| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,013,772 | +C | intergenic (‑53/‑246) | ysgA ← / → udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,013,770 | 1 | . | C | 98.6% | 792.9 / 1.9 | 222 | intergenic (‑51/‑248) | ysgA/udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base C (107/111); total (108/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856 | gtcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑cc > 1:4118910/1‑93 (MQ=255) gtcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑cc > 1:1027680/1‑93 (MQ=255) tcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑ccc < 1:1565057/93‑2 (MQ=255) cgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑ccct > 1:3527977/1‑91 (MQ=255) tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑ccctta < 1:6071822/93‑5 (MQ=255) tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑ccctta > 2:1351798/1‑89 (MQ=255) cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑Ttata > 2:2627835/1‑93 (MQ=255) ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑GGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATaa > 2:3837211/1‑93 (MQ=255) ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATaa > 1:3726474/1‑93 (MQ=255) ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATaa > 1:2534387/1‑93 (MQ=255) ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATaa > 2:4146837/1‑93 (MQ=255) gTCTGAAGGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATaaaaa < 1:3624167/93‑1 (MQ=255) gTCGGAACGATGGTCGAAGCTAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATaaaaa < 1:296111/93‑1 (MQ=255) tCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAAt < 2:248708/93‑1 (MQ=255) tCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGGGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAAt > 2:2498489/1‑93 (MQ=255) cTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATg < 1:674534/93‑1 (MQ=255) tGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGt < 2:678197/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGtt < 2:4235838/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGtt > 1:3773178/1‑93 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTgc < 1:4967677/93‑1 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTgc > 1:5892590/1‑93 (MQ=255) gATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTgcgc < 2:472333/93‑1 (MQ=255) gATGGTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTgcgc > 2:1987909/1‑93 (MQ=255) ggTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAAt < 1:4554523/93‑1 (MQ=255) ggTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAAt < 1:5600193/93‑1 (MQ=255) gTCGAAGCGAGAAGAG‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGAAAATACCATGGTATTATCCGT‑ACCC‑TTATAAAAAAGTTACGCAATg < 2:5463057/93‑1 (MQ=255) gTCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATg < 2:5762453/93‑1 (MQ=255) tCGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTACTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGt > 2:5946744/1‑93 (MQ=255) cGAAGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGtt < 1:228935/93‑1 (MQ=255) aGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAc > 1:2892373/1‑93 (MQ=255) aGCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAc < 2:3506314/93‑1 (MQ=255) gCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:4307962/1‑93 (MQ=255) gCGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CCTTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt < 1:1492865/93‑1 (MQ=255) cGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACta < 1:2704384/93‑1 (MQ=255) cGAG‑AGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACta > 2:865039/1‑93 (MQ=255) gag‑aGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat < 2:109252/93‑1 (MQ=255) gag‑aGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:2092228/1‑93 (MQ=255) gag‑aGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat < 1:615067/93‑1 (MQ=255) ag‑agGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtata < 1:3346419/93‑1 (MQ=255) ag‑agGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtata > 1:200849/1‑93 (MQ=255) ggcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTc < 2:1020556/89‑1 (MQ=255) gcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCa < 2:2595023/90‑1 (MQ=255) gcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCa < 1:439456/90‑1 (MQ=255) gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc > 2:3344283/2‑93 (MQ=255) gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc > 1:3443086/2‑93 (MQ=255) gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc > 2:1457171/2‑93 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCa < 2:376341/93‑1 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCa > 2:4985100/1‑93 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAAGATTTCGCAATGTTAACTATAGTCAGCa > 2:3319737/1‑93 (MQ=255) tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt < 1:4022159/93‑1 (MQ=255) gcagcaGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATg < 2:2556287/93‑1 (MQ=255) cagcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGc > 2:3409330/1‑93 (MQ=255) agcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGca > 2:2426253/1‑93 (MQ=255) gcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaa > 1:2611612/1‑93 (MQ=255) cagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaac < 2:3043951/93‑1 (MQ=255) ggTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaacaa > 2:5435638/1‑93 (MQ=255) gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ATCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaacaat > 2:4764998/1‑92 (MQ=255) tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt > 1:1985866/1‑93 (MQ=255) tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt > 2:5186794/1‑93 (MQ=255) gCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATc < 1:2351324/93‑1 (MQ=255) aaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcaca < 2:372811/93‑1 (MQ=255) aaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcaca < 1:1122956/93‑1 (MQ=255) aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt > 2:4285500/1‑93 (MQ=255) tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt > 2:4064078/1‑93 (MQ=255) cAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc < 2:2309942/93‑1 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 1:1168141/1‑93 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt < 1:2805580/93‑1 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 2:2685812/1‑93 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 2:2915871/1‑93 (MQ=255) tgttgtgttgTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGaa < 2:2275408/93‑1 (MQ=255) gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTGC‑CC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 1:382359/93‑1 (MQ=255) ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 2:3154288/93‑1 (MQ=255) tgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCg < 2:31299/93‑1 (MQ=255) gtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCgg > 1:3158585/1‑93 (MQ=255) gtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCgg > 1:4820941/1‑93 (MQ=255) tgttgtTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGc > 1:4476270/1‑93 (MQ=255) ttgttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc > 2:3544425/1‑93 (MQ=255) ttgttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc < 1:2493081/93‑1 (MQ=255) ttgttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc > 2:4551867/1‑93 (MQ=255) tgttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCa < 2:2430422/93‑1 (MQ=255) tgttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCa < 1:2275659/93‑1 (MQ=255) tgttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCa < 2:4327639/93‑1 (MQ=255) ttgCCATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTcctt > 2:1853211/1‑90 (MQ=255) ccATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCttt > 2:4631512/1‑93 (MQ=255) ccATGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCttt < 1:5101136/93‑1 (MQ=255) tGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 2:1635742/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt < 1:54660/93‑1 (MQ=255) ggTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 2:5860329/1‑93 (MQ=255) gTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGc > 2:5497591/1‑93 (MQ=255) gTATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGc < 1:2670993/93‑1 (MQ=255) tATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGATTCGGCTCATCTTTTATGCa > 1:1758603/1‑93 (MQ=255) tATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 2:4948124/1‑93 (MQ=255) tATTCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTCAATCGGCTCATCTTTTATGCa < 1:4014977/93‑1 (MQ=255) ttCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATgatgt > 1:4268185/1‑89 (MQ=255) ttCTCCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCCGCTCATCTTTTATGCAGt > 1:5316675/1‑93 (MQ=255) tctcCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc < 1:3266891/93‑1 (MQ=255) tctcCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc > 1:2238849/1‑93 (MQ=255) tcCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 2:154222/1‑93 (MQ=255) tcCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 1:890864/1‑93 (MQ=255) tcCGT‑ACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGACGTCCt > 1:5682606/1‑93 (MQ=255) | GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAG‑AGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |