Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 502,653 | C→T | intergenic (‑191/+47) | ybaL ← / ← fsr | putative transport protein/fosmidomycin resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 502,653 | 0 | C | T | 99.5% | 765.9 / NA | 209 | intergenic (‑191/+47) | ybaL/fsr | putative transport protein/fosmidomycin resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (103/105); total (104/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
ATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGCGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATC > NC_000913/502563‑502742 | attattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGa > 2:5153533/1‑93 (MQ=255) tattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACt > 2:8333/1‑93 (MQ=255) tattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACt > 2:3089026/1‑93 (MQ=255) tattGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACt > 2:3666375/1‑93 (MQ=255) ttGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGt < 1:4927760/93‑1 (MQ=255) ttGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGt > 1:1508495/1‑93 (MQ=255) tGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGACGAAAGGCTTATGGTGACTGTa < 1:4012893/93‑1 (MQ=255) aaTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaa > 2:433165/1‑93 (MQ=255) aTTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTaaaa > 2:354652/1‑93 (MQ=255) ttttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTATAAAAc < 1:4304146/93‑1 (MQ=255) tttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCGAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACg > 1:237333/1‑93 (MQ=255) ttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGa > 1:2293092/1‑93 (MQ=255) ttGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTCTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGa > 2:2951045/1‑93 (MQ=255) gAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAg > 1:4650127/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGcc > 2:5776156/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGcc < 2:946/93‑1 (MQ=255) aaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCa > 1:1175337/1‑93 (MQ=255) aaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCa > 2:4792189/1‑93 (MQ=255) aaaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCa > 1:1407978/1‑93 (MQ=255) aaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaa > 2:505352/1‑93 (MQ=255) aaTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaa > 2:2583087/1‑93 (MQ=255) aTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaaa > 1:3130327/1‑93 (MQ=255) aTGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCaaa > 1:3008115/1‑93 (MQ=255) tGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAg > 2:1652679/1‑93 (MQ=255) gAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGtt < 2:390481/93‑1 (MQ=255) gAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGtt > 1:4735790/1‑93 (MQ=255) aTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGTAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTg < 1:1521983/93‑1 (MQ=255) aTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTg > 1:2235804/1‑93 (MQ=255) aTTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTg > 1:5570310/1‑93 (MQ=255) gCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCtt < 2:1976518/93‑1 (MQ=255) gCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCtt < 1:708596/93‑1 (MQ=255) gCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCtt > 1:4207821/1‑93 (MQ=255) cTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCttt < 2:4128823/93‑1 (MQ=255) tGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAGAACGATGCAGACAAAGTTTGCCTTTg > 1:3271911/1‑93 (MQ=255) gcaaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGAAGACAAAGTTTGCCTTTGGc > 2:5221495/3‑93 (MQ=255) cAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGc > 1:3857066/1‑93 (MQ=255) cAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGc < 1:5278526/93‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGc < 1:4258448/93‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGc < 2:502316/93‑1 (MQ=255) aaaaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTg > 1:6119523/1‑93 (MQ=255) aaaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCa < 2:2003103/93‑1 (MQ=255) aaaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCaa < 1:3407598/93‑1 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAAt < 1:270207/93‑1 (MQ=255) aaGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAAt > 1:3905845/1‑93 (MQ=255) gCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGa < 1:6070254/93‑1 (MQ=255) gCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGa < 1:897291/93‑1 (MQ=255) cACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaa < 1:635079/93‑1 (MQ=255) cACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaa > 2:3250815/1‑93 (MQ=255) cACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGaa > 2:1385252/1‑93 (MQ=255) cGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAAt < 1:2886197/93‑1 (MQ=255) ggATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATc < 1:2819302/93‑1 (MQ=255) gATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCa < 1:788972/93‑1 (MQ=255) tCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGt > 2:3121072/1‑93 (MQ=255) tCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGt > 1:3719854/1‑93 (MQ=255) ggAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGGAATCAGTCt > 1:406177/1‑93 (MQ=255) ggAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGAGACTGTAAAACGCTGCAGCCAAAGTCTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCt > 2:408993/1‑93 (MQ=255) gAAAACAGAAGGCGGTTTTTCAAAGGAAAAGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGTCTGCAATGAAATCAGTCtt < 2:1090135/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAGCAGAGGAAAGTCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 1:177687/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 2:107733/93‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTa < 2:2166989/93‑1 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTGAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTAt > 2:4659861/1‑93 (MQ=255) aaCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTAt > 2:5134636/1‑93 (MQ=255) aCAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATg > 1:5057211/1‑93 (MQ=255) aGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGcc < 1:1001668/93‑1 (MQ=255) aGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGt > 1:1619140/1‑93 (MQ=255) aGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGt > 2:1204894/1‑93 (MQ=255) ggCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGtt < 2:2802357/93‑1 (MQ=255) cGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTAt < 2:2697574/93‑1 (MQ=255) cGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTAt < 2:5397348/93‑1 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATc > 2:5596086/1‑93 (MQ=255) ggTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATc > 2:1490322/1‑93 (MQ=255) gTTTACCAGAGTAAACGCTGATTGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTGTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca < 1:5517555/93‑1 (MQ=255) gTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGAATGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATca > 2:641085/1‑93 (MQ=255) tttAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcag < 2:5710167/93‑1 (MQ=255) tAACAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggc > 1:3882038/1‑93 (MQ=255) aaCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggca < 2:4243381/93‑1 (MQ=255) aaCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggca > 2:1040538/1‑93 (MQ=255) aCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggcag > 2:3850430/1‑93 (MQ=255) aCAGAGGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATcaggcag < 1:5649583/93‑1 (MQ=255) agagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGa > 2:5479082/1‑93 (MQ=255) agagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGa < 2:3326350/93‑1 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa > 1:2432215/1‑93 (MQ=255) gagGAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGCTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGaa > 1:5421070/1‑93 (MQ=255) ggAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAata < 2:3775063/93‑1 (MQ=255) ggAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAata > 1:2020488/1‑93 (MQ=255) ggAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAata > 2:2517633/1‑93 (MQ=255) gAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAatat < 1:2349859/93‑1 (MQ=255) gAAAGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAatat < 1:2578881/93‑1 (MQ=255) aaaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATg < 1:5752980/93‑1 (MQ=255) aaaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATg < 1:5886899/93‑1 (MQ=255) aaaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATg < 1:653177/93‑1 (MQ=255) aaGGCTTATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCGTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATgg > 2:3422233/1‑93 (MQ=255) ttATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAAc > 2:3372023/1‑93 (MQ=255) tATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGTCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACa < 2:2253796/93‑1 (MQ=255) tATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACa < 1:4404400/93‑1 (MQ=255) tATGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACa > 1:5566998/1‑93 (MQ=255) aTGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACac > 2:3764776/1‑92 (MQ=255) tGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATc < 2:195904/93‑1 (MQ=255) tGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATc > 2:5187733/1‑93 (MQ=255) tGGTGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATc > 1:1277468/1‑93 (MQ=255) | ATTATTGAATTTTGCAGAAAAATGGAATTAGCTGCAAAAAAAGCACGGATCGGAAAACAGAAGGCGGTTTAACAGAGGAAAGGCTTATGGCGACTGTAAAACGATGCAGCCAAAGTTTGCCTTTGGCTGCAATGAAATCAGTCTTTATGCCGGTTATCAGGCAGGAATATGGTCAACATC > NC_000913/502563‑502742 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |