| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,930,677 | +G | intergenic (+175/‑264) | kup → / → rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 99.6% | 811.9 / ‑5.8 | 227 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); major base G (114/111); minor base T (1/0); total (115/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763 | gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc < 1:1483043/93‑1 (MQ=255)gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc > 1:5620353/1‑93 (MQ=255)gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGAATGAGTCGTTGATCCTc < 2:4234248/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑g < 2:466162/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑g < 2:766370/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑g < 1:3150683/93‑1 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc > 2:6069826/1‑91 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc > 2:3472178/1‑91 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc > 2:278395/1‑91 (MQ=255) aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggca > 2:717776/1‑90 (MQ=255) aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggca > 1:258984/1‑90 (MQ=255) agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggcaa > 1:6057921/1‑89 (MQ=255) agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggcaa > 1:5513432/1‑89 (MQ=255) gTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGc > 1:1388663/1‑93 (MQ=255) tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGccc > 1:1119969/1‑93 (MQ=255) tCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGt > 2:4077875/1‑93 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTg < 2:886240/93‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTgg > 2:3588794/1‑93 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTgg > 2:395139/1‑93 (MQ=255) cccGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGt < 2:710446/92‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGt > 1:3095929/1‑93 (MQ=255) ccGGTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTa < 2:2156677/93‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCTGCAAA‑CGCCCGTggct > 1:2348632/1‑91 (MQ=255) ccGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTa > 2:5011183/1‑93 (MQ=255) cTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTAttt > 2:105846/1‑93 (MQ=255) tGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTg < 2:3643373/93‑1 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGc < 2:3272692/93‑1 (MQ=255) cGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCg < 2:4465348/93‑1 (MQ=255) ggTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGt < 1:1006440/93‑1 (MQ=255) gtgtGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTc < 1:4596389/90‑1 (MQ=255) gTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTc < 2:2417911/93‑1 (MQ=255) tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCATGGTATTTGCGTCt > 2:5059361/1‑93 (MQ=255) gcTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATTGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCt < 1:5335819/92‑1 (MQ=255) cTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTg < 1:294582/93‑1 (MQ=255) tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc < 1:6085539/93‑1 (MQ=255) gAAGGATTAAGTTGCCTGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc < 2:5175304/93‑1 (MQ=255) gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 1:4879685/1‑93 (MQ=255) gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 2:3368522/1‑93 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:5044995/93‑1 (MQ=255) aTTAAGGTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:1230621/93‑1 (MQ=255) tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc < 2:5354330/93‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTg < 2:2832401/93‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTg < 2:571306/93‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTg > 2:1516515/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 2:2613363/93‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 1:1026651/93‑1 (MQ=255) gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACt < 1:70735/93‑1 (MQ=255) ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt > 2:1204140/1‑93 (MQ=255) ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 1:1974461/93‑1 (MQ=255) cGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtg > 1:2742084/1‑93 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:3778375/1‑93 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:2261050/1‑93 (MQ=255) cgatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc < 1:511839/92‑1 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 1:1298248/93‑1 (MQ=255) atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTTTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg > 1:3515323/1‑93 (MQ=255) tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 2:6007429/1‑93 (MQ=255) tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 1:2701681/1‑93 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCCAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 1:1587917/1‑93 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 2:1883791/1‑93 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 1:4366129/1‑93 (MQ=255) aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg < 2:1336969/93‑1 (MQ=255) aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg > 2:1305530/1‑93 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt > 2:4730899/1‑93 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt < 2:4583298/93‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt < 2:3571410/93‑1 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 2:5860461/1‑93 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 2:173065/1‑93 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 1:4249986/93‑1 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 2:193929/1‑93 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 1:3348518/1‑93 (MQ=255) tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 1:4017112/93‑1 (MQ=255) tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 1:964290/93‑1 (MQ=255) tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 2:2562552/93‑1 (MQ=255) cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg > 2:5181606/1‑93 (MQ=255) cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg < 2:4849448/93‑1 (MQ=255) cttcttTAAGTCGCATGTGTCGTTGATCCTC‑GGAAATCGCCCGAGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAGCGTattac < 1:5493840/93‑5 (MQ=255) ttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcg > 2:3059731/1‑93 (MQ=255) tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc < 2:1157519/93‑1 (MQ=255) tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc < 2:4517590/93‑1 (MQ=255) tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc < 1:3179334/93‑1 (MQ=255) cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgcg > 2:290831/1‑92 (MQ=255) tttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTg > 1:5839353/1‑93 (MQ=255) ttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGc < 1:5427265/93‑1 (MQ=255) tATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCg < 1:1834576/93‑1 (MQ=255) tATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCg > 2:4438538/1‑93 (MQ=255) ttGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt < 2:3906754/92‑1 (MQ=255) gTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc > 2:948399/1‑93 (MQ=255) gTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTCGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc < 1:4118662/93‑1 (MQ=255) gCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc > 2:4186537/1‑93 (MQ=255) aTGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg < 2:4327399/93‑1 (MQ=255) tGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa > 2:1681635/1‑93 (MQ=255) gTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCa < 2:3253122/93‑1 (MQ=255) gTCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCa > 1:3115026/1‑93 (MQ=255) tCGTTGATCCTCGGCAAA‑CGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCaa < 2:2105285/93‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |