MQ=255) tACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAcc > 2:5938091/1‑93 (MQ=255) cAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAcccc < 1:2883203/93‑1 (MQ=255) aaCGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCt > 1:6130614/1‑93 (MQ=255) cGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtg < 1:3344979/93‑1 (MQ=255) gAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgt > 1:4161174/1‑93 (MQ=255) aaaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgtg > 2:1317002/1‑93 (MQ=255) aaaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgtg < 1:1125961/93‑1 (MQ=255) aaTGGTTGATGGCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGa > 1:2226890/1‑93 (MQ=255) aaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGa > 2:3029817/1‑93 (MQ=255) aaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGa > 2:3244608/1‑93 (MQ=255) aaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGa < 2:778332/93‑1 (MQ=255) tGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAg > 2:4926095/1‑93 (MQ=255) ggTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGt > 1:5146529/1‑93 (MQ=255) ttGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTaa < 2:361835/93‑1 (MQ=255) tgatgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAAc < 1:3423233/93‑1 (MQ=255) gatgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACt > 1:5702273/1‑93 (MQ=255) gatgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACt < 2:4231650/93‑1 (MQ=255) atgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTc < 1:1024329/93‑1 (MQ=255) atgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTc < 2:6004645/93‑1 (MQ=255) tgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTcc > 1:2857740/1‑93 (MQ=255) taCTAAAATAGCCTGC‑TTAAATGTTTTTTAATGAAAAATGCGGTGTCGGAGGCGGCGC‑ACCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCa < 2:3474585/92‑1 (MQ=255) aCTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCAt > 2:2710367/1‑93 (MQ=255) cTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATa > 2:2513842/1‑93 (MQ=255) tataATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATaa > 2:5598765/1‑93 (MQ=255) ataataGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATaaa > 1:2417718/1‑93 (MQ=255) ataataGCCTCCGTTAAACG‑TTTTGGGTGATAAAGGCGGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATaaa < 2:5129025/93‑1 (MQ=255) taataGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAAt > 1:2282958/1‑93 (MQ=255) taataGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAAt > 2:3731895/1‑93 (MQ=255) taataGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAAt > 2:4659912/1‑93 (MQ=255) aataGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATg > 1:3340064/1‑93 (MQ=255) ataGCGTGCTTTAACCT‑TTTTTGAGGAAAAATGCAGGGTGGGAGGGGGC‑CCACCCGCCACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGc < 1:4611897/93‑1 (MQ=255) ataGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGCGTCGGATGCGGCGC‑ATACGACACAGTTCACCACTTGTGAAGTAACTCCATAAATGc > 1:4184607/1‑93 (MQ=255) gCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAAGGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTc < 2:2530430/93‑1 (MQ=255) ccTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCa > 1:3708475/1‑93 (MQ=255) ccTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCa > 1:1404632/1‑93 (MQ=255) cggCGTAAAACT‑TTTTTGATGAAAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat < 2:4520394/91‑1 (MQ=255) cTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat > 1:5248183/1‑93 (MQ=255) cTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat > 1:5022524/1‑93 (MQ=255) tGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCata < 1:487564/93‑1 (MQ=255) tGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCata > 1:1971579/1‑93 (MQ=255) tgTTAATTG‑TTTTTGATGAAAACTGAAGTGCGGGAGGCGCCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATc < 1:2382687/92‑1 (MQ=255) cGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATc > 1:3195792/1‑93 (MQ=255) cGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATc < 1:658416/93‑1 (MQ=255) cGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATc < 2:1879750/93‑1 (MQ=255) ttgaaaCT‑TTTTTGATGATAAAGGAAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCGGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATcc < 1:5624692/90‑1 (MQ=255) gTTAAACT‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATcc < 2:1496899/93‑1 (MQ=255) gTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATcc > 1:1251100/1‑93 (MQ=255) gTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATcc < 1:5975895/93‑1 (MQ=255) ttAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCt > 2:1027346/1‑93 (MQ=255) ttAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCt < 1:5744053/93‑1 (MQ=255) aaaCG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGt > 1:406231/1‑93 (MQ=255) aCG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTa > 1:4744147/1‑93 (MQ=255) aCG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTa < 1:5305510/93‑1 (MQ=255) aCG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTa > 2:3306645/1‑93 (MQ=255) cG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTaa > 1:954880/1‑93 (MQ=255) cG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTaa > 1:3227373/1‑93 (MQ=255) g‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAc > 2:1648738/1‑93 (MQ=255) g‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAc > 2:1968745/1‑93 (MQ=255) tttttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAcc < 2:1728723/93‑1 (MQ=255) tttttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAcc > 1:2098484/1‑93 (MQ=255) tttttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAcc > 1:182843/1‑93 (MQ=255) tttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCg > 2:614882/1‑93 (MQ=255) tttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCg < 1:4335635/93‑1 (MQ=255) tgatgaTAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGc > 2:2059703/1‑93 (MQ=255) atgaaAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaa < 1:2673410/93‑1 (MQ=255) tAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataat > 2:4530166/1‑93 (MQ=255) tAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataat > 2:879670/1‑93 (MQ=255) tAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataat > 1:1669293/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAAtc < 1:1955778/93‑1 (MQ=255) aaTGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAAtct < 2:4864741/93‑1 (MQ=255) aTGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAAtctc < 1:4230250/93‑1 (MQ=255) aTGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAAtctc > 1:4803237/1‑93 (MQ=255) tGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTcc > 1:1588752/1‑93 (MQ=255) tGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTcc > 1:219315/1‑93 (MQ=255) tGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTcc > 1:4540889/1‑93 (MQ=255) tGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTcc < 1:5629142/93‑1 (MQ=255) gCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTccg < 2:1833578/93‑1 (MQ=255) cAGTGTCGGAGGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTccgc < 1:2725862/93‑1 (MQ=255) gtgtCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTccgccg > 2:5194252/1‑93 (MQ=255) tgtCGGATGCGGCGC‑AACCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAAATCCATAAATGCCTCACATCCTGTTAACTCGGCAATAATCTCCGCCgg > 1:4382402/1‑93 (MQ=255) gtCGGATGCGGCGC‑ACCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGa < 2:2943/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGAt > 1:5854358/1‑93 (MQ=255) tCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGAt < 2:2263892/93‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATg > 2:5104499/1‑93 (MQ=255) ggATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGc > 2:4048153/1‑93 (MQ=255) ggATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGc > 1:2212209/1‑93 (MQ=255) ggATACGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCCCCGGATGc < 2:2117671/93‑1 (MQ=255) gATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCt > 2:1603408/1‑93 (MQ=255) gATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCt > 1:3900501/1‑93 (MQ=255) cggcgC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGaca > 2:3798282/1‑93 (MQ=255) cggcgC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGaca > 2:3405618/1‑93 (MQ=255) | CATTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACG‑TTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGCGATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGACA > NC_000913/4085588‑4085762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |