Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 34,711 | A→G | intergenic (+16/+70) | caiF → / ← caiE | transcriptional regulator of cai operon/CaiE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 34,711 | 0 | A | G | 96.7% | 814.8 / 9.8 | 239 | intergenic (+16/+70) | caiF/caiE | transcriptional regulator of cai operon/CaiE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/3); new base G (123/108); total (128/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
CCTGCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATACCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTCACAT > NC_000913/34621‑34800 | cTGCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGTGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCg < 2:4427885/93‑1 (MQ=255) cTGCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCg < 2:5976656/93‑1 (MQ=255) tGCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCgg > 1:641789/1‑93 (MQ=255) tGCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCgg < 2:1222132/93‑1 (MQ=255) gCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCggg > 1:561511/1‑93 (MQ=255) gCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCggg < 2:5269883/93‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGc < 2:3499037/93‑1 (MQ=255) cGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCg > 2:1253479/1‑93 (MQ=255) gTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGt > 2:5733316/1‑93 (MQ=255) gTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGt > 2:4264692/1‑93 (MQ=255) ttCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTc > 1:1684261/1‑93 (MQ=255) cTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATGTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCt < 1:2620479/93‑1 (MQ=255) cTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCt < 1:84801/93‑1 (MQ=255) tCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCtt > 2:1383910/1‑93 (MQ=255) cACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTg > 2:1072/1‑93 (MQ=255) aCGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGc > 1:3099147/1‑93 (MQ=255) ggAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCa > 2:437706/1‑93 (MQ=255) ggAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCa < 1:4840477/93‑1 (MQ=255) gAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAg > 2:4011599/1‑93 (MQ=255) aaCTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGa < 2:3471757/93‑1 (MQ=255) aaCTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGa > 2:6147988/1‑93 (MQ=255) aaCTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGa < 1:1275611/93‑1 (MQ=255) aaCTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGa < 1:1009732/93‑1 (MQ=255) aCTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGAt < 2:4880397/93‑1 (MQ=255) cTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATg < 2:903766/93‑1 (MQ=255) cTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATg < 1:1728184/93‑1 (MQ=255) ttAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGc > 2:2318403/1‑93 (MQ=255) ttAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGc < 1:6072369/93‑1 (MQ=255) aaCCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGa < 1:1894042/93‑1 (MQ=255) aaCCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGa < 1:521641/93‑1 (MQ=255) ccGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtg < 2:4975073/93‑1 (MQ=255) acgcgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtg < 2:2666635/92‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgt < 2:2486167/93‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgt > 2:4085769/1‑93 (MQ=255) cgcgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATACCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgt < 1:2011850/93‑1 (MQ=255) gcgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgtt < 1:3373596/93‑1 (MQ=255) gcgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgtt > 2:155674/1‑93 (MQ=255) cgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgttg < 1:2819031/93‑1 (MQ=255) cgAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgttg < 2:1494451/93‑1 (MQ=255) gAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGAtgttgt > 1:5947674/1‑93 (MQ=255) gAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCCGATGCGATGTTGTAGCAt > 2:2986463/1‑93 (MQ=255) gAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCAt > 2:4068541/1‑93 (MQ=255) aGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCt > 1:2368187/1‑93 (MQ=255) tGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTa < 2:3413196/93‑1 (MQ=255) tGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTa < 1:4942083/93‑1 (MQ=255) tGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTa < 2:1033768/93‑1 (MQ=255) ggCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTAt < 2:2965729/93‑1 (MQ=255) gCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATc > 1:1074663/1‑93 (MQ=255) gCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATc > 2:5038289/1‑93 (MQ=255) agagGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCa < 2:1706245/93‑1 (MQ=255) aGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCa < 1:3567164/93‑1 (MQ=255) atgatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGc < 1:2710793/93‑1 (MQ=255) atgatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGc < 1:2158003/93‑1 (MQ=255) atgatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGc > 2:2262561/1‑93 (MQ=255) atgatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGc < 1:5060949/93‑1 (MQ=255) tgatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCa < 1:2590043/93‑1 (MQ=255) gatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCaa < 2:1320981/93‑1 (MQ=255) gatgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCaa > 1:2765287/1‑93 (MQ=255) atgTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGAGGCCGGGCGGCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAAc < 2:1993491/93‑1 (MQ=255) tgttgtCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAAcc < 2:5962173/93‑1 (MQ=255) tgttgtCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAAcc > 2:5412548/1‑93 (MQ=255) gttgtCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTTATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCa < 1:5577895/93‑1 (MQ=255) ttgtCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAg < 1:3504998/93‑1 (MQ=255) tgtCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAgg < 2:285256/93‑1 (MQ=255) tCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTc > 1:3828970/1‑93 (MQ=255) tCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTc > 2:768159/1‑93 (MQ=255) tCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTc > 1:910443/1‑93 (MQ=255) cAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCg > 1:3843737/1‑93 (MQ=255) aaaGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCga > 2:1437202/1‑92 (MQ=255) aaaGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGc > 2:2622329/1‑93 (MQ=255) aaaGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGc > 1:4242914/1‑93 (MQ=255) aaGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCa > 2:3184313/1‑93 (MQ=255) aaGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCa < 1:5714636/93‑1 (MQ=255) aaGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCa > 1:3990553/1‑93 (MQ=255) agagTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCACAt < 2:129750/93‑1 (MQ=255) gTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCg > 2:5561215/1‑93 (MQ=255) tATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCgg > 2:2541883/1‑93 (MQ=255) tATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCgg > 2:3618916/1‑93 (MQ=255) aTGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGc > 1:4615600/1‑93 (MQ=255) gCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCaa > 1:1466997/1‑93 (MQ=255) tcgtTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGAt > 2:2831693/1‑93 (MQ=255) cgtTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATc > 2:5190245/1‑93 (MQ=255) gtTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCa < 2:2234425/93‑1 (MQ=255) gtTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCa > 2:4570225/1‑93 (MQ=255) gtTAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGATTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGCTCa > 1:4366044/1‑93 (MQ=255) ttAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCAc > 1:464215/1‑93 (MQ=255) tAATTTTATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCAcc > 1:3024585/1‑93 (MQ=255) ttttATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTTCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGtt > 1:3462969/1‑93 (MQ=255) ttttATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGtt > 2:1143758/1‑93 (MQ=255) tATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAg > 1:2463971/1‑93 (MQ=255) tATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAg > 1:3308736/1‑93 (MQ=255) tATCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAg > 1:1398933/1‑93 (MQ=255) aTCTCGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAgg < 1:329009/93‑1 (MQ=255) tctcGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGc > 1:5333954/1‑93 (MQ=255) cGTTGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTCGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTc > 1:626155/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTcac > 2:2052847/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTcac < 2:65428/93‑1 (MQ=255) gATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTCACAt > 2:5105502/1‑93 (MQ=255) gATGCCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTCACAt < 1:3724621/93‑1 (MQ=255) gATACCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTCACAt > 2:5006327/1‑93 (MQ=255) | CCTGCCGTTCCGCTCACGGAACTTAACCGCGAGCAGAAGTGGCAGATGATGTTGTCAAAGAGTATGCGTCGTTAATTTTATCTCGTTGATACCGGGCGTCCTGCTTGCCAGATGCGATGTTGTAGCATCTTATCCAGCAACCAGGTCGCATCCGGCAAGATCACCGTTTAGGCGTCACAT > NC_000913/34621‑34800 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |