| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,875,936 | Δ61 bp | intergenic (+295/+596) | iap → / ← ygbF | Iap/hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2875935 | 1 (0.000) | 111 (0.720) | 73/122 | 0.6 | 98.4% | intergenic (+294/+657) | iap/ygbF | Iap/hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 2875997 = | 3 (0.020) | intergenic (+356/+595) | iap/ygbF | Iap/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCA > NC_000913/2875843‑2876027 | gggCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC < 1:410022‑M1/93‑1 (MQ=255)gggCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC < 2:1176077‑M1/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCt > 1:3100394‑M1/1‑92 (MQ=255) ggCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCt < 2:1195573‑M1/93‑2 (MQ=255) gCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtg < 1:311041‑M1/93‑3 (MQ=255) gCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtg < 2:5235778‑M1/93‑3 (MQ=255) cGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgg < 1:1379274‑M1/93‑4 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtggg < 2:2505508‑M1/93‑5 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtggg < 2:3867766‑M1/93‑5 (MQ=255) gTTTATCCCCTCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggc < 1:1750343‑M1/93‑6 (MQ=255) ttATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcgg > 2:1376658‑M1/1‑86 (MQ=255) tATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggc > 1:1699145‑M1/1‑85 (MQ=255) tATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggc < 2:1103119‑M1/93‑9 (MQ=255) tATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggc < 1:5499543‑M1/93‑9 (MQ=255) aTCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggct < 2:4434885‑M1/93‑10 (MQ=255) aTCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggct < 2:4293557‑M1/93‑10 (MQ=255) aTCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggct > 2:4727542‑M1/1‑84 (MQ=255) tCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggctt > 2:462286‑M1/1‑83 (MQ=255) ccGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgcc < 1:4091408‑M1/93‑14 (MQ=255) cGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgcct < 1:6018950‑M1/93‑15 (MQ=255) cTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTCtgggcggcttggcttg > 1:1268494‑M1/1‑77 (MQ=255) tAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgc > 2:3918360‑M1/1‑76 (MQ=255) aCGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcag > 1:3087419‑M1/1‑74 (MQ=255) aCGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcag < 1:39574‑M1/93‑20 (MQ=255) aCGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcag > 1:95679‑M1/1‑74 (MQ=255) cgcgGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagc < 2:4418570‑M1/93‑21 (MQ=255) gggAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagc > 2:350148‑M1/1‑69 (MQ=255) gAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctc > 1:2686779‑M1/1‑67 (MQ=255) gAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctc < 2:3483651‑M1/93‑27 (MQ=255) acccgtaGTCCATCATTCCCCCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctcca < 1:5291146‑M1/90‑29 (MQ=255) aCTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctcca < 1:6074485‑M1/93‑29 (MQ=255) aCTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctcca < 2:5319058‑M1/93‑29 (MQ=255) cTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccag < 1:4414184‑M1/93‑30 (MQ=255) tCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAGCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagc < 1:2809818‑M1/93‑31 (MQ=255) cGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagca > 1:3733956‑M1/1‑62 (MQ=255) tAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagc > 1:1918393‑M1/1‑60 (MQ=255) tAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagc > 2:2162893‑M1/1‑60 (MQ=255) gTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcgg > 1:4999539‑M1/1‑58 (MQ=255) ccATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtt > 1:1151393‑M1/1‑56 (MQ=255) ccATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtt < 2:1804372‑M1/93‑38 (MQ=255) catcatTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggttt < 2:5555651‑M1/93‑39 (MQ=255) atcatTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggttta > 2:322824‑M1/1‑54 (MQ=255) atcatTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggttta > 2:4933189‑M1/1‑54 (MQ=255) atcatGCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggttta < 1:3848610‑M1/93‑40 (MQ=255) tcatTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttat > 2:2236924‑M1/1‑53 (MQ=255) atTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatcc < 1:3777163‑M1/93‑43 (MQ=255) ttCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccc < 2:5463997‑M1/93‑44 (MQ=255) tCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatcccc < 2:1652227‑M1/93‑45 (MQ=255) ccACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccg > 1:5713742‑M1/1‑48 (MQ=255) cACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgc > 2:5573060‑M1/1‑47 (MQ=255) aCCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgct > 2:6034070‑M1/1‑46 (MQ=255) tATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggc < 1:729606‑M1/93‑51 (MQ=255) tATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggc > 1:3176029‑M1/1‑43 (MQ=255) tATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggc > 2:3704038‑M1/1‑43 (MQ=255) tATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggc > 2:2181191‑M1/1‑43 (MQ=255) aTGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcg < 2:2971873‑M1/93‑52 (MQ=255) aTGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcg < 2:1984999‑M1/93‑52 (MQ=255) tgactgaACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatgcccgctggcgc > 1:5206428‑M1/4‑41 (MQ=255) gTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcg > 1:2626017‑M1/1‑40 (MQ=255) tCTGATCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcgg < 2:2299904‑M1/93‑55 (MQ=255) tCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcgg > 2:3361685‑M1/1‑39 (MQ=255) gctGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcgg < 2:3099895‑M1/92‑55 (MQ=255) tGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcgggg > 2:2462121‑M1/1‑37 (MQ=255) gacctccCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagtggtttatccccgctggcgcgggga < 1:2384411‑M1/90‑58 (MQ=255) gAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcgggga < 1:5388372‑M1/93‑58 (MQ=255) gAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcgggga > 2:5520324‑M1/1‑36 (MQ=255) aCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaac < 1:492688‑M1/93‑60 (MQ=255) tCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactc > 2:5890365‑M1/1‑32 (MQ=255) tCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactc < 2:924625‑M1/93‑62 (MQ=255) cccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactca < 2:519424‑M1/93‑63 (MQ=255) cccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactca < 2:5977683‑M1/93‑63 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaa > 1:888693‑M1/1‑30 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagc < 2:3557108‑M1/93‑66 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagct < 1:950588‑M1/93‑67 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagct < 1:691830‑M1/93‑67 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagct > 2:5347683‑M1/1‑27 (MQ=255) tCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctg > 2:3953795‑M1/1‑22 (MQ=255) tCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctg > 1:5237059‑M1/1‑22 (MQ=255) 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gcgGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctcttt < 1:514744‑M1/93‑83 (MQ=255) gcgGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctcttt < 1:6119554‑M1/93‑83 (MQ=255) cgGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttc < 1:1648038‑M1/93‑84 (MQ=255) cgGGGAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttc > 2:1803410‑M1/1‑10 (MQ=255) ggggAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcg < 2:6012681‑M1/93‑85 (MQ=255) gggAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcgg > 2:2030112‑M1/1‑8 (MQ=255) ggAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcggg < 1:1897790‑M1/93‑87 (MQ=255) gAACTCtgggcggcttgccttgcagccagctccagcagcggtttatccccgctggcgcggggaactcaagctggctggcaatctctttcgggg < 1:4528345‑M1/93‑88 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |