| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,945,351 | +C | coding (1/600 nt) coding (240/240 nt) |
yifDA ← yifDA ← |
transcription regulator transcription regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,945,350 | 1 | . | C | 99.5% | 784.1 / ‑3.8 | 214 | coding (2/600 nt) | yifDA | transcription regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (101/112); total (101/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
ACAAGCGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCT‑CTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTGTTTCT > NC_000913/3945258‑3945437 | aCAAGCGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑Cct > 2:5755356/1‑93 (MQ=255) aaGCGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑Cct‑cc > 2:846781/1‑92 (MQ=255) aGCGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑Cct‑cct < 2:2914133/93‑3 (MQ=255) aGCGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑Cct‑cct > 2:5030919/1‑91 (MQ=255) aGCCTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑Cct‑cct < 2:4866742/93‑3 (MQ=255) cGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑Cct‑cctta < 2:169236/93‑5 (MQ=255) tCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTTTGCGCCA‑CCTCCTTACg > 2:5496162/1‑93 (MQ=255) tCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACg > 1:1127592/1‑93 (MQ=255) tCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACg < 2:365822/93‑1 (MQ=255) cccAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACgg < 1:630242/93‑1 (MQ=255) cccAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACgg < 1:3038887/93‑1 (MQ=255) cccAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACgg > 2:623462/1‑93 (MQ=255) ccAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACggg < 2:1850789/93‑1 (MQ=255) cAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGggc < 1:5687594/93‑1 (MQ=255) cAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGggc < 1:1818714/93‑1 (MQ=255) cAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGggc > 2:403896/1‑93 (MQ=255) cAGCCACTGATTAAGCACACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGggc > 1:4772026/1‑93 (MQ=255) gCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGggcgg > 1:5350883/1‑93 (MQ=255) cACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGcc > 1:1474285/1‑93 (MQ=255) cACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGcc < 2:3818832/93‑1 (MQ=255) ccTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCt < 2:790406/92‑1 (MQ=255) aCTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCt < 1:840624/93‑1 (MQ=255) cTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTg > 1:962285/1‑93 (MQ=255) taTTAAACATACATTCCCCCAACGAGGCCCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCC‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGcc < 2:1647460/92‑1 (MQ=255) ttAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAg < 1:1604525/93‑1 (MQ=255) ttAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAg < 2:5354481/93‑1 (MQ=255) tAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAgg > 1:188729/1‑93 (MQ=255) aaGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGt < 1:5302884/93‑1 (MQ=255) cATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCt > 2:2466548/1‑93 (MQ=255) cATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCt < 1:4859738/93‑1 (MQ=255) tACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCa > 2:1018580/1‑93 (MQ=255) tACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCa < 2:3279260/93‑1 (MQ=255) aCATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCAt < 1:2323093/93‑1 (MQ=255) aTTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGa > 1:5556141/1‑93 (MQ=255) aTTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGa < 1:4469810/93‑1 (MQ=255) tCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGc < 1:1957835/93‑1 (MQ=255) tCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGc > 1:4983240/1‑93 (MQ=255) ccACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGt < 1:337174/93‑1 (MQ=255) ccACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGt > 1:2552549/1‑93 (MQ=255) ccACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGt > 1:3933487/1‑93 (MQ=255) acaACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGttt < 1:2051429/93‑1 (MQ=255) acaACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGttt > 2:3405643/1‑93 (MQ=255) caACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGCGCGTTTc > 2:5680119/1‑93 (MQ=255) caACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTc < 1:55085/93‑1 (MQ=255) caACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTc > 1:1663870/1‑93 (MQ=255) caACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTc < 2:5714210/93‑1 (MQ=255) caACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGGGCTCATAAGCGTTTc > 1:3211315/1‑93 (MQ=255) aCGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTg > 2:926186/1‑93 (MQ=255) aCGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTg > 1:3644673/1‑93 (MQ=255) gAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATCCGCCA‑CCTCCTCACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATAAGAGTTTCTGCa > 2:4635225/1‑93 (MQ=255) aGGCGCGTGCCCCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCAt < 2:1556033/93‑1 (MQ=255) cTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGAATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAgga > 2:2274263/1‑92 (MQ=255) tGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCa > 2:645878/1‑93 (MQ=255) ggCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCag < 2:2667245/93‑1 (MQ=255) gCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCagt > 2:4153369/1‑93 (MQ=255) gCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCagt > 1:5714115/1‑93 (MQ=255) cACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCagta < 2:4471542/93‑1 (MQ=255) cACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCagta < 1:2687990/93‑1 (MQ=255) cACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCagta < 1:2733885/93‑1 (MQ=255) ccGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCagtagt > 1:2123369/1‑93 (MQ=255) aTAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGtttt < 2:3870862/93‑1 (MQ=255) tAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGttttt < 2:5879023/93‑1 (MQ=255) tAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGttttt > 1:1949052/1‑93 (MQ=255) aGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTc > 2:5402974/1‑93 (MQ=255) gAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCa < 1:4098348/93‑1 (MQ=255) gAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCa > 1:1194765/1‑93 (MQ=255) gAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCa < 2:3902578/93‑1 (MQ=255) aaaCTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCAcc < 2:3025011/93‑1 (MQ=255) aaCTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTGATGAGCGTTTCTGGATAAGGTAGCAGTTTTTGACCg > 2:4322928/1‑93 (MQ=255) aCTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCgg > 1:2426293/1‑93 (MQ=255) cTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGc > 2:2036649/1‑93 (MQ=255) cTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGc > 1:6037213/1‑93 (MQ=255) tCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCa < 1:1019993/93‑1 (MQ=255) cGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAg < 1:4212844/93‑1 (MQ=255) gTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGc < 2:3654179/93‑1 (MQ=255) gTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGc < 1:4584093/93‑1 (MQ=255) gTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGc < 2:5219912/93‑1 (MQ=255) ttATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCg < 1:1562926/93‑1 (MQ=255) tATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCgg > 2:2140417/1‑93 (MQ=255) aTGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGt < 1:588344/93‑1 (MQ=255) aTGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGt < 1:3978754/93‑1 (MQ=255) aTGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACAGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGt < 2:2948378/93‑1 (MQ=255) tGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGtt < 2:2719790/93‑1 (MQ=255) tCGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTaa > 2:467766/1‑93 (MQ=255) cGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTaaa < 2:3227916/93‑1 (MQ=255) cGTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTaaa > 2:1156606/1‑93 (MQ=255) gTGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTaaag > 1:4544845/1‑92 (MQ=255) tcaGGTATGCGCCACCCC‑CTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACg < 1:5216173/91‑1 (MQ=255) tGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACg < 1:2817012/93‑1 (MQ=255) tGAGGTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACg > 2:1401100/1‑93 (MQ=255) ggTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGat > 1:3854197/1‑93 (MQ=255) gTATGCGCCA‑TCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTGCACCGGCAGCGGTTAAACGGata < 1:1376151/93‑1 (MQ=255) gTATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGata < 1:301153/93‑1 (MQ=255) tATGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGatat < 2:386284/93‑1 (MQ=255) tGCGCCG‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTg < 2:471722/93‑1 (MQ=255) tGCGCCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTg < 1:5100825/93‑1 (MQ=255) tcgcCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGATCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTGt < 1:5257604/92‑1 (MQ=255) gcgcCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTGt < 1:403896/93‑1 (MQ=255) gcgcCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTGt < 1:3318964/93‑1 (MQ=255) cgcCA‑CCTCCTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTGtt < 1:733379/93‑1 (MQ=255) | ACAAGCGTCCCAGCCACTGATTAAGCATACATTCCCACAACGAGGCGCTGGCACCGATAGAAAACTCGTTATGTCGTGAGGTATGCGCCA‑CCT‑CTTACGGGCGGCCTGCCAGGTGCTCATGAGCGTTTCTGCATAAGGCAGTAGTTTTTCACCGGCAGCGGTTAAACGGATATTGTTTCT > NC_000913/3945258‑3945437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |