Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 580,783 | 0 | C | A | 68.0% | 945.6 / inf | 895 | I69I (ATC→ATA) | ybcX | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (165/121); new base A (275/334); total (440/455) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.84e-02 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 921 total aligned reads displayed.
TATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAA > NC_000913/580691‑580875 | ctcCCCAAAGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGt < 2:680499/93‑1 (MQ=255) tcCCCAAAGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTg > 1:3994923/1‑93 (MQ=255) ccccAAAGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGa < 1:41936/93‑1 (MQ=255) ccccAAAGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGa < 1:725818/93‑1 (MQ=255) cccaaaGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAg < 1:4113895/90‑1 (MQ=255) ccGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAg > 2:2661487/1‑93 (MQ=255) ccGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAg > 1:3560345/1‑93 (MQ=255) aaaGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAACCGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGtc < 1:5784044/93‑2 (MQ=255) aaaGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTg > 1:2514694/1‑93 (MQ=255) aaGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGtca > 1:2603421/1‑91 (MQ=255) aaGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGtca < 2:371488/93‑3 (MQ=255) aaGAGTCGGCCTACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGtca < 2:3863122/93‑3 (MQ=255) aaTCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAAtg < 1:4977268/93‑1 (MQ=255) aaTCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAAtg > 1:1474366/1‑93 (MQ=255) ggcctACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACgttgt < 2:5967268/89‑1 (MQ=255) gcctACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACgttgtt > 2:1484801/4‑92 (MQ=255) gcctACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACgttgtt > 2:5144013/4‑92 (MQ=255) cATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGa > 2:4669552/1‑93 (MQ=255) cATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGa > 1:1389489/1‑93 (MQ=255) ctACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTaa > 1:29382/2‑93 (MQ=255) tACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAg > 2:3973782/1‑93 (MQ=255) tACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAg > 2:5042905/1‑93 (MQ=255) tACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAg > 2:3080921/1‑93 (MQ=255) tACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAg > 2:5229064/1‑93 (MQ=255) cAGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCt > 1:564259/1‑93 (MQ=255) cAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCt > 2:3784289/1‑93 (MQ=255) cAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCt > 1:911611/1‑93 (MQ=255) aGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTg > 2:4080592/1‑93 (MQ=255) aGGAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTg > 2:421975/1‑93 (MQ=255) ggAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGc > 2:2992849/1‑93 (MQ=255) ggAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGc > 1:1204904/1‑93 (MQ=255) gAAGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGcc > 2:78288/1‑93 (MQ=255) aGGGCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCg < 1:191396/93‑1 (MQ=255) ggCGCTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCgtg < 1:2049669/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCgtgt < 2:1620366/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCgtgt < 1:5077444/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCgtgt < 2:915693/93‑1 (MQ=255) cgcTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTc < 1:4258949/93‑1 (MQ=255) cTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTgg < 2:4807059/93‑1 (MQ=255) cTGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTgg < 2:1273341/93‑1 (MQ=255) tGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTggc < 1:1081075/93‑2 (MQ=255) tGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTggc > 1:2200337/1‑92 (MQ=255) tGGGAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTggc > 1:4423866/1‑92 (MQ=255) gggAAACGTTGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTcagct > 1:5187925/1‑89 (MQ=255) ggtaaCACTGCCCTTTCAGCGGGCCAGCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAACGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGCTa > 1:5500491/4‑93 (MQ=255) ggAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTa < 2:6044473/93‑1 (MQ=255) aaaCACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTAtt > 2:1366912/1‑93 (MQ=255) tGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAaaaa < 1:1820950/93‑1 (MQ=255) tGCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAaaaa < 1:991844/93‑1 (MQ=255) gCCGTTTCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAAt > 2:2561961/1‑93 (MQ=255) ccgtttCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAAtg < 1:5382829/90‑1 (MQ=255) cccTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTATGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAAtg > 1:2753450/1‑93 (MQ=255) ccTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGGCCGTGTCGGTTATTCCAAAAtgc > 2:2430490/1‑93 (MQ=255) ccTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAAtgc < 2:1138984/93‑1 (MQ=255) tttCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAAtgctg > 1:3053289/1‑93 (MQ=255) tttCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAAtgttg < 1:5967634/93‑1 (MQ=255) ttCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAAtgttgc < 1:3855858/93‑1 (MQ=255) tCAACGCGCGATCATGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATgttgct < 1:1710890/93‑1 (MQ=255) gCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTggg < 2:531463/93‑1 (MQ=255) ggCCACCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGgtgt > 1:4689676/1‑93 (MQ=255) cgcgatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGgtgt < 1:4858610/89‑1 (MQ=255) gcgatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGtt > 1:3948452/4‑93 (MQ=255) gcgatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGtt < 1:825418/90‑1 (MQ=255) gatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTa < 1:5876504/92‑1 (MQ=255) gatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTa < 2:748022/92‑1 (MQ=255) gatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTa < 2:1861053/92‑1 (MQ=255) gatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTa < 1:2697952/92‑1 (MQ=255) gatcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTa < 2:5384994/92‑1 (MQ=255) atcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTAt > 2:4422660/1‑93 (MQ=255) atcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTAt > 2:435177/1‑93 (MQ=255) atcatGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTAt > 2:5499905/1‑93 (MQ=255) atcatGAATGCGATGGGTAACGACTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTAt < 1:4488412/93‑1 (MQ=255) tcatGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATg > 1:2828952/1‑93 (MQ=255) catGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGc > 1:324836/1‑93 (MQ=255) catGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGc > 2:2208126/1‑93 (MQ=255) tGAATGCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGcgt > 2:3515160/1‑91 (MQ=255) aaTGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTAc > 1:3170759/1‑93 (MQ=255) aaTGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTAc < 2:1789574/93‑1 (MQ=255) aTGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACt < 2:5577478/93‑1 (MQ=255) aTGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACt > 1:1584997/1‑93 (MQ=255) gCGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTAtttt < 2:1931423/93‑1 (MQ=255) cGATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTta > 2:5868149/1‑93 (MQ=255) gATGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTtat > 2:4892401/1‑93 (MQ=255) aTGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTtatt > 2:3222396/1‑92 (MQ=255) tGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTtattc < 1:3737322/93‑3 (MQ=255) tGGGTAACGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTtattc < 1:2411029/93‑3 (MQ=255) tGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATag < 1:2308628/93‑1 (MQ=255) gggCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATaga > 1:523772/1‑93 (MQ=255) cGATTACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACaa < 2:1690561/93‑1 (MQ=255) gattACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAag < 1:334278/90‑1 (MQ=255) attACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagc < 2:2732109/91‑1 (MQ=255) attACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagc < 1:663946/91‑1 (MQ=255) attACATACGTGAGGTCAACGGTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagc < 1:606042/91‑1 (MQ=255) ttACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagca > 2:283773/2‑93 (MQ=255) ttACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagca > 2:5799989/2‑93 (MQ=255) cTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAagca > 2:3586016/1‑93 (MQ=255) tACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagcag > 2:3394201/1‑93 (MQ=255) tACATACGTGAGGTCAACGTTGTTAAGTCTGCCCGTGTTGGCTATTCAAAAATGTTGCTGGGTGTTTATGCGTATTTTATTCAGCACAagcag > 2:5670425/1‑93 (MQ=255) aTCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGATGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAgcgc < 1:457389/93‑1 (MQ=255) tCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCa < 2:2067145/93‑1 (MQ=255) | TATCTCCCGAAAGAATCCGCATACCAGGAAGGGCGCTGGGAAACACTGCCCTTTCAGCGGGCCATCATGAATGCGATGGGCAGCGACTACATCCGTGAGGTGAATGTGGTGAAGTCTGCCCGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAA > NC_000913/580691‑580875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |