Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,803,648 | T→C | S271S (AGT→AGC) | proV → | ATP‑binding component of transport system for glycine, betaine and proline |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,803,648 | 0 | T | C | 99.0% | 734.8 / ‑2.4 | 206 | S271S (AGT→AGC) | proV | ATP‑binding component of transport system for glycine, betaine and proline |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base C (101/103); total (101/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.85e-01 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
TGAAGTGGTACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAA > NC_000913/2803558‑2803737 | tGAAGTGGTACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCa > 2:3890889/1‑93 (MQ=255) aaGTGGTACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAgg > 2:2500405/1‑93 (MQ=255) gTGGTACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTa > 2:5511196/1‑93 (MQ=255) gTACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTc < 1:4266173/93‑1 (MQ=255) tACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCa > 1:2719715/1‑93 (MQ=255) tACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCa > 2:2316537/1‑93 (MQ=255) tACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCa > 2:4856640/1‑93 (MQ=255) cAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGt < 2:3412031/93‑1 (MQ=255) aGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTg < 1:5793470/93‑1 (MQ=255) ggTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGc < 1:4136934/93‑1 (MQ=255) gTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCg > 1:4826944/1‑93 (MQ=255) tCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGa < 1:1257544/93‑1 (MQ=255) cGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGaa < 2:2594028/93‑1 (MQ=255) ggCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGaaa < 1:4918878/93‑1 (MQ=255) cacaCCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGa < 1:3299472/93‑1 (MQ=255) acacCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGat > 2:773350/1‑93 (MQ=255) acCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGatat < 1:2893289/93‑1 (MQ=255) ccGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATAtt < 1:784764/93‑1 (MQ=255) ccGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATAtt < 1:3853358/93‑1 (MQ=255) cGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTg > 2:5748114/1‑93 (MQ=255) ggATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGc < 1:1073430/93‑1 (MQ=255) gATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGcc < 1:1876489/93‑1 (MQ=255) gATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGcc > 2:5883988/1‑93 (MQ=255) aTGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGccc > 1:1825117/1‑93 (MQ=255) aTGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGccc > 2:1465590/1‑93 (MQ=255) aTGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGccc < 2:4347041/93‑1 (MQ=255) tGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCccg > 2:5096561/1‑93 (MQ=255) tGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCccg > 1:3726493/1‑93 (MQ=255) tGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCccg > 1:3770635/1‑93 (MQ=255) ttCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGa < 2:4213605/93‑1 (MQ=255) ttCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGa > 1:5568680/1‑93 (MQ=255) ttCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGa < 1:3535649/93‑1 (MQ=255) tcAATACTCCGGCGACTGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGTTATTGCCCGCCGGacac < 1:5478626/93‑1 (MQ=255) tcAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGacac < 2:671761/93‑1 (MQ=255) tcAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGacac < 1:5581110/93‑1 (MQ=255) tcAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGacac < 1:2935449/93‑1 (MQ=255) tcAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGacac < 1:1718752/93‑1 (MQ=255) tcAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGacac < 1:5198606/93‑1 (MQ=255) taatCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGaa > 2:548201/1‑93 (MQ=255) aatCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAAt < 1:454400/93‑1 (MQ=255) atCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATg < 1:1848373/93‑1 (MQ=255) tCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATgg > 1:5593927/1‑93 (MQ=255) ccGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGc < 2:2392109/93‑1 (MQ=255) gCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTa > 1:335898/1‑93 (MQ=255) aTGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTc > 2:4330482/1‑93 (MQ=255) gATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGt > 2:3460755/1‑93 (MQ=255) gATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGt < 1:5501955/93‑1 (MQ=255) gATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGt > 2:1982944/1‑93 (MQ=255) tATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTaaa > 2:4933736/1‑93 (MQ=255) aTGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTaaaa < 2:5357176/93‑1 (MQ=255) aTGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTaaaa < 1:1653989/93‑1 (MQ=255) aTGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTaaaa < 2:1837011/93‑1 (MQ=255) aTGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTaaaa > 2:2344324/1‑93 (MQ=255) gTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAAcc < 2:1157763/93‑1 (MQ=255) gTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAAcc > 1:5096728/1‑93 (MQ=255) ccGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAAcccc < 2:3210271/93‑1 (MQ=255) ccGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAAcccc < 1:3578271/93‑1 (MQ=255) ccGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAAcccc < 1:308196/93‑1 (MQ=255) ccGTACCTTCTTCCGTGGCGTTAATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAAcccc < 2:1478208/93‑1 (MQ=255) cGTACCTTTTTTCGTGGCGTTCATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCt < 1:1501387/93‑1 (MQ=255) cGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCt > 1:4490785/1‑93 (MQ=255) cGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCt > 2:2179926/1‑93 (MQ=255) cGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCt < 1:6027584/93‑1 (MQ=255) gTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTg < 1:4874742/93‑1 (MQ=255) gTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTg < 1:4094425/93‑1 (MQ=255) gTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTg > 1:5939252/1‑93 (MQ=255) gTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTg > 2:143222/1‑93 (MQ=255) tACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTgg > 2:6008683/1‑93 (MQ=255) aCCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGc > 2:5619485/1‑93 (MQ=255) aCCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGc > 2:857683/1‑93 (MQ=255) aCCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGc < 1:2205850/93‑1 (MQ=255) ccTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCt < 2:1915973/93‑1 (MQ=255) cttcttCCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCtt < 1:3153147/93‑1 (MQ=255) ttcttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTc > 2:336346/1‑93 (MQ=255) ttcttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTc > 1:2601923/1‑93 (MQ=255) ttcttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTc > 2:6041211/1‑93 (MQ=255) tcttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAACACCCCTGGCTTCg > 2:4019390/1‑93 (MQ=255) tcttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCg > 2:2718650/1‑93 (MQ=255) cttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCgg > 1:2005587/1‑93 (MQ=255) cttcCGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCgg > 2:1341950/1‑93 (MQ=255) cGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCa < 2:3483993/93‑1 (MQ=255) cGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCa < 1:1742121/93‑1 (MQ=255) cGTGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCa > 2:3331777/1‑93 (MQ=255) tGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACg > 2:2972602/1‑93 (MQ=255) tGGCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACg > 2:5429129/1‑93 (MQ=255) ggCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGt < 2:5899119/93‑1 (MQ=255) gCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGtt > 1:3806770/1‑93 (MQ=255) gCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGtt > 2:4735865/1‑93 (MQ=255) gCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGtt < 2:1642027/93‑1 (MQ=255) gCGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGtt < 2:4117524/93‑1 (MQ=255) cGTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTc < 2:2784758/93‑1 (MQ=255) gTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCg > 1:2656204/1‑93 (MQ=255) gTTGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCg > 1:139547/1‑93 (MQ=255) ttGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCgg > 1:4205918/1‑93 (MQ=255) ttGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCgg > 2:4559442/1‑93 (MQ=255) tGATATTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGc < 1:1140357/93‑1 (MQ=255) tatTAGCCTGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACt > 1:5635520/1‑93 (MQ=255) tatTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACt > 2:728791/1‑93 (MQ=255) tatTAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACt < 1:1200181/93‑1 (MQ=255) tAGCCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGaa < 2:2907991/93‑1 (MQ=255) | TGAAGTGGTACAGGTCGGCACACCGGATGAAATTCTCAATAATCCGGCGAATGATTATGTCCGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATTAGTCAGGTATTCAGTGCGAAAGATATTGCCCGCCGGACACCGAATGGCTTAATTCGTAAAACCCCTGGCTTCGGCCCACGTTCGGCACTGAA > NC_000913/2803558‑2803737 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |