| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,896,819 | +C | coding (622/657 nt) | ygcU ← | putative oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 99.6% | 889.0 / ‑3.8 | 246 | coding (623/657 nt) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (160/85); total (160/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCT > NC_000913/2896726‑2896904 | aGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccg > 1:2096857/1‑91 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 2:3469981/1‑90 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 2:2630888/1‑90 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 2:754873/1‑90 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 1:2346973/1‑90 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccgat < 1:2049023/93‑5 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatga > 2:4809582/1‑93 (MQ=255) aataGGCGTAGAAGAGTTTGTTTTGCGGGGTGTATTTAAAACTTTTCACTGTTACTACAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatga < 1:549626/92‑1 (MQ=255) taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatg > 2:5328658/1‑93 (MQ=255) taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatg > 2:1291472/1‑93 (MQ=255) taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatg < 1:3733652/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatga < 2:5690230/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatga < 2:4727234/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCgatgatga > 1:876868/1‑93 (MQ=255) ccGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGatgatgatg > 2:3710011/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCATTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGACGATGATGAtgt > 2:2586206/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGAtgt < 2:862194/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGa > 2:1615515/1‑93 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGCGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGa > 2:4519604/1‑93 (MQ=255) agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGAc > 1:2865482/1‑93 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGaa < 2:5895191/93‑1 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAAt > 2:2280210/1‑93 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAAt > 1:1237765/1‑93 (MQ=255) ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc < 2:4024632/93‑1 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCg > 2:4628875/1‑93 (MQ=255) ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCggg > 2:1925549/1‑93 (MQ=255) tttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGc > 1:1148648/1‑93 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGcc < 1:4213581/93‑1 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGcc < 2:3805168/93‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCa < 1:5721069/93‑1 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTTACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 1:1269200/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 1:3548821/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgc > 1:5077758/1‑93 (MQ=255) gTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGGCCGGGCCAGCcgcg > 1:5945739/1‑93 (MQ=255) tGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgc < 2:3602080/93‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg > 1:591118/1‑93 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcgg > 2:2857220/1‑93 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTGAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGGCAGCCGCgcggg > 1:492404/1‑92 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc > 2:2734830/1‑93 (MQ=255) tttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGG‑CAGCCGCGCGGCGt > 2:2817775/1‑93 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 2:5164375/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:1072862/93‑1 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcgcg > 1:3315803/1‑91 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTg > 1:3185890/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCCGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc < 1:4060286/93‑1 (MQ=255) aGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa > 2:1018079/1‑93 (MQ=255) aGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa > 2:1519994/1‑93 (MQ=255) gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc < 2:3187815/93‑1 (MQ=255) ttttCACTGTTCCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt < 2:3430127/93‑1 (MQ=255) ttttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt > 1:5343818/1‑93 (MQ=255) ttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttt < 2:5402284/93‑1 (MQ=255) ttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttt > 2:4785734/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCCCGTTTTTat > 1:2555037/1‑92 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa > 1:852549/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 1:3467449/93‑1 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:313460/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAACCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:2644151/1‑93 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc > 2:4332189/1‑93 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc > 1:64422/1‑93 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg > 1:3610013/1‑93 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg < 1:3098678/93‑1 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt > 1:6106786/1‑93 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg < 2:20800/93‑1 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg > 1:2379120/1‑93 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt < 2:2034525/93‑1 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 2:4193063/1‑93 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa > 2:2374630/1‑93 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa > 2:16419/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc < 1:1374262/93‑1 (MQ=255) gTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg > 1:5646482/1‑93 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 2:3284616/93‑1 (MQ=255) ggATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 2:1050430/92‑1 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACggg > 2:4993081/1‑92 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGt > 2:4113872/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc < 1:3935371/93‑1 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc > 1:4348596/1‑93 (MQ=255) taGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa > 2:2446632/1‑93 (MQ=255) taGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa < 2:1159407/93‑1 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt < 1:3263116/93‑1 (MQ=255) gCACAATGCTCCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 2:4383525/93‑1 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc > 2:6117321/1‑93 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg > 1:5145749/1‑93 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg < 1:1968163/93‑1 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTTGCCGATGAAGATATGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg < 2:5469277/93‑1 (MQ=255) caATGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGc > 2:5054699/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa < 2:1724376/93‑1 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa < 1:3790997/93‑1 (MQ=255) gCACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAAt < 2:5605262/93‑1 (MQ=255) cACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 1:941709/1‑93 (MQ=255) cACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 1:1578646/1‑93 (MQ=255) cACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa < 1:5430559/93‑1 (MQ=255) cACCTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa < 2:1988914/93‑1 (MQ=255) ccTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt > 1:4698007/1‑93 (MQ=255) ccTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAACACt > 1:299303/1‑93 (MQ=255) cTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg > 1:4528791/1‑93 (MQ=255) cTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg > 1:4570223/1‑93 (MQ=255) cTTCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg < 1:6029922/93‑1 (MQ=255) ttCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc > 1:1766895/1‑93 (MQ=255) ttCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc > 2:1303999/1‑93 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt > 2:459186/1‑93 (MQ=255) | TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCT > NC_000913/2896726‑2896904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |