Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,889,728 | C→T | A162V (GCG→GTG) | yidY → | putative transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,889,728 | 0 | C | T | 91.3% | 691.5 / 37.7 | 229 | A162V (GCG→GTG) | yidY | putative transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/12); new base T (114/95); total (122/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.40e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TCAACGGTATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCGGATAAAC > NC_000913/3889638‑3889817 | tCAACGGTATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGAGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGa > 1:5824028/1‑93 (MQ=255) cAACGGTATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGAt > 1:2059806/1‑93 (MQ=255) aCGGTATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATgg > 2:2028747/1‑93 (MQ=255) gTATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCaa < 1:3471835/93‑1 (MQ=255) tATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAat > 1:4487751/1‑93 (MQ=255) tATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAat < 1:3376972/93‑1 (MQ=255) tATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAat < 1:4629491/93‑1 (MQ=255) aTTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatg > 2:662555/1‑93 (MQ=255) aTTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatg > 1:1495155/1‑93 (MQ=255) ttcccTGCATCATTCCGGTGTTAGCGTGAGTGCTCCGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCACCGTCTGTTCTGTGCGATGGCAatga < 1:2586199/90‑1 (MQ=255) ttACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatga < 1:1817308/93‑1 (MQ=255) ttACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatga < 2:5644038/93‑1 (MQ=255) ttACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatga < 2:2841822/93‑1 (MQ=255) ttACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatga > 2:1682529/1‑93 (MQ=255) aCCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAatgatg > 2:5240893/1‑93 (MQ=255) cTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATggg < 1:4756070/93‑1 (MQ=255) tGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGc < 1:4441904/93‑1 (MQ=255) tGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGc > 2:458770/1‑93 (MQ=255) atcatTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATc < 2:2501017/93‑1 (MQ=255) tcatTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATcg > 1:3104018/1‑93 (MQ=255) atTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATcgcg > 1:4858862/1‑93 (MQ=255) tCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGt < 1:5412251/93‑1 (MQ=255) ccGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTa > 1:3818674/1‑93 (MQ=255) cGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTAc > 2:2189932/1‑93 (MQ=255) gtgtTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTg > 2:4429792/1‑93 (MQ=255) gtgtTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTg < 1:5209711/93‑1 (MQ=255) gtTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGAt < 1:3582294/93‑1 (MQ=255) ttAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGAtg < 2:5071415/93‑1 (MQ=255) ttAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGAtg > 2:6022285/1‑93 (MQ=255) aGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGAtgtt > 2:3467667/1‑93 (MQ=255) cgcCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGAtgttgt > 2:2447320/1‑93 (MQ=255) gcCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGAtgttgtt > 2:5800498/1‑92 (MQ=255) gcCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTc > 1:6087654/1‑93 (MQ=255) ccAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCt > 2:3545711/1‑93 (MQ=255) aGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCttt < 2:1307808/93‑1 (MQ=255) gCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGtt < 2:1384366/93‑1 (MQ=255) cTCGGACATCTGGTTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGttt > 1:2468771/1‑93 (MQ=255) tCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTa < 1:3920649/93‑1 (MQ=255) tCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTa < 2:1640900/93‑1 (MQ=255) tCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTa < 2:2120929/93‑1 (MQ=255) cGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTAt < 2:4111138/93‑1 (MQ=255) ggACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTAtt < 2:4841682/93‑1 (MQ=255) ggACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTAtt > 1:3880721/1‑93 (MQ=255) ggACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTAtt > 1:1147708/1‑93 (MQ=255) gACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTAttt > 1:2480811/1‑93 (MQ=255) aCATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTAtttt < 2:193409/93‑1 (MQ=255) cATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTa > 1:2135901/1‑93 (MQ=255) aTCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaa > 1:125214/1‑93 (MQ=255) aTCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaa > 1:1393423/1‑93 (MQ=255) aTCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaa < 1:3705089/93‑1 (MQ=255) aTCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaa > 2:3634175/1‑93 (MQ=255) aTCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaa > 1:2719476/1‑93 (MQ=255) aTCTGAGTATGCTTAAATTCCCGGGGCATAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaa < 1:498981/93‑1 (MQ=255) tCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaaa < 2:587647/93‑1 (MQ=255) tCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaaa > 2:1782665/1‑93 (MQ=255) tCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaaa < 2:5563200/93‑1 (MQ=255) cTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaaaa < 1:5320136/93‑1 (MQ=255) cTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaaaa < 1:5718807/93‑1 (MQ=255) tGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTaaaaa > 2:1984418/1‑92 (MQ=255) tGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAg < 2:1125482/93‑1 (MQ=255) gATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGa < 2:5430885/93‑1 (MQ=255) gATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGa < 2:783245/93‑1 (MQ=255) gATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGa < 1:577456/93‑1 (MQ=255) aTTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGaa < 1:1247017/93‑1 (MQ=255) aTTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGACTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGaa > 2:3115424/1‑93 (MQ=255) ttATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGaaa < 1:1927862/93‑1 (MQ=255) tATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAc < 2:2621422/93‑1 (MQ=255) tATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAc < 2:3751390/93‑1 (MQ=255) aTGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGGTGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGaaaag > 1:119192/1‑91 (MQ=255) aTGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAcg < 1:4093148/93‑1 (MQ=255) tGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGGTGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAcgc > 2:3344376/1‑93 (MQ=255) tGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAcgc < 1:1388757/93‑1 (MQ=255) tGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAcgc < 2:5785761/93‑1 (MQ=255) tGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAAcgc < 1:5583133/93‑1 (MQ=255) cTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACgcgc > 2:5325612/1‑93 (MQ=255) ttAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGcc > 1:2917452/1‑93 (MQ=255) ttAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGcc > 2:3894349/1‑93 (MQ=255) tAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGccc > 1:3211574/1‑93 (MQ=255) 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gCAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGc < 1:6136753/93‑1 (MQ=255) cAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCa < 1:4146980/93‑1 (MQ=255) cAGAGTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCa > 2:1430030/1‑93 (MQ=255) gagTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGc < 1:1741899/93‑1 (MQ=255) gTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCtt > 2:3210844/1‑93 (MQ=255) gTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCtt > 2:5143191/1‑93 (MQ=255) gTCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCtt > 1:2238606/1‑93 (MQ=255) tCTGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTc < 2:5364265/93‑1 (MQ=255) tGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCgg < 2:3578720/93‑1 (MQ=255) tGTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCgg > 1:284022/1‑93 (MQ=255) gTTCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCGGa > 1:633875/1‑93 (MQ=255) tCTGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCGGATa > 2:2965059/1‑93 (MQ=255) tGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCGGATaac > 2:3071862/1‑92 (MQ=255) tGGGTGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCGGATaaa > 2:4356439/1‑93 (MQ=255) | TCAACGGTATTACCTGCATCATTCCGGTGTTAGCGCCAGTGCTCGGACATCTGATTATGCTTAAATTCCCGTGGCAGAGTCTGTTCTGGGCGATGGCAATGATGGGCATCGCGGTACTGATGTTGTCTTTGTTTATTTTAAAAGAAACGCGCCCAGCGGCCCCCGCAGCTTCGGATAAAC > NC_000913/3889638‑3889817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |