| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,293,960 | +GC | intergenic (+587/+55) | gltP → / ← yjcO | glutamate‑aspartate symport protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,293,959 | 1 | . | C | 100.0% | 171.3 / NA | 89 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate‑aspartate symport protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (32/57); total (32/57) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,293,959 | 2 | . | G | 100.0% | 171.3 / NA | 89 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate‑aspartate symport protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (32/57); total (32/57) | |||||||||||
AGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTA‑‑CCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCT > NC_000913/4293928‑4294042 || aGCGTGATTTTGTAGGTCGGATACGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTaa < 1:3510917/93‑1 (MQ=11) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc < 1:3059130/93‑1 (MQ=1) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc < 2:667489/93‑1 (MQ=1) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc > 2:4109161/1‑93 (MQ=1) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc < 2:6063720/93‑1 (MQ=1) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc < 2:4520351/93‑1 (MQ=1) ggTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGC‑GTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 1:2780779/92‑1 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |