Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3156257 | 3156259 | 3 | 240 [0] | [0] 244 | yqhG | hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3156256 | 0 (0.000) | 228 (1.010) | 122/178 | 0.1 | 100% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
? | NC_000913 | 3156260 = | 0 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 | gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 1:1014277‑M2/1‑1 (MQ=255) aaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 1:314964‑M2/1‑1 (MQ=255) agccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCgg < 2:6085866‑M2/5‑1 (MQ=255) agccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCgg < 2:5171666‑M2/5‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctgtccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 1:810879‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt > 1:2114700‑M2/88‑93 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCcgttta > 1:4211854‑M2/85‑91 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 2:2913935‑M2/84‑93 (MQ=255) gcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGcc > 1:457336‑M2/81‑93 (MQ=255) cctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCt < 1:4174749‑M2/14‑1 (MQ=255) cctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCt < 2:2088012‑M2/14‑1 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt < 1:3194564‑M2/15‑1 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:1114428‑M2/78‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 1:3531386‑M2/78‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:4925918‑M2/78‑93 (MQ=255) ttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCt > 2:1597482‑M2/77‑93 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta > 1:4283492‑M2/76‑93 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat < 2:5799459‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtata < 2:4580765‑M2/20‑1 (MQ=255) gccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaaa < 2:4642281‑M2/22‑1 (MQ=255) ccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaaaa < 1:3697037‑M2/23‑1 (MQ=255) cgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAac > 1:1225609‑M2/70‑93 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 2:4660988‑M2/69‑93 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 1:5336000‑M2/69‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 1:1828317‑M2/68‑93 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc < 2:5902628‑M2/28‑1 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc > 2:3433396‑M2/66‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 1:5985729‑M2/65‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 2:5106487‑M2/65‑93 (MQ=255) tttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTc < 1:697033‑M2/31‑1 (MQ=255) tgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCaa < 2:3820291‑M2/33‑1 (MQ=255) gaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAg > 1:200114‑M2/60‑93 (MQ=255) aatatattgctgattattgctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTTTATAAAACCACCTTCAAGa > 1:5483969‑M2/59‑93 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa < 2:3753993‑M2/35‑1 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa < 1:3462048‑M2/35‑1 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa < 1:5570857‑M2/35‑1 (MQ=255) atattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACgg > 2:1729456‑M2/56‑93 (MQ=255) ttgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCa > 1:465169‑M2/53‑93 (MQ=255) ttgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCa > 2:1499421‑M2/53‑93 (MQ=255) gctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaat > 2:5639584‑M2/51‑93 (MQ=255) ctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaata > 2:596598‑M2/50‑93 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa < 2:2051837‑M2/45‑1 (MQ=255) gtattatagctggcggtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGATTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACTGCCaataa < 1:2544064‑M2/45‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc > 2:2697067‑M2/45‑93 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCg > 2:1893786‑M2/44‑93 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt < 1:5308425‑M2/52‑1 (MQ=255) agcgggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt < 1:3409855‑M2/52‑1 (MQ=255) gcgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGat < 1:6069413‑M2/58‑1 (MQ=255) ccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGat > 2:3696571‑M2/36‑93 (MQ=255) ccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGat > 1:3329623‑M2/36‑93 (MQ=255) gtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGatat > 2:4103252‑M2/34‑93 (MQ=255) gtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGatat < 1:3752718‑M2/60‑1 (MQ=255) tggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATg < 1:1028364‑M2/61‑1 (MQ=255) ggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGc < 1:4385421‑M2/62‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCCATAAAACCCCCTTCAAGACCGCTACTAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 1:2067513‑M2/65‑1 (MQ=255) gtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAt < 1:1797231‑M2/66‑1 (MQ=255) gtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAt < 2:4346955‑M2/66‑1 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa < 2:5338909‑M2/67‑1 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa < 1:2852512‑M2/67‑1 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa > 1:1893227‑M2/27‑93 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 1:2638539‑M2/70‑1 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 2:1020081‑M2/70‑1 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 1:778126‑M2/70‑1 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 1:4533595‑M2/70‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc < 1:4359457‑M2/71‑1 (MQ=255) ggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACg < 1:1502658‑M2/72‑1 (MQ=255) gtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCCCCTTCAAGACGGACCATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACgg < 2:3263644‑M2/73‑1 (MQ=255) gtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACgg < 1:404947‑M2/73‑1 (MQ=255) tttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGc < 1:2194826‑M2/74‑1 (MQ=255) tttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGc < 2:862239‑M2/74‑1 (MQ=255) tccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCaa < 2:4840194‑M2/76‑1 (MQ=255) cgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatt < 2:1253256‑M2/78‑1 (MQ=255) cgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatt > 2:1347083‑M2/16‑93 (MQ=255) cgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatt < 2:4703288‑M2/78‑1 (MQ=255) cgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatt > 1:1699871‑M2/16‑93 (MQ=255) cgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatt > 1:2744827‑M2/16‑93 (MQ=255) cgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatt < 1:106998‑M2/78‑1 (MQ=255) gactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattt > 2:5262666‑M2/15‑93 (MQ=255) 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ttaccgccaGGCGGTTAATGACTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAtttattta > 1:125730‑M2/10‑93 (MQ=255) taccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 1:542129‑M2/85‑1 (MQ=255) taccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 2:2435149‑M2/85‑1 (MQ=255) ccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGa < 2:1792208‑M2/87‑1 (MQ=255) ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGAcat > 2:2143923‑M2/4‑92 (MQ=255) ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACaa < 1:2405508‑M2/90‑1 (MQ=255) ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACaa > 2:3090831‑M2/4‑93 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt < 1:3954226‑M2/91‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 1:631210‑M2/3‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAATCCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc < 1:3791874‑M2/92‑1 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 1:5754273‑M2/2‑93 (MQ=255) ggCGTTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc < 2:2776111/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc > 2:3971791/1‑93 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc > 1:5166690/1‑93 (MQ=255) | CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |